本文關(guān)鍵詞：廣西扶綏乙型肝炎病毒Pre-S區(qū)變異與肝癌的關(guān)聯(lián)分析及其參照序列的建立，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的 探討廣西扶綏縣肝癌高發(fā)區(qū)HBV相關(guān)肝癌患者HBV Pre-S區(qū)變異與肝癌發(fā)生的關(guān)系并構(gòu)建扶綏乙型肝炎病毒Pre-S區(qū)參照序列。方法按照病例對(duì)照的方法,采集53例HBV相關(guān)肝癌患者及95例HBV慢性攜帶者的血清,提取DNA后采用巢式PCR法擴(kuò)增Pre-S區(qū),擴(kuò)增獲得的陽性產(chǎn)物純化后進(jìn)行測序并分析。同時(shí)將Pre-S區(qū)序列進(jìn)行多重序列比對(duì),以每個(gè)堿基頻率最高點(diǎn)作為參照序列該位點(diǎn)的堿基,獲得B型和C型的參照序列。結(jié)果1. 肝癌組Pre-S區(qū)缺失率為41.5%(22/53),對(duì)照組缺失率為10.5%(10/95),兩組差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=19.271,P=0.000,OR=6.032)。2. 肝癌組C3026T變異率為52.88%(28/53),對(duì)照組變異率為37.9%(36/95),兩組差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=3.092,P=0.079,0R=1.836)。然而,肝癌組HBV C基因型C3026T變異率為71.8%(28/39),對(duì)照組HBV C基因型變異率為51.4%(36/70),兩組差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=4.186,P=0.041,OR=2.404)。3. 肝癌組Pre-S2起始密碼子變異率為32.1%(17/53),對(duì)照組變異率為8.4%(8/95),兩組差別有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=13.559,P=0.000,OR=5.135)。4. 肝癌組T53C變異率為24.5%(13/53),對(duì)照組變異率為5.3%(5/95),兩組差別有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=11.819,P=0.001,OR=5.850)。5. 非條件Logistic回歸分析得出Pre-S區(qū)缺失(OR=7.021,95%CI2.692-18.314)、Pre-S2起始密碼子變異(OR=5.633,95%CI 1.869-16.983)、 T53C變異(OR=5.313,95%CI 1.518-18.600)、男性(OR=2.907,95%CI 1.126-7.506)均與肝癌相關(guān)。6.T53C變異在不同性別中,對(duì)肝癌發(fā)生的作用存在異質(zhì)性,說明T53C變異與性別存在交互作用(P0.1)。7. 構(gòu)建扶綏地區(qū)B基因型與C基因型的Pre-S區(qū)參照序列,兩序列的異質(zhì)性為12.1%。結(jié)論P(yáng)re-S區(qū)缺失、Pre-S2區(qū)起始密碼子變異、T53C變異是肝癌發(fā)生的獨(dú)立危險(xiǎn)因素；性別是T53C變異的效應(yīng)修飾因子；HBV基因突變的研究中,參照序列的選擇將影響最終的結(jié)果,不同地區(qū)具有不同的流行株,它們存在異質(zhì)性,所以構(gòu)建扶綏地區(qū)HBV參照序列是HBV變異研究的基礎(chǔ)性工作。
【關(guān)鍵詞】：肝癌 乙型肝炎病毒 基因型 Pre-S區(qū) 前S區(qū) 起始密碼子 參照序列
【學(xué)位授予單位】：廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：R735.7;R512.62
【目錄】：

