日本血吸蟲不同蟲株的群體遺傳學(xué)分析
發(fā)布時間:2017-04-29 07:06
本文關(guān)鍵詞:日本血吸蟲不同蟲株的群體遺傳學(xué)分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:目的:日本血吸蟲病是一種由日本血吸蟲感染、寄生的嚴(yán)重危害人體健康的人畜共患寄生蟲病,其終宿主多達(dá)約46種哺乳動物,在我國仍然是一項(xiàng)不容忽視的公共衛(wèi)生問題。由于地理隔離等因素的影響,日本血吸蟲個體出現(xiàn)了不同程度的遺傳變異,從而導(dǎo)致日本血吸蟲不同蟲株的出現(xiàn),如地域株、耐藥株、實(shí)驗(yàn)室傳代株等,這使我國進(jìn)一步控制以致消滅日本血吸蟲病面臨挑戰(zhàn)。日本血吸蟲株或種群遺傳差異的研究對了解日本血吸蟲病傳播動態(tài)、宿主-寄生蟲相互關(guān)系、臨床癥狀及診斷、疫苗研制等具有重要意義。因此,本研究將應(yīng)用微衛(wèi)星位點(diǎn)對源于安徽一山區(qū)血吸蟲病流行區(qū)的日本血吸蟲株進(jìn)行群體遺傳學(xué)分析,并與血吸蟲實(shí)驗(yàn)室傳代株及其它地域株進(jìn)行比較,這將對進(jìn)一步研究血吸蟲病的流行和蟲體的進(jìn)化具有實(shí)際意義和理論價值。方法:在本次研究中,應(yīng)用7個微衛(wèi)星位點(diǎn)對日本血吸蟲現(xiàn)場分離株(安徽石臺)和實(shí)驗(yàn)室傳代株(江蘇無錫)共570條尾蚴進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增,應(yīng)用13個微衛(wèi)星位點(diǎn)對4個日本血吸蟲地域株(安徽和縣、安慶、石臺和江蘇無錫)共150條成蟲進(jìn)行單重PCR擴(kuò)增;擴(kuò)增產(chǎn)物片段長度由上海生物工程(生工)有限公司檢測;分別用FSTAT、Pop Gene軟件檢測每個蟲株及位點(diǎn)的遺傳多樣性和哈迪-溫伯格平衡;應(yīng)用Structure軟件構(gòu)建群體結(jié)構(gòu);使用Bottleneck軟件檢測現(xiàn)場分離株和實(shí)驗(yàn)室傳代株是否經(jīng)歷瓶頸效應(yīng);采用Phylip軟件構(gòu)建4個地域株的種系發(fā)生樹。結(jié)果:1、對日本血吸蟲(尾蚴)現(xiàn)場分離株和實(shí)驗(yàn)室傳代株的比較:(1)經(jīng)GENECAP工具剔除同一只釘螺體內(nèi)重復(fù)的基因型后,共獲得現(xiàn)場樣本136個基因型,實(shí)驗(yàn)室樣本86個基因型;(2)現(xiàn)場分離株的群體等位基因數(shù)(A)和等位基因豐度(Rs)均高于實(shí)驗(yàn)室蟲株;(3)瓶頸效應(yīng)檢測表明實(shí)驗(yàn)室群體經(jīng)歷了瓶頸效應(yīng);(4)群體結(jié)構(gòu)分析結(jié)果顯示現(xiàn)場群體和實(shí)驗(yàn)室群體被清晰地區(qū)分開。2、對4個日本血吸蟲(成蟲)地域株的比較:(1)安徽和縣群體的遺傳變異程度最低;F-統(tǒng)計(jì)量中的Fst值表明群體間遺傳分化達(dá)到30.7%(25%);成對Rst顯示安徽石臺群體與安徽安慶群體的親緣關(guān)系最近,與江蘇無錫群體的親緣關(guān)系最遠(yuǎn);(2)在構(gòu)建群體結(jié)構(gòu)中,安徽和縣群體和江蘇無錫群體均被單獨(dú)聚為一類,安徽安慶群體和安徽石臺群體被聚為一類;(3)種系發(fā)生樹中,江蘇無錫群體被單獨(dú)聚為一類,安徽的和縣、石臺和安慶群體被聚為一類。結(jié)論:1、實(shí)驗(yàn)室傳代的日本血吸蟲尚不能替代自然群體用于血吸蟲疫苗研制、藥物耐受性等研究;2、不同終宿主來源的日本血吸蟲可能存在遺傳多態(tài)性差異;3、日本血吸蟲的群體遺傳結(jié)構(gòu)受地理位置、地理環(huán)境等影響。
【關(guān)鍵詞】:日本血吸蟲 微衛(wèi)星 遺傳多態(tài)性 群體結(jié)構(gòu) 瓶頸效應(yīng) 種系發(fā)生樹
【學(xué)位授予單位】:蘇州大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R383.24
【目錄】:
- 摘要4-6
- Abstract6-9
- 引言9-11
- 第一部分 日本血吸蟲(尾蚴)現(xiàn)場株與實(shí)驗(yàn)室株的遺傳學(xué)分析11-19
- 材料與方法11-14
- 結(jié)果14-18
- 討論18-19
- 第二部分 日本血吸蟲(成蟲)不同地域株的群體遺傳學(xué)分析19-31
- 材料與方法19-24
- 結(jié)果24-29
- 討論29-31
- 結(jié)論31-32
- 參考文獻(xiàn)32-36
- 綜述36-45
- 參考文獻(xiàn)42-45
- 攻讀學(xué)位期間參加學(xué)術(shù)會議、發(fā)表的論文及獲得獎勵45-46
- 中英文縮略詞對照表46-47
- 附錄47-49
- 致謝49-50
【參考文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前2條
1 郭凱文,牛安歐;日本血吸蟲線粒體DNA的遺傳變異[J];熱帶醫(yī)學(xué)雜志;2004年04期
2 鄭蘇月;李飛;;分子遺傳技術(shù)在血吸蟲變異方面的研究進(jìn)展[J];中國血吸蟲病防治雜志;2014年01期
中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 夏英定;日本血吸蟲:湖北釘螺人工傳代及線粒體atp6基因多態(tài)性研究[D];中南大學(xué);2011年
本文關(guān)鍵詞:日本血吸蟲不同蟲株的群體遺傳學(xué)分析,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號:334380
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