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云南惡性瘧病例瘧原蟲Pfhrp2基因序列多態(tài)性分析

發(fā)布時(shí)間:2017-07-06 14:08

  本文關(guān)鍵詞:云南惡性瘧病例瘧原蟲Pfhrp2基因序列多態(tài)性分析


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【摘要】:目的分析云南省惡性瘧病例瘧原蟲蟲株的富組氨酸蛋白Ⅱ(Histidine-rich protein-2,HRPⅡ)基因(Pfhrp2)序列的多態(tài)性,為研究瘧原蟲抗原基因缺失奠定基礎(chǔ)。方法搜集2012年8月-2015年9月云南省惡性瘧現(xiàn)癥病例的濾紙血樣和相關(guān)信息,用PCR技術(shù)擴(kuò)增血樣中惡性瘧原蟲Pfhrp2基因exon2區(qū)并測(cè)序,測(cè)序成功序列與AY816237、AY816240、AY816301參比序列比對(duì);用Mega 5.04分析Pfhrp2基因exon2區(qū)序列多態(tài)性,計(jì)算序列間保守位點(diǎn)、遺傳距離等;根據(jù)氨基酸序列間遺傳距離繪制聚類樹狀圖。結(jié)果共收集云南省15個(gè)州(市)的惡性瘧現(xiàn)癥病例血樣218份,病例感染來源地包括云南本地、非洲、緬甸等流行區(qū)。其中155份Pfhrp2基因exon2區(qū)擴(kuò)增陽性和測(cè)序成功,編碼氨基酸數(shù)在115~298之間,平均為239.7 aa,非洲(239.9 aa)、緬甸(239.5 aa)、云南(241.6 aa)感染蟲株的氨基酸殘基均數(shù)差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=0.025,P0.05)。所有氨基酸殘基序列均以12型重復(fù)作為結(jié)尾,以1型、2型重復(fù)為起始,比例各占98.1%(152/155)和1.9%(3/155),2型重復(fù)次數(shù)最多,為12.9次。155條Pfhrp2基因exon2區(qū)DNA序列的同源位點(diǎn)為894 bp,保守位點(diǎn)占20.8%(186/894),變異位點(diǎn)占78.2%(699/894),非洲蟲株序列間遺傳距離為0.000~0.741,緬甸為0.000~0.948,云南為0.000~0.750。所有155條序列按氨基酸序列大小聚類成3個(gè)大類,同一個(gè)層級(jí)的序列具有近似的序列長(zhǎng)度和氨基酸重復(fù)類型。結(jié)論云南省惡性瘧現(xiàn)癥病例所感染瘧原蟲的Pfhrp2基因exon2區(qū)存在高度多態(tài)性,惡性瘧原蟲株主要按Pfhrp2基因exon2區(qū)的氨基酸序列長(zhǎng)度進(jìn)行聚類。
【作者單位】: 云南省寄生蟲病防治所、云南省瘧疾研究中心、云南省蟲媒傳染病防控研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;大理大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】惡性瘧 惡性瘧原蟲 富組氨酸蛋白Ⅱ Pfhrp基因 多態(tài) 云南省
【基金】:上海市2015年度“科技創(chuàng)新行動(dòng)計(jì)劃”國內(nèi)合作項(xiàng)目(15495800400)
【分類號(hào)】:R531.3
【正文快照】: 截至2014年云南仍是中國尚未消除惡性瘧的省份[1],亦是全國僅有本地感染病例的兩個(gè)省份之一,2014年,該省的瘧疾病例數(shù)仍占全國瘧疾病例總數(shù)的17.3%(533/3078)[2-3],2015年該省瘧疾病例數(shù)較上一年增加了22.5%。因此,在云南省繼續(xù)落實(shí)媒介控制、傳染源及時(shí)診斷及抗瘧藥敏感性監(jiān)

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):526485

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