• 個(gè)人簡歷3-7
• 摘要7-9
• ABSTRACT9-11
• 1. 前言11-15
• 2. 材料與方法15-29
• 2.1 研究對(duì)象15
• 2.1.1 研究對(duì)象來源,納入標(biāo)準(zhǔn)和排除標(biāo)準(zhǔn)15
• 2.1.2 血標(biāo)本采集15
• 2.2 血清HBsAg檢測15-17
• 2.2.1 試劑15-16
• 2.2.2 實(shí)驗(yàn)設(shè)備16
• 2.2.3 檢測步驟16-17
• 2.3 血清HBV DNA提取17-19
• 2.3.1 試劑17
• 2.3.2 設(shè)備17
• 2.3.3 準(zhǔn)備工作17-18
• 2.3.4 操作步驟18-19
• 2.4 血清HBV DNA純度鑒定19-20
• 2.4.1 設(shè)備19
• 2.4.2 鑒定流程19-20
• 2.5 血清HBV DNA定量檢測20-21
• 2.5.1 試劑20-21
• 2.5.2 設(shè)備21
• 2.5.3 檢測方法21
• 2.6 HBV DNA Pre-S區(qū)變異的檢測21-25
• 2.6.1 PCR擴(kuò)增22-23
• 2.6.2 PCR終產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳鑒定23-25
• 2.6.3 PCR擴(kuò)增終產(chǎn)物的測序25
• 2.6.4 分析、比對(duì)DNA序列25
• 2.7 HBV基因型與亞型的劃分25-27
• 2.7.1 PCR擴(kuò)增HBV DNA S區(qū)25-26
• 2.7.2 PCR擴(kuò)增S區(qū)產(chǎn)物鑒定26
• 2.7.3 PCR擴(kuò)增S區(qū)產(chǎn)物的測序26-27
• 2.7.4 基因型的確定27
• 2.8 HBV Pre-S區(qū)參照序列的建立27-28
• 2.9 統(tǒng)計(jì)分析28-29
• 3. 結(jié)果29-44
• 3.1 肝癌組與對(duì)照組一般資料的比較29
• 3.2 肝癌組與對(duì)照組HBV DNA定量的比較29-30
• 3.3 肝癌組與對(duì)照組基因型的分布情況30
• 3.4 HBV DNA Pre-S區(qū)變異分析30-32
• 3.5 HBV DNA Pre-S區(qū)缺失模式的分析32-34
• 3.6 Pre-S區(qū)變異與其他因素的關(guān)系34-35
• 3.7 多因素Logistic回歸分析35-36
• 3.8 分層分析Pre-S區(qū)變異與肝癌的關(guān)系36-42
• 3.9 構(gòu)建Pre-S區(qū)參照序列42-44
• 4. 討論44-50
• 4.1 肝癌與Pre-S區(qū)變異的關(guān)系44-46
• 4.2 分層分析46-47
• 4.3 Pre-S區(qū)參照序列的初步構(gòu)建47-48
• 4.4 問題與展望48-50
• 參考文獻(xiàn)50-54
• 附錄54-55
• 綜述55-63
• 參考文獻(xiàn)60-63
• 致謝63-64
• 攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文64

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 吳煒;HBV前S基因變異及其臨床意義[J];國外醫(yī)學(xué)(流行病學(xué)傳染病學(xué)分冊(cè));2002年04期

2 張春燕;黃天壬;張振權(quán);余家華;何振芳;周德南;利基林;葉司原;鄧偉;盛鷹;梁安民;唐步堅(jiān);;廣西肝癌高發(fā)區(qū)成年居民乙型肝炎病毒感染的現(xiàn)況研究[J];廣西醫(yī)學(xué);2006年12期

3 韋忠亮;李云西;何明榮;;扶綏縣2004～2008年肝癌發(fā)病率分析[J];中國癌癥防治雜志;2011年02期

4 王天爵;;交互作用的估計(jì)及其應(yīng)用(一)[J];中國衛(wèi)生統(tǒng)計(jì);1989年06期

5 葛憲民,李丹亞,方鐘燎,黃果勇,江世強(qiáng),潘海東,杜巖,王超英,丁欣,溝上雅史;廣西乙型肝炎病毒基因分型及其臨床意義的研究[J];中華實(shí)驗(yàn)和臨床病毒學(xué)雜志;2003年02期

6 房繼蓮,魏來,李若冰,叢旭,許軍,Erwin Sablon,孫焱,王豪,王宇;乙型肝炎病毒基本核心啟動(dòng)子及前C區(qū)突變與基因型的關(guān)系[J];中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志;2004年06期

7 常曉依;蘭喜;白銀梅;柳紀(jì)省;;乙型肝炎病毒的研究進(jìn)展[J];中國農(nóng)學(xué)通報(bào);2010年18期

8 許紅梅,任紅,凌寧,彭明利,卿玉玲;重慶地區(qū)HBV流行株P(guān)reS/S、EnhⅡ/CP/PreC基因標(biāo)準(zhǔn)參照序列的初步建立[J];重慶醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);2003年01期

9 Volker Bruss;;Hepatitis B virus morphogenesis[J];World Journal of Gastroenterology;2007年01期

10 李衛(wèi)昆;;乙肝病毒基因分型與HBVDNA及臨床表現(xiàn)的關(guān)系[J];中國社區(qū)醫(yī)師;2015年08期

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 劉世建;乙型肝炎病毒突變與肝細(xì)胞癌關(guān)系的研究[D];第二軍醫(yī)大學(xué);2009年

  本文關(guān)鍵詞：廣西扶綏乙型肝炎病毒Pre-S區(qū)變異與肝癌的關(guān)聯(lián)分析及其參照序列的建立，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號(hào)：448264