本文關(guān)鍵詞：骨密度和初潮年齡的雙變量全基因組關(guān)聯(lián)研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：骨質(zhì)疏松癥是一種骨量降低、骨微體系結(jié)構(gòu)衰退以及骨內(nèi)蛋白質(zhì)數(shù)量和種類發(fā)生變化,從而引起骨脆性和骨折風(fēng)險增加的全身性骨骼疾病。初潮年齡(AAM)是影響女性健康的重要因素之一,它被當(dāng)作許多疾病的風(fēng)險因子。有研究表明,骨密度和初潮年齡在遺傳上存在相關(guān)性,滯后的初潮年齡將影響骨骼的生長和礦化,從而導(dǎo)致骨骼在生長過程中不能達(dá)到預(yù)期的骨密度峰值,造成隨后的老年階段患有骨質(zhì)疏松癥的高可能性。骨密度和初潮年齡為相關(guān)表型,它們之間可能存在一些共同作用的遺傳因子,但目前對這些遺傳因子的研究還很少。已有研究對初潮年齡和骨密度采用了單變量全基因組關(guān)聯(lián)分析,但這種單變量的方法不能鑒定同時與骨密度和初潮年齡關(guān)聯(lián)的遺傳因子,而該研究所使用的雙變量全基因組關(guān)聯(lián)分析法是鑒定一個遺傳因子與兩個表型間關(guān)聯(lián)關(guān)系的計算分析方法,它可以檢測出與兩種表型共同關(guān)聯(lián)的多效性基因。該研究中采用825個無血緣關(guān)系的中國漢族女性為初始樣本,驗證樣本為1728個美國高加索裔女性,712個美國非裔女性;409個美國西班牙裔女性。使用Affymetrix的Genome-Wide SNP Array 6.0芯片對樣本進(jìn)行基因分型,在質(zhì)量控制后得到616,194個SNP進(jìn)行后續(xù)的關(guān)聯(lián)分析。分析采用的是基于線性回歸模型的雙變量分析法,以鑒定同時與骨密度和初潮年齡關(guān)聯(lián)的SNP。初始樣本的結(jié)果中,沒有SNP的p值5×10-8。我們發(fā)現(xiàn)了6個值得關(guān)注的SNP,它們同時與AAM和BMD相關(guān)聯(lián)。其中的4個SNP(rs10817638,rs7851259,rs10982287和rs4979427),位于ATP6V1G1基因上游區(qū)域,它們的髖部BMD-AAM的雙變量關(guān)聯(lián)結(jié)果分別為p=4.90×10-7,1.07×10-6,1.28×10-5和5.42×10-5。這4個SNP均在非裔美國人群中得到驗證,其驗證結(jié)果分別為p=1.95×10-2,3.18×10-2,2.57×10-2 and 3.64×10-2。rs10817638和rs10982287同樣在高加索裔白人(結(jié)果分別為p=1.76×10-2和9.42×10-3)以及西班牙裔美國人群(結(jié)果分別為8.37×10-3和1.52×10-3)中得到驗證。我們對rs10817638和rs10982287進(jìn)行薈萃分析,其結(jié)果比較顯著,合并p值分別為3.02×10-9和3.49×10-9。先前的生物學(xué)研究表明ATP6V1G1在骨吸收方面的起到重要作用以及與初潮年齡可能存在著一定程度的聯(lián)系。該研究所發(fā)現(xiàn)的ATP6V1G1基因可能是骨密度和初潮年齡共享的基因,從而能提高人們對骨質(zhì)疏松癥與初潮年齡共同的分子遺傳機(jī)制的理解,在一定程度上為日后相關(guān)的研究打下基礎(chǔ)。
【關(guān)鍵詞】：骨密度 初潮年齡 雙變量分析 ABCB1 ATP6V1G1
【學(xué)位授予單位】：湖南師范大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R580;R394
【目錄】：

• 中文摘要4-6
• 英文摘要6-10
• 第一章 研究綜述10-19
• 1.1 骨代謝10-13
• 1.1.1 骨的結(jié)構(gòu)和功能10-11
• 1.1.2 骨生成和骨重建11
• 1.1.3 骨重建的調(diào)控11-13
• 1.2 骨質(zhì)疏松癥13-15
• 1.2.1 骨質(zhì)疏松癥的定義13
• 1.2.2 骨質(zhì)疏松癥的診斷標(biāo)準(zhǔn)13
• 1.2.3 骨密度的測定13-14
• 1.2.4 骨折14
• 1.2.5 骨質(zhì)疏松癥的流行病學(xué)14-15
• 1.2.6 骨質(zhì)疏松癥的發(fā)病機(jī)理15
• 1.3 初潮年齡15-16
• 1.4 骨密度與初潮年齡的相關(guān)性16-17
• 1.5 雙變量全基因組關(guān)聯(lián)分析17-18
• 1.5.1 全基因組關(guān)聯(lián)分析17-18
• 1.5.2 雙變量分析18
• 1.6 該學(xué)位論文的創(chuàng)新性及意義18-19
• 第二章 骨密度和初潮年齡的雙變量全基因組關(guān)聯(lián)分析19-37
• 2.1 材料和方法19-25
• 2.1.1 樣本19-20
• 2.1.2 DNA的提取20-21
• 2.1.3 基因分型21-22
• 2.1.4 統(tǒng)計分析22-25
• 2.2 結(jié)果25-33
• 2.2.1 樣本信息25
• 2.2.2 骨密度與初潮年齡的表型相關(guān)結(jié)果25
• 2.2.3 全基因組雙變量關(guān)聯(lián)分析25-30
• 2.2.4 條件控制分析30
• 2.2.5 連鎖不平衡及單體型分析30-32
• 2.2.6 單變量全基因組關(guān)聯(lián)分析32-33
• 2.2.7 SNP功能預(yù)測33
• 2.3 討論33-37
• 參考文獻(xiàn)37-42
• 攻讀學(xué)位期間的學(xué)術(shù)論文42-43
• 致謝43

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本文編號：334029