2016年-2017年四川省部分地區(qū)豬繁殖與呼吸綜合征病毒的分子流行病學(xué)調(diào)查
本文選題:豬繁殖與呼吸綜合征病毒 + GP; 參考:《動物醫(yī)學(xué)進展》2017年12期
【摘要】:為了解近年來四川省豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)流行毒株的遺傳變異和分子流行病學(xué)情況,通過RT-PCR方法,對四川省各地疑似病料進行PRRSV檢測,確定獲得陽性樣本基因型和對GP5基因遺傳進化進行分析。結(jié)果顯示,149份疑似病料中經(jīng)ORF7片段檢測33份為陽性,陽性率為22.15%(95%CI:15.8%~29.7%);通過對NSP2片段的檢測,其中有9份為PRRSV高致病性毒株(HP-PRRSV),5份為PRRSV經(jīng)典毒株,8份為PRRSV NADC-30樣毒株;通過對GP5基因進行擴增和序列測定,得到11株部分的GP5基因序列數(shù)據(jù),所獲序列與已報道對應(yīng)核苷酸序列同源性為60.4%~99.8%,推導(dǎo)的氨基酸序列的同源性為74.3%~100%。結(jié)果表明,近兩年四川地區(qū)PRRSV主要流行毒株為HP-PRRSV,同時新的變異毒株NADC30的流行呈上升趨勢。四川地區(qū)乃至國內(nèi)各地區(qū)的PRRSV基因在逐漸變異,且毒株的流行趨勢在轉(zhuǎn)變,提示應(yīng)加強對PRRSV流行及變異的監(jiān)測。
[Abstract]:In order to understand the genetic variation and molecular epidemiology of porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSVV) epidemic strains in Sichuan Province in recent years, PRRSV was used to detect suspected samples from different parts of Sichuan province by RT-PCR method. To determine the genotypes of positive samples and to analyze the genetic evolution of GP5 gene. The results showed that 33 of 149 suspected samples were positive by ORF7 fragment, the positive rate was 22.15% and 95% CI: 15.8% and 29.775%, 9 of them were PRRSV high pathogenic virus strain HP-PRRSVV, 5 were PRRSV classical virus strains, 8 were PRRSV NADC-30 strains. By amplifying and sequencing the GP5 gene, the partial GP5 gene sequence data of 11 strains were obtained. The homology of the obtained sequence with the reported nucleotide sequence was 60.4 and 99.8, and the deduced amino acid sequence was 74.3100. The results showed that HP-PRRSVV was the main epidemic strain of PRRSV in Sichuan in recent two years, and the prevalence of new variant strain NADC30 was on the rise. The PRRSV gene is mutating gradually and the epidemic trend of the virus strain is changing in Sichuan area and even in China. It is suggested that the surveillance of PRRSV epidemic and variation should be strengthened.
【作者單位】: 西南民族大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;云南農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院;國家民族事務(wù)委員會青藏高原動物疫病防控創(chuàng)新團隊;
【基金】:“十三五”國家重點研發(fā)計劃項目(2016YFD0500705) 西南民族大學(xué)研究生創(chuàng)新科研項目(CX2017SZ052)
【分類號】:S852.651
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,本文編號:1928204
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