通過生物信息學(xué)方法分析了人MEPE蛋白的理化性質(zhì)、亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)定位、跨膜區(qū)、信號(hào)肽、空間結(jié)構(gòu)、蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)及MEPE分子的進(jìn)化保守性等。分析表明,人MEPE蛋白等電點(diǎn)為8.62,理論上屬于堿性親水蛋白,有信號(hào)肽區(qū)域,但無跨膜區(qū),預(yù)測為分泌型蛋白分子;主要二級(jí)結(jié)構(gòu)元件是無規(guī)卷曲;MEPE在哺乳動(dòng)物中高度保守,能與多種蛋白發(fā)生相互作用。 

【文章來源】：化學(xué)教育(中英文). 2019,40(10)北大核心

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

圖１ＭＥＰＥ蛋白的親－疏水性分析Ｆｉｇ．１Ｈｙｄｒｏｐｈｉｌｉｃ－ｈｙｄｒｏｐｈｏｂｉｃａｎａｌｙｓｉｓｏｆＭＥＰＥｐｒｏｔｅｉｎ

０．９６０；１－１６位氨基酸殘基序列的平均信號(hào)肽分值為０．９３５，能夠形成經(jīng)典的信號(hào)肽區(qū)域，預(yù)測ＭＥＰＥ為分泌型蛋白。在第１６、１７位氨基酸殘基間Ｃ值最大，Ｓ值陡峭，Ｙ值最高峰，預(yù)測為信號(hào)肽剪切位點(diǎn)。使用ＴＭ－ＨＭＭＳｅｒｖｅｒｖ．２．０軟件對(duì)ＭＥＰＥ蛋白跨膜區(qū)進(jìn)行預(yù)測，結(jié)果為ＭＥＰＥ蛋白序列不存在跨膜區(qū)域，見圖３，提示ＭＥＰＥ可能為非跨膜蛋白。Ｆｉｇ．２ＳｉｇｎａｌｐｅｐｔｉｄｅｓａｎａｌｙｓｉｓｏｆＭＥＰＥ圖２ＭＥＰＥ蛋白信號(hào)肽分析Ｆｉｇ．３ＴｒａｎｓｍｅｍｂｒａｎｅｒｅｇｉｏｎａｎａｌｙｓｉｓｏｆＭＥＰＥ圖３ＭＥＰＥ跨膜區(qū)域分析２．５ＭＥＰＥ蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)分析通過蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測軟件ＳＯＰＭＡ分析ＭＥＰＥ的二級(jí)結(jié)構(gòu)得出，多肽鏈中α－螺旋結(jié)構(gòu)占１６％，無規(guī)卷曲占７１．２４％，延伸鏈占８．１９％，β－轉(zhuǎn)角占４．５７％。結(jié)果顯示，無規(guī)卷曲占主導(dǎo)，近年來發(fā)現(xiàn)一些蛋白質(zhì)的功能部位常存在于這種構(gòu)象中（圖４）。ＮＣＢＩ的ＣｏｎｓｅｒｖｅｄＤｏｍａｉｎ數(shù)據(jù)庫分析ＭＥＰＥ蛋白的保守結(jié)構(gòu)域，見圖５，表明ＭＥＰＥ屬于骨調(diào)蛋白超家族（Ｏｓｔｅｏｒｅｇｕｌｉｎｓｕｐｅｒｆａｍｉｌｙ）。２．６蛋白質(zhì)相互作用分析通過蛋白質(zhì)相互作用關(guān)系檢索工具ＳＴＲＩＮＧ數(shù)據(jù)庫預(yù)測與ＭＥＰＥ有相關(guān)性的蛋白，構(gòu)建蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)，見圖６。相關(guān)蛋白包括成纖維細(xì)胞生長因子２３（ｆｉｂｒｏｂｌａｓｔｇｒｏｗｔｈｆａｃｔｏｒ２３，ＦＧＦ２３），同源Ｘ染色體連鎖的磷酸鹽調(diào)節(jié)內(nèi)肽酶（ｐｈ

