發(fā)布時間：2018-04-06 02:31

  本文選題：RING指環(huán)　切入點：版納微型豬近交系　出處：《東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報》2017年03期

【摘要】：RNF4基因調(diào)節(jié)精細(xì)胞分化和增殖過程,文章以Gen Bank下載的豬及近緣物種RNF4 mRNA序列為參考序列,設(shè)計特異引物擴增版納微型豬近交系(BMI)RNF4基因。應(yīng)用qPCR分析15個重要組織mRNA表達(dá)譜,并對蛋白質(zhì)序列作功能生物信息學(xué)分析,構(gòu)建多物種系統(tǒng)進化樹。研究獲得BMI RNF4 573 bp編碼區(qū)序列(Gen Bank登錄號:KU705638,對應(yīng)氨基酸登錄號:AOC89056),編碼190個氨基酸,蛋白質(zhì)分子質(zhì)量(Mw)為21.43 ku,等電點(pI)為6.95。多組織熒光定量表達(dá)分析表明RNF4基因在尿道球腺、睪丸、肝、肺中高水平表達(dá);在其他11個組織中呈中低水平表達(dá)。功能生物信息學(xué)分析表明RNF4蛋白質(zhì)存在1個保守結(jié)構(gòu)域,無跨膜結(jié)構(gòu),無信號肽序列;N末端疏水,C末端疏水;有4類功能活性位點,位于細(xì)胞核概率為94.1%。系統(tǒng)進化分析表明,BMI與狗親緣關(guān)系最近。結(jié)果為研究RNF4基因在豬精細(xì)胞分化和增殖方面作用奠定基礎(chǔ)。
[Abstract]:RNF4 gene regulates the process of spermatocyte differentiation and proliferation. A specific primer was designed to amplify the BMI-RNF4 gene of Banna miniature pig inbred line, using the RNF4 mRNA sequence downloaded by Gen Bank as the reference sequence.QPCR was used to analyze mRNA expression profiles of 15 important tissues and functional bioinformatics was used to analyze protein sequences to construct phylogenetic tree of multiple species.The sequence of BMI RNF4 573bp coding region was obtained. The accession number of GenGen Bank was: KU705638, the corresponding amino acid login number was: AOC8905656, encoding 190 amino acids, the molecular weight of protein was 21.43 ku. the isoelectric point (Pi) was 6.95.Fluorescence quantitative analysis showed that the expression of RNF4 gene was high in urethral glandular gland, testis, liver and lung, and low in other 11 tissues.Functional bioinformatics analysis showed that RNF4 protein had a conserved domain, no transmembrane structure and no signal peptide sequence.Phylogenetic analysis showed that BMI had the closest relationship with dogs.Results the results laid a foundation for the study of the role of RNF4 gene in the differentiation and proliferation of porcine spermatocytes.
【作者單位】： 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)云南省版納微型豬近交系重點實驗室;云南農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項目(31660637,31460580,31660650)
【分類號】：S828

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