脫氧核酶及鎖核酸核酶對(duì)HepG2.2.15細(xì)胞HBsAg、HBeAg表達(dá)抑制作用的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-10-07 09:02
乙型肝炎病毒(HBV)感染是急性肝炎、慢性肝炎、肝硬化及肝癌的主要原因。全世界約有3.5億人感染乙型肝炎病毒,其中約25-40%的病人最終死于該病的并發(fā)癥。目前尚無特效藥物,因此,開發(fā)新型、廉價(jià)、高效、副作用小、穩(wěn)定且有靶向性的基因治療藥物已成為治療該病的重要途徑。脫氧核酶(DNAzyme)是一種具有酶活性的DNA分子。它的結(jié)構(gòu)極似錘頭樣核酶,含有一保守的催化區(qū)和兩個(gè)可變的側(cè)翼結(jié)合區(qū)。它可以特異性地與靶RNA配對(duì),切割靶RNA而使其失去生物學(xué)活性。鎖核酸核酶(LNAzyme)是DNAzyme的一種衍生物,是在DNAzyme的兩個(gè)結(jié)合臂上引入一個(gè)或幾個(gè)LNA單體而形成的。通過LNA單體的引入,使其對(duì)RNA的切割能力明顯提高,且特異性強(qiáng)。HBV復(fù)制過程中包括一個(gè)逆轉(zhuǎn)錄過程,針對(duì)HBV前基因組RNA的特定區(qū)域設(shè)計(jì)合成HBV特異性的脫氧核酶及鎖核酸核酶,可以阻斷HBV的復(fù)制和表達(dá)。本實(shí)驗(yàn)針對(duì)HBV設(shè)計(jì)合成了未修飾的10-23DNAzyme、點(diǎn)硫代修飾的10-23DNAzyme及LNAzyme。用其轉(zhuǎn)染HepG2.2.15細(xì)胞,觀察它們對(duì)HepG2.2.15細(xì)胞HBsAg、HBeAg表達(dá)的抑制作...
【文章來源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:90 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
LNA和DNA的結(jié)構(gòu)
四、LNAzyme 的結(jié)構(gòu)與切割效率LNAzyme 是在 DNAzyme 的兩個(gè)結(jié)合臂上引入一個(gè)或幾個(gè) LNA 類單體而形成的,在 10-23DNAzyme 的每個(gè)結(jié)合臂上引入幾個(gè) LNA 想呢?Vester 等[30]研究了引入 LNA 單體的最適宜個(gè)數(shù),使得 LNAz接近底物 RNA 結(jié)構(gòu)中特異性靶位點(diǎn),使容易切割,又有利于釋放,使 LNAzyme 能夠自由地在另一個(gè)底物分子上發(fā)動(dòng)新一個(gè)循環(huán)的。研究表明,每引入一個(gè) LNA 單體,就顯著增加了它們的結(jié)合親和鏈溫度(Tm)提高,在 18 聚體的寡核苷酸中每引入一個(gè) LNA 單 增加 1.5-4℃,故引入 LNA 單體可顯著提高 LNAzyme 與靶序列有效力[26]。但是,LNA 單體顯著提高了 LNAzyme 與 RNA 形成雙螺旋度[5-7]。因此,過多的 LNA 在 DNAzyme 的結(jié)合臂將很可能降低 RN的解離率[30]。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,在每個(gè)結(jié)合臂上引入 2-3 個(gè) LNA 圖 1-2 DNAzyme 與 LNAzyme 二級(jí)結(jié)構(gòu)
0-23DNAzymeNAzyme(10-23DNA 酶或脫氧核酶)的命名是源于它的第 10 輪循環(huán)的第 23 個(gè)克隆[50]。該酶具有許多優(yōu)點(diǎn)如切割序列要求十分簡(jiǎn)單;催化切割效率極高,超過過某些蛋白質(zhì)酶;更令人興奮的是,當(dāng) Mg2+濃度降至高的活性;該酶其催化活性區(qū)高度保守[53-56]。23DNAzyme 的結(jié)構(gòu)及靶位特征:它的結(jié)構(gòu)極似錘頭樣守的催化區(qū)和 2 個(gè)可變的側(cè)翼結(jié)合區(qū)。其催化區(qū)序列,為 5’-GGCTAGCTACAACGA-3’,其序列高度保守合區(qū),即底物識(shí)別區(qū),一般兩個(gè)側(cè)翼長(zhǎng)約 7-9 個(gè)核ck 堿基配對(duì)原則與靶 RNA 特異性結(jié)合。10-23DNAzy交匯點(diǎn),即 5’-R↓Y-3’(R=A 或 G,Y=U 或 C,↓的磷酸二酯鍵),其中 R 不形成堿基配對(duì),Y 則必須圖 1-3 8-17DNAzyme 和 10-23DNAzyme 結(jié)構(gòu)圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]脫氧核酶在轉(zhuǎn)基因肝癌細(xì)胞中對(duì)HCV5′-非編碼區(qū)的抑制活性[J]. 于樂成,王升啟,顧長(zhǎng)海,陳忠斌,毛青,劉鴻凌. 中華傳染病雜志. 2004(02)