測ＭＥＰＥ為分泌型蛋白。在第１６、１７位氨基酸殘基間Ｃ值最大，Ｓ值陡峭，Ｙ值最高峰，預(yù)測為信號(hào)肽剪切位點(diǎn)。使用ＴＭ－ＨＭＭＳｅｒｖｅｒｖ．２．０軟件對(duì)ＭＥＰＥ蛋白跨膜區(qū)進(jìn)行預(yù)測，結(jié)果為ＭＥＰＥ蛋白序列不存在跨膜區(qū)域，見圖３，提示ＭＥＰＥ可能為非跨膜蛋白。Ｆｉｇ．２ＳｉｇｎａｌｐｅｐｔｉｄｅｓａｎａｌｙｓｉｓｏｆＭＥＰＥ圖２ＭＥＰＥ蛋白信號(hào)肽分析Ｆｉｇ．３ＴｒａｎｓｍｅｍｂｒａｎｅｒｅｇｉｏｎａｎａｌｙｓｉｓｏｆＭＥＰＥ圖３ＭＥＰＥ跨膜區(qū)域分析２．５ＭＥＰＥ蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)分析通過蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測軟件ＳＯＰＭＡ分析ＭＥＰＥ的二級(jí)結(jié)構(gòu)得出，多肽鏈中α－螺旋結(jié)構(gòu)占１６％，無規(guī)卷曲占７１．２４％，延伸鏈占８．１９％，β－轉(zhuǎn)角占４．５７％。結(jié)果顯示，無規(guī)卷曲占主導(dǎo)，近年來發(fā)現(xiàn)一些蛋白質(zhì)的功能部位常存在于這種構(gòu)象中（圖４）。ＮＣＢＩ的ＣｏｎｓｅｒｖｅｄＤｏｍａｉｎ數(shù)據(jù)庫分析ＭＥＰＥ蛋白的保守結(jié)構(gòu)域，見圖５，表明ＭＥＰＥ屬于骨調(diào)蛋白超家族（Ｏｓｔｅｏｒｅｇｕｌｉｎｓｕｐｅｒｆａｍｉｌｙ）。２．６蛋白質(zhì)相互作用分析通過蛋白質(zhì)相互作用關(guān)系檢索工具ＳＴＲＩＮＧ數(shù)據(jù)庫預(yù)測與ＭＥＰＥ有相關(guān)性的蛋白，構(gòu)建蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)，見圖６。相關(guān)蛋白包括成纖維細(xì)胞生長因子２３（ｆｉｂｒｏｂｌａｓｔｇｒｏｗｔｈｆａｃｔｏｒ２３，ＦＧＦ２３），同源Ｘ染色體連鎖的磷酸鹽調(diào)節(jié)內(nèi)肽酶（ｐｈｏｓｐｈａｔｅｒｅｇｕｌａｔｉｎｇｅｎｄｏｐｅｐｔｉｄａｓｅｈｏｍｏｌｏｇ，Ｘ－ｌｉｎｋｅｄ，ＰＨＥＸ

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]miRNA-758對(duì)宮頸癌的調(diào)控機(jī)制及其臨床價(jià)值研究[J]. 高爭,王曉紅,孟憲華,趙穎輝,陶梅,申淑玲.  醫(yī)學(xué)理論與實(shí)踐. 2016(13)
[2]轉(zhuǎn)錄因子c-Jun調(diào)控成骨細(xì)胞Mepe基因表達(dá)的研究[J]. 張娟娟,劉宗霞,孫巖.  中國病理生理雜志. 2015(06)

碩士論文
[1]敲除小鼠乳腺癌細(xì)胞整合素基因抑制其侵襲轉(zhuǎn)移能力的作用研究[D]. 張彥.南方醫(yī)科大學(xué) 2017



本文編號(hào)：3074285