廣東省珠海地區(qū)淋球菌多抗原序列分型研究
發(fā)布時間:2024-04-12 05:24
目的:了解廣東省珠海地區(qū)淋球菌基因型的分布,為淋病的防控提供實驗室依據(jù)。方法:采用淋球菌多抗原序列分型法(NG-MAST)對2018-2019年珠海市淋病監(jiān)測網(wǎng)絡收集的172株淋球菌菌株進行基因分型,并構建系統(tǒng)進化樹。結(jié)果:172株淋球菌中,porB基因型82種,tbpB基因型44種;porB和tbpB基因型別前三位分別為por2978(13株)、por1135(11株)、por3215(9株)和tbp10(37株)、tbp21(26株)、tbp110(13株)。NG-MAST型別79種,未知基因型占33.7%,優(yōu)勢基因型為ST9659(9株)、ST5308(6株)、ST8140(6株),系統(tǒng)進化樹顯示菌株具有高度多態(tài)性。結(jié)論:本地區(qū)NG-MAST型別具有多樣性,新基因型菌株較多。
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本文編號:3951728
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圖1porB、tbpB、NG-MAST系統(tǒng)進化樹
如圖1所示,三個基因系統(tǒng)進化樹顯示各基因具有高度多態(tài)性,porB基因可大概分為3組,大部分Bootstrap值大于50。tbpB基因可大概分為5組,由于基因片段長度短,序列具有高度同源性,特別是10基因型別,Bootstrap小于50。NG-MAST的系統(tǒng)進化樹可大概分為3組,大....
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