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應(yīng)用多重PCR方法對東北地區(qū)dystrophin基因缺失分布的研究及其應(yīng)用

發(fā)布時間:2020-10-23 06:43
   前言 杜氏/貝克型肌營養(yǎng)不良癥(Duchenne/Becker Muscular Dystrophy)是一種人類常見的致死性神經(jīng)一肌肉系統(tǒng)的X連鎖隱性遺傳病,二者是dystrophin基因等位基因異質(zhì)性疾病,發(fā)病率分別為活產(chǎn)男嬰的1/3500和1/30000。其中DMD是肌營養(yǎng)不良癥中最嚴重和最常見的類型,發(fā)病早(約3歲左右),進展快;Gowers征陽性,下肢病變早于上肢,對稱性發(fā)展;腓腸肌、股四頭肌、三角肌呈假性肥大,伴有關(guān)節(jié)攣縮、脊柱畸形;血清肌酸磷酸激酶(CPK)明顯升高;肌活檢顯示營養(yǎng)不良性肌病型,預(yù)后極差,患者多于20歲左右因呼吸衰竭、心力衰竭或呼吸道感染而死亡。BMD為DMD的等位良性型,發(fā)病較晚(5~20歲),病情相對較輕,進展緩慢,預(yù)后也較差,患者多于40歲左右死于呼吸衰竭或呼吸道感染。 Dystrophin基因定位于Xp21.1~21.3,全長約為2400kb,是目前已知的人類最大的基因,占整個X染色體長度的1%及整個基因組長度的0.1%,其中78個內(nèi)含子為該基因的大部分序列,其79個外顯子編碼序列總長度僅為14kb。Dystrophin基因突變以缺失最為常見,約占55~65%,重復(fù)約占5~10%,1/3左右為新生突變。據(jù)文獻報道98%的缺失斷裂點發(fā)生在內(nèi)含子區(qū)域,缺失斷裂點的分布是非隨機的,內(nèi)含子序列在不同地域及民族中存在顯著性差異。近年來,Chambedain等及Beggs等在兩個缺失熱點區(qū)共設(shè)計了18對引物,建立了檢測本病基因缺失的多重PCR體系,使DMD/BMD的基因診斷方法更簡便準(zhǔn)確,其優(yōu)越性已大大超過Southern印跡分析。Dystrophin基因缺失的分布特點隨地域及民族的差異而有不同特點。我們應(yīng)用12對外引物的多重PCR法對我國東北地區(qū)120例DMD/BMD患者進行缺失篩查,了解缺失型 患者dystrophin基因缺失的斷裂點分布,同時排除內(nèi)含子長度的 影響因素后分析中央缺失熱區(qū)各內(nèi)含子的不穩(wěn)定性及對各引物進 行優(yōu)化組合,并且為29例DMD/BMD高危孕婦開展了遺傳咨詢和 產(chǎn)前基因診斷工作。 實驗材料與方法 臨床診斷為DMD/BMD的來自東北地區(qū)共120例男性患者, 其中BMD 18例均為散發(fā),在102例DMD患者中22例有家族史。 30例對照者均為正常人。每名受檢者采外周靜脈血 1-SInl;29 名DMD/BMD先證者的母親(其中5名有家族史)再次妊娠時要 求作產(chǎn)前基因診斷,于孕早期k5-60天)抽取胎兒絨毛或孕中期 門一20周)抽取革水。 提取外周靜脈血DNA,用多重PCR法檢測患者缺失分布;對 查出缺失的患者用PCR檢測斷裂點分布。從胎兒絨毛或羊水中 提取胎兒DNA后,先用PCR擴增判斷胎兒性別,再行多重PCR擴 增檢測男性胎兒是否缺失。若胎兒為女性或男性胎兒未查出有外 顯子缺失,則行STR單體型連鎖分析(詳見另文人 實驗結(jié)果 120例患者中檢出至少有二個外顯子缺失者為59例門例有 家族史人檢出率為49.2%,其中40例K7.8%)分布于外顯子 45-53,13例(22%)分布于外顯子8-19,5例(8.5%)在這兩個 熱區(qū)內(nèi)均有外顯子缺失,僅有 1例一.7%)檢出外顯子 34和 43缺 失。59例缺失型患者中,斷裂點位于內(nèi)含子44-52內(nèi)占66.4% ,以內(nèi)含子 50為最多(占 14.8%),內(nèi)含子 44j 次之(分別為 11.7%在.6%人大多數(shù)K4.7%)的斷裂點位于內(nèi)含子 o-52 內(nèi)。兩對外顯子引物的優(yōu)化組合為48和8,總檢出率為30.8%, 占12對引物檢出率的62.6%。29例高危胎兒中男性16例K例 ·2· 有家族史人其中9例被檢出為缺失型O例有家族史廠缺失位點 與先證者相同。 結(jié) 論 首次對東北地區(qū)120例DMD瓜MD患者用12對引物進行多 重PCR方法缺失篩查,缺失檢出率為49.2%,缺失主要分布于兩 個熱區(qū)內(nèi):外顯子8-19p2呢)及外顯子45-53K7.8阮X并且 外顯子8附近區(qū)域可能是東北地區(qū) dystrophin基因缺失斷裂的高 發(fā)區(qū)。 東北地區(qū)人群dystroPhin基因內(nèi)含子44J2高度不穩(wěn)定,其 中內(nèi)含子44的穩(wěn)定性要高于中央缺失熱區(qū)分子結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性, 內(nèi)含子50的不穩(wěn)定性存在地區(qū)及種族差異。 本研究所統(tǒng)計的外顯子引物優(yōu)化組合為檢測患者或進行產(chǎn)前 基因診斷時提供了捷徑,我們應(yīng)用多重PCR方法對DMD/BMD高 危男性胎兒進行產(chǎn)前基因診斷,尤其是對散發(fā)家系是可行的并且 有其優(yōu)越性。
【學(xué)位單位】:中國醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2003
【中圖分類】:R394
【部分圖文】:

多重PCR,外顯子,電泳條,引物


為第2組外顯子51、12、50、53引物多重PCR電泳條帶
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本文編號:2852683

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