hsa-miR-367-3p靶基因預(yù)測及功能分析
發(fā)布時間:2023-05-07 15:33
目的通過生物信息學(xué)方法預(yù)測hsa-miR-367-3p的靶基因及其靶基因的功能。方法運用miRbase在線數(shù)據(jù)庫、miRGator v3.0在線數(shù)據(jù)庫TargetScan、miRDB在線數(shù)據(jù)庫和DAVID在線數(shù)據(jù)庫進行預(yù)測和分析。結(jié)果 hsa-miR-367-3p在多個物種之間具有高度保守性;在干細胞中表達豐富度較高;功能富集分析發(fā)現(xiàn),hsa-miR-367-3p的靶基因涉及心室發(fā)育、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)等38個生物過程(P <0.05),富集在神經(jīng)元等21個細胞組分(P <0.05)。結(jié)論 hsa-miR-367-3p個別預(yù)測出來的靶基因與通路已經(jīng)被證實,更多的預(yù)測結(jié)果需要進一步的研究加以驗證。本研究為將來驗證hsa-miR-367-3p的靶基因和可能調(diào)控的通路指明了方向。
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 hsa-miR-367-3p的保守性分析以及在不同物種間的基因序列進化分析
1.2 hsa-miR-367-3p的表達情況、靶基因預(yù)測、功能富集分析和轉(zhuǎn)導(dǎo)通路富集分析
2 結(jié)果
2.1 hsa-miR-367-3p的保守性分析
2.2 miR-367-3p在不同物種間的基因序列進化分析
2.3 hsa-miR-367-3p的表達情況分析
2.4 hsa-miR-367-3p的靶基因預(yù)測
2.5 hsa-miR-367-3p靶基因的功能富集分析
2.6 hsa-miR-367-3p靶基因的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路分析
3 討論
本文編號:3810842
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1 材料與方法
1.1 hsa-miR-367-3p的保守性分析以及在不同物種間的基因序列進化分析
1.2 hsa-miR-367-3p的表達情況、靶基因預(yù)測、功能富集分析和轉(zhuǎn)導(dǎo)通路富集分析
2 結(jié)果
2.1 hsa-miR-367-3p的保守性分析
2.2 miR-367-3p在不同物種間的基因序列進化分析
2.3 hsa-miR-367-3p的表達情況分析
2.4 hsa-miR-367-3p的靶基因預(yù)測
2.5 hsa-miR-367-3p靶基因的功能富集分析
2.6 hsa-miR-367-3p靶基因的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路分析
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