我國(guó)利什曼原蟲(chóng)伽師株有毒力和無(wú)毒力前鞭毛體定量蛋白質(zhì)組學(xué)比較分析
發(fā)布時(shí)間:2021-03-07 10:36
目的應(yīng)用定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法比較我國(guó)利什曼原蟲(chóng)伽師株有毒力和無(wú)毒力前鞭毛體蛋白表達(dá)的差異。方法將分離于我國(guó)新疆伽師縣黑熱病患者嬰兒利什曼原蟲(chóng)JS5有毒力株前鞭毛體和無(wú)毒力株前鞭毛體經(jīng)酶解后進(jìn)行液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜(Liquid chromatography-tandem mass spectrometry, LC-MS/MS)的非標(biāo)記(Label-free)定量分析,利用MaxQuant軟件查庫(kù),進(jìn)行Label-free非標(biāo)定量(LFQ)分析;每個(gè)樣品重復(fù)3次質(zhì)譜分析,只有1次有LFQ值的蛋白舍棄。結(jié)果本研究共鑒定蛋白3 994個(gè),有毒力和無(wú)毒力株間差異蛋白為298個(gè)(差異倍數(shù)>1.2或差異倍數(shù)<0.83,P<0.05),其中利什曼原蟲(chóng)有毒力株前鞭毛體特有表達(dá)蛋白15個(gè),無(wú)毒力株前鞭毛體特有表達(dá)蛋白23個(gè),二者間表達(dá)豐度有顯著差異蛋白260個(gè),其中有毒力前鞭毛體表達(dá)上調(diào)蛋白(高表達(dá))78個(gè),表達(dá)下調(diào)蛋白(低表達(dá))182個(gè)。這些差異表達(dá)蛋白中已鑒定功能的蛋白分別涉及糖與脂質(zhì)代謝、核酸代謝、壓力反應(yīng)、細(xì)胞骨架形成、細(xì)胞周期與增殖等生物功能。結(jié)論利什曼原蟲(chóng)伽師株有毒力株和無(wú)毒力株...
【文章來(lái)源】:中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2019,35(02)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
圖1利什曼原蟲(chóng)伽師有毒株和無(wú)毒株差異表達(dá)蛋白韋恩圖
cellcompositionandmolecularfunctionenrichmentdiagramofdown-regulatedproteinsinvirulentstrain2.3差異表達(dá)蛋白通路富集分析對(duì)有毒株表達(dá)上調(diào)蛋白和下調(diào)蛋白分別進(jìn)行信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路富集分析,結(jié)果顯示表達(dá)上調(diào)蛋白參與了核糖體、吞噬體、醚脂代謝等信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路(圖4);表達(dá)下調(diào)蛋白參與了丙酮酸代謝、次生代謝物的生物合成、抗生素的生物合成等信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路(圖5)。圖4有毒株表達(dá)上調(diào)蛋白的通路富集圖Fig.4Pathwaysenrichmentdiagramofup-regulatedpro-teinsinvirulentstrain圖5有毒株表達(dá)下調(diào)蛋白的通路富集圖Fig.5Pathwaysenrichmentdiagramofdown-regulatedproteinsinvirulentstrain3討論本研究應(yīng)用非標(biāo)記高通量蛋白質(zhì)組研究技術(shù)對(duì)分離于我國(guó)新疆伽師縣致荒漠型黑熱病的利什曼原蟲(chóng)有毒株和無(wú)毒株進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)分析,共鑒定蛋白3994個(gè),遠(yuǎn)高于其他蛋白質(zhì)組方法鑒定的蛋白數(shù)[8]。本研究結(jié)果顯示,298?jìng)(gè)蛋白在有毒株和無(wú)毒株間的表達(dá)存在差異(特異表達(dá)或表達(dá)豐度差異)。這些差異表達(dá)蛋白中確定功能的蛋白分別參與糖與脂質(zhì)代謝、核酸代謝、壓力反應(yīng)、細(xì)胞骨架形成、細(xì)胞周期與增殖等活動(dòng)。001中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào)2019,35(2)
ain2.3差異表達(dá)蛋白通路富集分析對(duì)有毒株表達(dá)上調(diào)蛋白和下調(diào)蛋白分別進(jìn)行信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路富集分析,結(jié)果顯示表達(dá)上調(diào)蛋白參與了核糖體、吞噬體、醚脂代謝等信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路(圖4);表達(dá)下調(diào)蛋白參與了丙酮酸代謝、次生代謝物的生物合成、抗生素的生物合成等信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路(圖5)。圖4有毒株表達(dá)上調(diào)蛋白的通路富集圖Fig.4Pathwaysenrichmentdiagramofup-regulatedpro-teinsinvirulentstrain圖5有毒株表達(dá)下調(diào)蛋白的通路富集圖Fig.5Pathwaysenrichmentdiagramofdown-regulatedproteinsinvirulentstrain3討論本研究應(yīng)用非標(biāo)記高通量蛋白質(zhì)組研究技術(shù)對(duì)分離于我國(guó)新疆伽師縣致荒漠型黑熱病的利什曼原蟲(chóng)有毒株和無(wú)毒株進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)分析,共鑒定蛋白3994個(gè),遠(yuǎn)高于其他蛋白質(zhì)組方法鑒定的蛋白數(shù)[8]。本研究結(jié)果顯示,298?jìng)(gè)蛋白在有毒株和無(wú)毒株間的表達(dá)存在差異(特異表達(dá)或表達(dá)豐度差異)。這些差異表達(dá)蛋白中確定功能的蛋白分別參與糖與脂質(zhì)代謝、核酸代謝、壓力反應(yīng)、細(xì)胞骨架形成、細(xì)胞周期與增殖等活動(dòng)。001中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào)2019,35(2)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]不同種株利什曼原蟲(chóng)的比較蛋白質(zhì)組學(xué)分析[J]. 沈成義,鄧世山,張仁剛,張潔,敬保遷. 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2009(05)
