鵝線粒體COⅠ條形碼及上游tRNA序列測(cè)定分析
發(fā)布時(shí)間:2018-03-26 19:37
本文選題:鵝 切入點(diǎn):基因條形碼 出處:《浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào)》2017年01期
【摘要】:為探索有效識(shí)別家禽(鵝)品種的線粒體DNA條形碼,以對(duì)家禽品種或禽源產(chǎn)品進(jìn)行鑒別,文章以鴻雁、灰雁、6個(gè)地方鵝種(中國(guó)、歐洲各3個(gè))為試驗(yàn)群體,利用直接測(cè)序技術(shù)對(duì)所有個(gè)體的線粒體細(xì)胞色素C氧化酶亞基Ⅰ基因(COⅠ)進(jìn)行測(cè)序,并分析多態(tài)性以及分子系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系,同時(shí)對(duì)該區(qū)域上游tRNA的序列進(jìn)行分析。結(jié)果表明,COⅠ該段序列(1 551 bp)共存在17個(gè)突變位點(diǎn),形成20種單倍型,其中18種為各群體特有,可以作為群體鑒定的依據(jù);除卡洛斯鵝外,其余7個(gè)群體中均發(fā)現(xiàn)有特異變異位點(diǎn)。基于Kiumura雙參數(shù)距離所構(gòu)建的單倍型NJ樹(shù)能夠充分反映不同群體的進(jìn)化的親緣關(guān)系。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)了鴻雁線粒體序列有22種tRNA基因,均為標(biāo)準(zhǔn)4個(gè)恒定臂三葉草結(jié)構(gòu),其中tRNA-Ser和tRNA-Leu各有2個(gè),其余僅有1個(gè)。選取的COⅠ該段序列可以作為部分鵝品種鑒定的依據(jù)。
[Abstract]:In order to explore the mitochondrial DNA barcode for the identification of poultry (goose) breeds and to identify poultry breeds or poultry products, Hongyan, gray goose and 6 local goose breeds (3 in China and 3 in Europe) were used as experimental populations in this paper. The mitochondrial cytochrome C oxidase subunit 鈪,
本文編號(hào):1669323
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