2008~2014年中國6省市流行的人呼吸道合胞病毒B亞型G蛋白編碼基因特征分析
發(fā)布時間:2021-08-29 05:13
人呼吸道合胞病毒(Human respiratory syncytial virus,HRSV)是引起嬰幼兒下呼吸道感染的主要病原體之一。HRSV粘附蛋白(Attachment glycoprotein,G)是病毒膜表面糖蛋白,介導(dǎo)保護(hù)性免疫,是抗HRSV抗體和疫苗等的研究熱點(diǎn)之一。為研究2008~2014年中國HRSV B亞型G蛋白編碼基因的基因特征,于2008~2014年收集的363份HRSV陽性臨床標(biāo)本或病毒株中挑選89份代表株進(jìn)行G蛋白編碼基因全長核苷酸序列的擴(kuò)增和測序,使用Sequencher 5.0進(jìn)行序列的編輯,使用MEGA 5.0進(jìn)行序列比對和親緣關(guān)系進(jìn)化樹構(gòu)建以及氨基酸變異分析。89份代表株分別挑選自中國北京、吉林、廣東、河北、湖南、陜西6省市發(fā)熱呼吸道感染患者鼻咽拭子或病毒分離株,基因型包括BA9、BA10、BAc、BA、CB1及SAB4,覆蓋我國近年流行的優(yōu)勢基因型。親緣關(guān)系分析顯示,89株代表株可以分為6個分支,同一基因型G蛋白編碼基因核苷酸序列薈聚為一個分支;89份代表株之間的核苷酸(氨基酸)遺傳距離為0.03(0.04),與原型株CH-18537株的核苷酸(...
【文章來源】:病毒學(xué)報. 2019,35(02)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
材料與方法
1核酸提取及陽性標(biāo)本基因型別鑒定
2代表株挑選及G基因的獲得
3生物信息學(xué)分析
4數(shù)據(jù)整理及統(tǒng)計學(xué)分析
結(jié)果
1標(biāo)本來源及臨床信息
2親緣關(guān)系分析
3氨基酸變異分析
討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2008~2014年中國8省市流行的人呼吸道合胞病毒A亞型G蛋白編碼基因全長序列分析[J]. 宋金華,王慧玲,石晶,崔愛利,楊子峰,孫利偉,于德山,張蕾,張紅,張燕,許文波. 病毒學(xué)報. 2017(06)
本文編號:3369979
【文章來源】:病毒學(xué)報. 2019,35(02)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
材料與方法
1核酸提取及陽性標(biāo)本基因型別鑒定
2代表株挑選及G基因的獲得
3生物信息學(xué)分析
4數(shù)據(jù)整理及統(tǒng)計學(xué)分析
結(jié)果
1標(biāo)本來源及臨床信息
2親緣關(guān)系分析
3氨基酸變異分析
討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2008~2014年中國8省市流行的人呼吸道合胞病毒A亞型G蛋白編碼基因全長序列分析[J]. 宋金華,王慧玲,石晶,崔愛利,楊子峰,孫利偉,于德山,張蕾,張紅,張燕,許文波. 病毒學(xué)報. 2017(06)
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