本文選題：禽白血病病毒 + gp基因��； 參考：《中國家禽》2017年12期

【摘要】：為了解禽白血病病毒(ALV)gp85基因的特點,采用Primer Premier 5.0設(shè)計一對特異性引物,對gp85基因進行擴增、克隆及序列測定,用相關(guān)生物學(xué)軟件對貴州流行株gp85基因進行序列分析,并對其編碼蛋白進行二級結(jié)構(gòu)、B細胞表位、保守結(jié)構(gòu)域、跨膜結(jié)構(gòu)域和信號肽預(yù)測。測序獲得921 bp長的序列,將此流行株命名為ALV-GZ-16。分析發(fā)現(xiàn),流行株ALV-GZ-16的gp85基因核苷酸序列與J亞群中國分離毒株的gp85基因序列同源性為97.5%~99.9%,其編碼的氨基酸序列與J亞群中國分離毒株的同源性為96.8%~99.7%;系統(tǒng)進化分析顯示,該流行株與J亞群原型毒株處于同一分支,與貴州分離株GZN49處于同一小分支;其二級結(jié)構(gòu)中無規(guī)則卷曲和β-折疊所占比例較大;預(yù)測此蛋白存在4個B細胞優(yōu)勢抗原表位,無跨膜結(jié)構(gòu)和信號肽區(qū)域。研究結(jié)果進一步完善了貴州省禽白血病病毒流行株的生物學(xué)特性,為gp85蛋白特異性抗體的制備提供一定的理論基礎(chǔ)。
[Abstract]:In order to understand the characteristics of ALV gp85 gene of avian leukemia virus, a pair of specific primers were designed by Primer Premier 5.0 to amplify, clone and sequence the gp85 gene. The gp85 gene of Guizhou epidemic strain was sequenced by using relevant biological software. B cell epitopes, conserved domains, transmembrane domains and signal peptides were predicted. The 921 BP long sequence was obtained by sequencing, and the popular strain was named ALV-GZ-16. It was found that the nucleotide sequence of gp85 gene of epidemic strain ALV-GZ-16 and the sequence of gp85 gene of subgroup J Chinese isolate were 97.559% and 99.9%, respectively, and the amino acid sequence encoded by them was 96.889% and 99.7% respectively, and the phylogenetic analysis showed that the nucleotide sequence of gp85 gene of epidemic strain ALV-GZ-16 was 97.8% and 99.7% of that of Chinese isolate strain of subgroup J, respectively. The epidemic strain was in the same branch as the prototype strain of subgroup J, and was in the same branch as the Guizhou isolate GZN49, and had a large proportion of irregular curl and 尾 -folding in its secondary structure, and predicted the existence of 4 B cell dominant antigen epitopes. No transmembrane structure and signal peptide region. The results further improved the biological characteristics of avian leukemia virus epidemic strains in Guizhou province and provided a theoretical basis for the preparation of specific antibodies against gp85 protein.
【作者單位】： 貴州大學(xué)動物科學(xué)學(xué)院;貴州省動物疫病與獸醫(yī)公共衛(wèi)生重點實驗室;貴州大學(xué)大數(shù)據(jù)與信息工程學(xué)院;
【基金】：貴州省科技廳、貴州大學(xué)聯(lián)合資金計劃(黔科合LH字[2014]7666) 國家自然科學(xué)基金(國科金計項[2014]44號) 貴州大學(xué)博士基金(貴大人基合字[2013]12號)
【分類號】：S852.65

【參考文獻】

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本文編號：1861657