本文選題：斯氏副柔線蟲　切入點(diǎn)：轉(zhuǎn)錄組　出處：《中國獸醫(yī)學(xué)報(bào)》2017年04期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：為了系統(tǒng)了解斯氏副柔線蟲的轉(zhuǎn)錄組特征并構(gòu)建其轉(zhuǎn)錄組圖譜,以不同發(fā)育階段的斯氏副柔線蟲為研究對象,應(yīng)用Illumina Nextseq 500高通量測序技術(shù)平臺對其進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序及生物信息學(xué)分析,結(jié)果每個(gè)樣本均得到3GB的原始數(shù)據(jù),經(jīng)質(zhì)量控制和拼接組裝后,共獲得128 454個(gè)Unigene,序列片段的平均長度與N50值分別為634和1 037bp;將Unigenes與COG,Nr,Trembl等數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對,結(jié)果表明有35 324個(gè)Unigene比對到COG數(shù)據(jù)庫,根據(jù)蛋白種類大致分為25類;通過GO功能分類,5 227個(gè)Unigene映射到GO不同的功能節(jié)點(diǎn)上;通過KEGG pathways分析,共有13 424個(gè)Unigene參與了8 155個(gè)代謝通路。該研究結(jié)果為斯氏副柔線蟲病的基礎(chǔ)理論、診斷方法及防治研究奠定基礎(chǔ)。
[Abstract]:In order to systematically understand the transcriptional characteristics of nematode skrjabini and construct its transcriptional map, we studied the nematodes in different developmental stages. The transcriptome sequencing and bioinformatics analysis were performed on Illumina Nextseq 500 high-throughput sequencing platform. The results showed that 3GB of raw data were obtained from each sample. A total of 128,454 Unigenees were obtained, the average length and N _ (50) of the sequences were 634 and 1 037 BP, respectively. The results showed that 35 324 Unigene were compared to the COG database, which were divided into 25 classes according to the protein types. According to go functional classification, 5227 Unigene were mapped to different functional nodes of go, 13 424 Unigene were involved in 8 155 metabolic pathways by KEGG pathways analysis. The diagnosis method and the prevention and cure research lay the foundation.
【作者單位】： 內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(31260603)
【分類號】：S852.731

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本文編號：1610398