[2]10-23DNA酶體外切割HBV前C/C區(qū)mRNA的初步研究[J]. 鄭錦輝,王峰,?∑. 臨床肝膽病雜志. 2002(06)
[3]錘頭狀核酶在HepG2.2.15細(xì)胞內(nèi)的抗HBV特性[J]. 馮英,孔玉英,汪垣,祁國(guó)榮. 生物化學(xué)與生物物理學(xué)報(bào). 2002(02)
本文編號(hào):3421749
【文章來源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:90 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
LNA和DNA的結(jié)構(gòu)
四、LNAzyme 的結(jié)構(gòu)與切割效率LNAzyme 是在 DNAzyme 的兩個(gè)結(jié)合臂上引入一個(gè)或幾個(gè) LNA 類單體而形成的,在 10-23DNAzyme 的每個(gè)結(jié)合臂上引入幾個(gè) LNA 想呢?Vester 等[30]研究了引入 LNA 單體的最適宜個(gè)數(shù),使得 LNAz接近底物 RNA 結(jié)構(gòu)中特異性靶位點(diǎn),使容易切割,又有利于釋放,使 LNAzyme 能夠自由地在另一個(gè)底物分子上發(fā)動(dòng)新一個(gè)循環(huán)的。研究表明,每引入一個(gè) LNA 單體,就顯著增加了它們的結(jié)合親和鏈溫度(Tm)提高,在 18 聚體的寡核苷酸中每引入一個(gè) LNA 單 增加 1.5-4℃,故引入 LNA 單體可顯著提高 LNAzyme 與靶序列有效力[26]。但是,LNA 單體顯著提高了 LNAzyme 與 RNA 形成雙螺旋度[5-7]。因此,過多的 LNA 在 DNAzyme 的結(jié)合臂將很可能降低 RN的解離率[30]。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,在每個(gè)結(jié)合臂上引入 2-3 個(gè) LNA 圖 1-2 DNAzyme 與 LNAzyme 二級(jí)結(jié)構(gòu)
0-23DNAzymeNAzyme(10-23DNA 酶或脫氧核酶)的命名是源于它的第 10 輪循環(huán)的第 23 個(gè)克隆[50]。該酶具有許多優(yōu)點(diǎn)如切割序列要求十分簡(jiǎn)單;催化切割效率極高,超過過某些蛋白質(zhì)酶;更令人興奮的是,當(dāng) Mg2+濃度降至高的活性;該酶其催化活性區(qū)高度保守[53-56]。23DNAzyme 的結(jié)構(gòu)及靶位特征:它的結(jié)構(gòu)極似錘頭樣守的催化區(qū)和 2 個(gè)可變的側(cè)翼結(jié)合區(qū)。其催化區(qū)序列,為 5’-GGCTAGCTACAACGA-3’,其序列高度保守合區(qū),即底物識(shí)別區(qū),一般兩個(gè)側(cè)翼長(zhǎng)約 7-9 個(gè)核ck 堿基配對(duì)原則與靶 RNA 特異性結(jié)合。10-23DNAzy交匯點(diǎn),即 5’-R↓Y-3’(R=A 或 G,Y=U 或 C,↓的磷酸二酯鍵),其中 R 不形成堿基配對(duì),Y 則必須圖 1-3 8-17DNAzyme 和 10-23DNAzyme 結(jié)構(gòu)圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]脫氧核酶在轉(zhuǎn)基因肝癌細(xì)胞中對(duì)HCV5′-非編碼區(qū)的抑制活性[J]. 于樂成,王升啟,顧長(zhǎng)海,陳忠斌,毛青,劉鴻凌. 中華傳染病雜志. 2004(02)
[2]10-23DNA酶體外切割HBV前C/C區(qū)mRNA的初步研究[J]. 鄭錦輝,王峰,?∑. 臨床肝膽病雜志. 2002(06)
[3]錘頭狀核酶在HepG2.2.15細(xì)胞內(nèi)的抗HBV特性[J]. 馮英,孔玉英,汪垣,祁國(guó)榮. 生物化學(xué)與生物物理學(xué)報(bào). 2002(02)
本文編號(hào):3421749
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