版納微型豬近交系細胞色素P450家族基因CYP1A1克隆及生物信息學分析
本文選題:細胞色素P家族 切入點:CYPA基因 出處:《云南農(nóng)業(yè)大學學報(自然科學)》2017年03期
【摘要】:【目的】克隆版納微型豬近交系(Banna mini-pig inbred line,BMI)細胞色素P450家族基因CYP1A1的編碼區(qū)序列,并對其進行生物信息學分析!痉椒ā坷肦T-PCR方法獲得CYP1A1基因的全長CDS序列,運用生物信息學對其核酸及蛋白序列進行分析,構建系統(tǒng)進化樹。【結果】獲得的BMI CYP1A1 CDS長度為1551 bp,編碼516個氨基酸,蛋白質分子量為58.39 ku,等電點為7.83,位于內(nèi)質網(wǎng)的概率是94.1%。CYP1A1蛋白質含有1個細胞色素P450半胱氨酸血紅素配體位點,1個N-豆蔻;稽c,1個酰胺化作用位點,2個N-糖基化位點、6個蛋白酶C磷酸化位點和5個蛋白激酶Ⅱ磷酸化位點。11個物種構建的系統(tǒng)進化分析表明,BMI(豬)CYP1A1與牛和山羊的關系最近。【結論】以上結果將為進一步研究版納微型豬近交系CYP1A1基因功能奠定基礎。
[Abstract]:[objective] to clone the coding region of cytochrome P450 family CYP1A1 of Banna mini-pig inbred lineage, Banna micropig inbred line, and analyze it by bioinformatics. [methods] the full-length CDS sequence of CYP1A1 gene was obtained by RT-PCR method. The nucleic acid and protein sequences were analyzed by bioinformatics, and the phylogenetic tree was constructed. The length of BMI CYP1A1 CDS was 1551 BP, encoding 516 amino acids. The molecular weight of the protein is 58.39 kuand the isoelectric point is 7.83. The probability of the protein being located in the endoplasmic reticulum is that the 94.1%.CYP1A1 protein contains one cytochrome P450 cysteine heme ligand site, one N-nutmeg acylation site, one amidation site, two N-glycosyl sites. The phylogenetic analysis of 11 species constructed indicates that the relationship between BMI-CYP1A1 and cattle and goat is the most recent. [conclusion] the above results will be further studied. The function of CYP1A1 gene of Banna miniature pig inbred line was established.
【作者單位】: 云南農(nóng)業(yè)大學云南省版納微型豬近交系重點實驗室;云南農(nóng)業(yè)大學動物科學技術學院;
【基金】:國家自然科學基金項目(31660637,31460580,31660650)
【分類號】:S828.2
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