日本血吸蟲不同蟲株的群體遺傳學分析
發(fā)布時間:2017-04-29 07:06
本文關鍵詞:日本血吸蟲不同蟲株的群體遺傳學分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:目的:日本血吸蟲病是一種由日本血吸蟲感染、寄生的嚴重危害人體健康的人畜共患寄生蟲病,其終宿主多達約46種哺乳動物,在我國仍然是一項不容忽視的公共衛(wèi)生問題。由于地理隔離等因素的影響,日本血吸蟲個體出現(xiàn)了不同程度的遺傳變異,從而導致日本血吸蟲不同蟲株的出現(xiàn),如地域株、耐藥株、實驗室傳代株等,這使我國進一步控制以致消滅日本血吸蟲病面臨挑戰(zhàn)。日本血吸蟲株或種群遺傳差異的研究對了解日本血吸蟲病傳播動態(tài)、宿主-寄生蟲相互關系、臨床癥狀及診斷、疫苗研制等具有重要意義。因此,本研究將應用微衛(wèi)星位點對源于安徽一山區(qū)血吸蟲病流行區(qū)的日本血吸蟲株進行群體遺傳學分析,并與血吸蟲實驗室傳代株及其它地域株進行比較,這將對進一步研究血吸蟲病的流行和蟲體的進化具有實際意義和理論價值。方法:在本次研究中,應用7個微衛(wèi)星位點對日本血吸蟲現(xiàn)場分離株(安徽石臺)和實驗室傳代株(江蘇無錫)共570條尾蚴進行多重PCR擴增,應用13個微衛(wèi)星位點對4個日本血吸蟲地域株(安徽和縣、安慶、石臺和江蘇無錫)共150條成蟲進行單重PCR擴增;擴增產(chǎn)物片段長度由上海生物工程(生工)有限公司檢測;分別用FSTAT、Pop Gene軟件檢測每個蟲株及位點的遺傳多樣性和哈迪-溫伯格平衡;應用Structure軟件構建群體結構;使用Bottleneck軟件檢測現(xiàn)場分離株和實驗室傳代株是否經(jīng)歷瓶頸效應;采用Phylip軟件構建4個地域株的種系發(fā)生樹。結果:1、對日本血吸蟲(尾蚴)現(xiàn)場分離株和實驗室傳代株的比較:(1)經(jīng)GENECAP工具剔除同一只釘螺體內(nèi)重復的基因型后,共獲得現(xiàn)場樣本136個基因型,實驗室樣本86個基因型;(2)現(xiàn)場分離株的群體等位基因數(shù)(A)和等位基因豐度(Rs)均高于實驗室蟲株;(3)瓶頸效應檢測表明實驗室群體經(jīng)歷了瓶頸效應;(4)群體結構分析結果顯示現(xiàn)場群體和實驗室群體被清晰地區(qū)分開。2、對4個日本血吸蟲(成蟲)地域株的比較:(1)安徽和縣群體的遺傳變異程度最低;F-統(tǒng)計量中的Fst值表明群體間遺傳分化達到30.7%(25%);成對Rst顯示安徽石臺群體與安徽安慶群體的親緣關系最近,與江蘇無錫群體的親緣關系最遠;(2)在構建群體結構中,安徽和縣群體和江蘇無錫群體均被單獨聚為一類,安徽安慶群體和安徽石臺群體被聚為一類;(3)種系發(fā)生樹中,江蘇無錫群體被單獨聚為一類,安徽的和縣、石臺和安慶群體被聚為一類。結論:1、實驗室傳代的日本血吸蟲尚不能替代自然群體用于血吸蟲疫苗研制、藥物耐受性等研究;2、不同終宿主來源的日本血吸蟲可能存在遺傳多態(tài)性差異;3、日本血吸蟲的群體遺傳結構受地理位置、地理環(huán)境等影響。
【關鍵詞】:日本血吸蟲 微衛(wèi)星 遺傳多態(tài)性 群體結構 瓶頸效應 種系發(fā)生樹
【學位授予單位】:蘇州大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:R383.24
【目錄】:
- 摘要4-6
- Abstract6-9
- 引言9-11
- 第一部分 日本血吸蟲(尾蚴)現(xiàn)場株與實驗室株的遺傳學分析11-19
- 材料與方法11-14
- 結果14-18
- 討論18-19
- 第二部分 日本血吸蟲(成蟲)不同地域株的群體遺傳學分析19-31
- 材料與方法19-24
- 結果24-29
- 討論29-31
- 結論31-32
- 參考文獻32-36
- 綜述36-45
- 參考文獻42-45
- 攻讀學位期間參加學術會議、發(fā)表的論文及獲得獎勵45-46
- 中英文縮略詞對照表46-47
- 附錄47-49
- 致謝49-50
【參考文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前2條
1 郭凱文,牛安歐;日本血吸蟲線粒體DNA的遺傳變異[J];熱帶醫(yī)學雜志;2004年04期
2 鄭蘇月;李飛;;分子遺傳技術在血吸蟲變異方面的研究進展[J];中國血吸蟲病防治雜志;2014年01期
中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 夏英定;日本血吸蟲:湖北釘螺人工傳代及線粒體atp6基因多態(tài)性研究[D];中南大學;2011年
本文關鍵詞:日本血吸蟲不同蟲株的群體遺傳學分析,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號:334380
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