本文關(guān)鍵詞： 雞 matrin 克隆 序列分析　出處：《中國家禽》2017年19期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：根據(jù)GenBank已發(fā)表的雞基質(zhì)蛋白3(matrin 3)基因序列,設(shè)計合成一對特異性引物,以雞胚成纖維細(xì)胞提取的總RNA反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為模板,通過PCR擴(kuò)增雞matrin 3基因并進(jìn)行克隆與生物信息學(xué)分析。測序結(jié)果表明:雞matrin 3基因編碼區(qū)全長為2 709 bp,共編碼902個氨基酸,理論pI為5.79,分子質(zhì)量約為100.71 ku,分子式為C_(4362)H_(6903)N_(1267)O_(1418)S_(29)。序列分析結(jié)果顯示:雞matrin 3蛋白有豐富的二級結(jié)構(gòu),以無規(guī)則卷曲和α-螺旋為主;該蛋白中包含兩個鋅指結(jié)構(gòu)域和兩個RNA識別基序,其中人、小鼠和野豬的4個功能結(jié)構(gòu)域氨基酸位點相同,而在雞matrin 3蛋白中存在多個氨基酸位點變異。核苷酸同源性及遺傳進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn):雞與火雞的matrin 3基因核苷酸同源性最高(為98.0%),并且與火雞的親緣關(guān)系最近。研究結(jié)果為進(jìn)一步研究雞matrin 3蛋白的生物學(xué)功能奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:A pair of specific primers were designed and synthesized according to the published chicken matrix protein 3matrin 3 gene sequence by GenBank. The total RNA reverse transcription product extracted from chicken embryo fibroblasts was used as template. Chicken matrin 3 gene was amplified by PCR, cloned and analyzed by bioinformatics. The result of sequencing showed that the encoding region of chicken matrin 3 gene was 2 709 BP, encoding 902 amino acids. The theoretical Pi is 5.79, the molecular weight is about 100.ku71, and the molecular formula is C# 4362HSP. The protein consists of two zinc finger domains and two RNA recognition motifs. The sequence analysis shows that the chicken matrin 3 protein has abundant secondary structure, mainly composed of irregular curls and 偽 -helix, and contains two zinc finger domains and two RNA recognition motifs, the sequence analysis of which shows that the chicken matrin 3 protein has abundant secondary structure and is characterized by irregular curl and 偽 -helix, and contains two zinc finger domains and two RNA recognition motifs. The amino acid loci of four functional domains of human, mouse and wild boar are the same. The nucleotide homology and genetic evolution analysis showed that the nucleotide homology of matrin 3 gene between chicken and turkey was the highest (98.0%), and the relationship between chicken and turkey was close. The results laid a foundation for further study on the biological function of chicken matrin 3 protein.
【作者單位】： 貴州大學(xué)動物科學(xué)學(xué)院;貴州大學(xué)高原山地動物遺傳育種與繁殖教育部重點實驗室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項目(31502074) 貴州省科學(xué)技術(shù)基金項目(黔科合J字[2015]2054號) 貴州大學(xué)引進(jìn)人才科研項目(貴大人基合字[2014]10號)
【分類號】：S831

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本文編號：1502419