SU6656對雞傳染性喉氣管炎病毒與宿主細胞互作分子網(wǎng)絡的影響
本文選題:傳染性喉氣管炎病毒 + RNA-seq; 參考:《中國預防獸醫(yī)學報》2017年08期
【摘要】:為探索SU6656對雞傳染性喉氣管炎病毒(ILTV)感染的影響及調(diào)控機制,本研究應用雞LMH細胞系感染ILTV LJS09株作為實驗模型,測定了SU6656對ILTV增殖和毒力的影響,通過高通量RNA測序技術(RNA-Seq)在全基因組范圍內(nèi)檢測宿主細胞基因轉(zhuǎn)錄譜表達,并利用熒光定量PCR對部分差異表達基因進行驗證。進一步的GO功能分析顯示,在宿主細胞應答ILTV感染過程中,SU6656所調(diào)控基因主要涉及氫離子跨膜運輸、輔酶Q的結(jié)合、Fe~(2+)和S~(2+)聚集等功能。KEGG通路分析表明,氧化磷酸化通路在SU6656調(diào)控ILTV感染的過程中可能發(fā)揮重要作用。本研究為進一步解析ILTV感染及致病機制提供了重要依據(jù)。
[Abstract]:In order to explore the effect of SU6656 on the infection of chicken infectious laryngotracheitis virus (ILTVV) and its regulatory mechanism, the effect of SU6656 on the proliferation and virulence of ILTV was determined by using chicken LMH cell line infected with ILTV LJS09 as the experimental model. High throughput RNA sequencing technique was used to detect the transcription profile of host cell genes in the whole genome, and some differentially expressed genes were verified by fluorescence quantitative PCR. Further go functional analysis showed that the genes regulated by SU6656 were mainly involved in the transmembrane transport of hydrogen ions, the binding of coenzyme Q to Fean2) and the aggregation of coenzyme Q). KEGG pathway analysis showed that, in the course of host cell response to ILTV infection, KEGG pathway analysis showed that Oxidative phosphorylation pathway may play an important role in the regulation of ILTV infection by SU6656. This study provides an important basis for further analysis of ILTV infection and pathogenesis.
【作者單位】: 黑龍江八一農(nóng)墾大學動物科技學院;中國農(nóng)業(yè)科學院哈爾濱獸醫(yī)研究所獸醫(yī)生物技術國家重點實驗室/禽呼吸道傳染病創(chuàng)新團隊;
【基金】:現(xiàn)代農(nóng)業(yè)蛋雞產(chǎn)業(yè)技術體系項目(CARS-41-K12) 國家科技支撐計劃項目(2015BAD12B03)
【分類號】:S852.65
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本文編號:1796006
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