本文編號(hào):3068927
【文章來(lái)源】:中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2019,35(02)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
圖1利什曼原蟲(chóng)伽師有毒株和無(wú)毒株差異表達(dá)蛋白韋恩圖
cellcompositionandmolecularfunctionenrichmentdiagramofdown-regulatedproteinsinvirulentstrain2.3差異表達(dá)蛋白通路富集分析對(duì)有毒株表達(dá)上調(diào)蛋白和下調(diào)蛋白分別進(jìn)行信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路富集分析,結(jié)果顯示表達(dá)上調(diào)蛋白參與了核糖體、吞噬體、醚脂代謝等信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路(圖4);表達(dá)下調(diào)蛋白參與了丙酮酸代謝、次生代謝物的生物合成、抗生素的生物合成等信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路(圖5)。圖4有毒株表達(dá)上調(diào)蛋白的通路富集圖Fig.4Pathwaysenrichmentdiagramofup-regulatedpro-teinsinvirulentstrain圖5有毒株表達(dá)下調(diào)蛋白的通路富集圖Fig.5Pathwaysenrichmentdiagramofdown-regulatedproteinsinvirulentstrain3討論本研究應(yīng)用非標(biāo)記高通量蛋白質(zhì)組研究技術(shù)對(duì)分離于我國(guó)新疆伽師縣致荒漠型黑熱病的利什曼原蟲(chóng)有毒株和無(wú)毒株進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)分析,共鑒定蛋白3994個(gè),遠(yuǎn)高于其他蛋白質(zhì)組方法鑒定的蛋白數(shù)[8]。本研究結(jié)果顯示,298?jìng)(gè)蛋白在有毒株和無(wú)毒株間的表達(dá)存在差異(特異表達(dá)或表達(dá)豐度差異)。這些差異表達(dá)蛋白中確定功能的蛋白分別參與糖與脂質(zhì)代謝、核酸代謝、壓力反應(yīng)、細(xì)胞骨架形成、細(xì)胞周期與增殖等活動(dòng)。001中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào)2019,35(2)
ain2.3差異表達(dá)蛋白通路富集分析對(duì)有毒株表達(dá)上調(diào)蛋白和下調(diào)蛋白分別進(jìn)行信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路富集分析,結(jié)果顯示表達(dá)上調(diào)蛋白參與了核糖體、吞噬體、醚脂代謝等信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路(圖4);表達(dá)下調(diào)蛋白參與了丙酮酸代謝、次生代謝物的生物合成、抗生素的生物合成等信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路(圖5)。圖4有毒株表達(dá)上調(diào)蛋白的通路富集圖Fig.4Pathwaysenrichmentdiagramofup-regulatedpro-teinsinvirulentstrain圖5有毒株表達(dá)下調(diào)蛋白的通路富集圖Fig.5Pathwaysenrichmentdiagramofdown-regulatedproteinsinvirulentstrain3討論本研究應(yīng)用非標(biāo)記高通量蛋白質(zhì)組研究技術(shù)對(duì)分離于我國(guó)新疆伽師縣致荒漠型黑熱病的利什曼原蟲(chóng)有毒株和無(wú)毒株進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)分析,共鑒定蛋白3994個(gè),遠(yuǎn)高于其他蛋白質(zhì)組方法鑒定的蛋白數(shù)[8]。本研究結(jié)果顯示,298?jìng)(gè)蛋白在有毒株和無(wú)毒株間的表達(dá)存在差異(特異表達(dá)或表達(dá)豐度差異)。這些差異表達(dá)蛋白中確定功能的蛋白分別參與糖與脂質(zhì)代謝、核酸代謝、壓力反應(yīng)、細(xì)胞骨架形成、細(xì)胞周期與增殖等活動(dòng)。001中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào)2019,35(2)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]不同種株利什曼原蟲(chóng)的比較蛋白質(zhì)組學(xué)分析[J]. 沈成義,鄧世山,張仁剛,張潔,敬保遷. 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2009(05)
本文編號(hào):3068927
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