發(fā)布時間：2021-06-21 05:16

　　克隆解淀粉芽胞桿菌WS-8 （Bacillus amyloliquefaciens WS-8）中的第二類羊毛硫肽合成酶LanM基因,并對LanM編碼蛋白的理化性質(zhì)及結(jié)構(gòu)特征進(jìn)行分析。設(shè)計LanM基因（登錄號:APQ49580.1）擴(kuò)增引物,提取解淀粉芽胞桿菌WS-8基因組DNA,以其作為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增。綜合多種軟件預(yù)測和分析LanM編碼蛋白的理化性質(zhì)、結(jié)構(gòu)域和二級結(jié)構(gòu)等。采用鄰位連接法（Neighbor-Joining, NJ）構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹來分析LanM所編碼蛋白與同源蛋白的親緣關(guān)系,以及各蛋白結(jié)構(gòu)域的親緣關(guān)系。PCR擴(kuò)增出的目的條帶約為2 840 bp,通過測序鑒定,序列信息與基因組數(shù)據(jù)一致。LanM基因編碼961個氨基酸,等電點(diǎn)為6.07,相對分子質(zhì)量為111.485 1 kD。LanM編碼的蛋白屬于親水性蛋白,無信號肽。該蛋白含有LANC_like結(jié)構(gòu)域,其二級結(jié)構(gòu)主要由螺旋結(jié)構(gòu)和環(huán)狀結(jié)構(gòu)組成。系統(tǒng)發(fā)育樹的分析結(jié)果表明LANC_like結(jié)構(gòu)域和LanM同源蛋白的親緣關(guān)系一致。解淀粉芽胞桿菌WS-8中存在第二類羊毛硫肽合成酶LanM基因... 

【文章來源】：基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2019,38(02)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：6 頁

【文章目錄】：
1 結(jié)果與分析
    1.1 第二類羊毛硫肽合成酶基因LanM的克隆
    1.2 第二類羊毛硫肽合成酶LanM的理化性質(zhì)預(yù)測分析
    1.3 第二類羊毛硫肽合成酶LanM的二級結(jié)構(gòu)及結(jié)構(gòu)域預(yù)測
    1.4 第二類羊毛硫肽合成酶LanM及其結(jié)構(gòu)域的親緣關(guān)系分析
    1.5 第二類羊毛硫肽合成酶LanM的三級結(jié)構(gòu)預(yù)測
2 討論
3 材料與方法
    3.1 材料與試劑
    3.2 第二類羊毛硫肽合成酶基因LanM的克隆
    3.3 預(yù)測分析第二類羊毛硫肽合成酶LanM的理化性質(zhì)
    3.4 第二類羊毛硫肽合成酶LanM的二級結(jié)構(gòu)及結(jié)構(gòu)域預(yù)測
    3.5 第二類羊毛硫肽合成酶LanM及其結(jié)構(gòu)域的親緣關(guān)系分析
    3.6 第二類羊毛硫肽合成酶LanM的三級結(jié)構(gòu)預(yù)測
作者貢獻(xiàn)


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[2]羊毛硫肽類化合物（Lanthipeptide）生物合成新進(jìn)展[J]. 莫天錄,薛林貴,張琪.  微生物學(xué)報. 2016(03)
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[4]羊毛硫細(xì)菌素bovicin HJ50修飾酶BovM雙功能域單獨(dú)催化活性鑒定[J]. 馬宏初,高涌,趙方圓,鐘瑾.  微生物學(xué)報. 2015(01)
[5]馬鈴薯晚疫病菌全基因組分泌蛋白的初步分析[J]. 周曉罡,侯思名,陳鐸文,陶南,丁玉梅,孫茂林,張紹松.  遺傳. 2011(07)



本文編號：3240053