獸醫(yī)領(lǐng)域病毒宏基因組非序列依賴性單引物擴增方法的研究現(xiàn)狀
本文選題:病毒 + 宏基因組。 參考:《中國家禽》2017年12期
【摘要】:新一代測序技術(shù)的出現(xiàn)和不斷完善,極大地推動了宏基因組學(xué)的發(fā)展。宏基因組學(xué)研究的路線主要包括核酸樣本制備、高通量測序及生物信息學(xué)分析,而核酸樣本的質(zhì)量直接影響后續(xù)環(huán)節(jié)。目前有多種方法可以用于低濃度樣本的擴增,其中非序列依賴性單引物擴增(SISPA)法因其經(jīng)濟高效性,越來越受到研究者的青睞。文章就獸醫(yī)領(lǐng)域病毒宏基因組學(xué)研究過程中廣泛使用的相關(guān)SISPA方法進行概述,包括核酸樣本的預(yù)處理及擴增方案等,為相關(guān)研究提供參考。
[Abstract]:The emergence and improvement of new generation sequencing technology has greatly promoted the development of macrogenomics. The research route of macrogenomics mainly includes nucleic acid sample preparation, high-throughput sequencing and bioinformatics analysis, and the quality of nucleic acid sample directly affects the follow-up link. At present, there are many methods that can be used in the amplification of low concentration samples, among which the non-sequence-dependent single-primer amplification (SISPA) method is more and more popular because of its high economic efficiency. In this paper, the methods of SISPA, including the pretreatment and amplification of nucleic acid samples, which are widely used in the study of virus macrogenomics in veterinary field, are reviewed.
【作者單位】: 揚州大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院;揚州出入境檢驗檢疫局;江蘇省動物重要疫病與人獸共患病協(xié)同創(chuàng)新中心;
【基金】:國家重點研發(fā)計劃項目(2016YFD0500202-1) 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項資金(nycytx-41-G07) 江蘇高校優(yōu)勢學(xué)科建設(shè)工程資助項目
【分類號】:S852.65
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,本文編號:1904725
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