【摘要】： 生物中的化學(xué)問(wèn)題日益為人們所重視。新興的交叉學(xué)科如化學(xué)生物學(xué)也日益變的重要，它是化學(xué)與生物和醫(yī)學(xué)等學(xué)科領(lǐng)域相互交叉、相互滲透的產(chǎn)物�；瘜W(xué)的理論和方法，被廣泛應(yīng)用于研究生物和醫(yī)學(xué)問(wèn)題。本文主要圍繞著與生物過(guò)程相關(guān)的幾種生物小分子模型，如含氮和含硫氧化物體系，開(kāi)展了一系列的研究工作。全文共分為兩大部分：即分子之間的相互作用部分和電子轉(zhuǎn)移部分。 一、相互作用部分 1．用B3LYP／6-311++G方法對(duì)NO二聚體陽(yáng)離子(NO)_2~+進(jìn)行了研究。幾 何優(yōu)化并結(jié)合振動(dòng)頻率分析表明，該復(fù)合物存在5種可能的穩(wěn)定構(gòu) 型。能量最低的是N-N相連的反式異構(gòu)體，具有C_(2h)對(duì)稱性。分析了 各穩(wěn)定構(gòu)型的相對(duì)穩(wěn)定性及成鍵特征，建立了態(tài)態(tài)相關(guān)并給出異構(gòu) 化過(guò)渡態(tài)，分析了各構(gòu)型之間轉(zhuǎn)化的途徑。 2．在各種計(jì)算方法的基礎(chǔ)上，特別是各種DFT方法，對(duì)(NO)_2可能存 在的構(gòu)型進(jìn)行了尋找，幾何優(yōu)化并結(jié)合振動(dòng)頻率分析表明，，存在7 種可能的穩(wěn)定構(gòu)型。分析了它們的離解能，表明存在5種構(gòu)型以較 強(qiáng)的相互作用相結(jié)合，而另2種構(gòu)型則是以化學(xué)鍵的形式存在。 3．在各種DFT方法水平上對(duì)SNO二重態(tài)的結(jié)構(gòu)和振動(dòng)頻率進(jìn)行了計(jì)算。 結(jié)果顯示存在9種可能的穩(wěn)定構(gòu)型(五種彎曲構(gòu)型、三種近直線構(gòu)型 和一種環(huán)狀構(gòu)型)�；鶓B(tài)結(jié)構(gòu)為彎曲的SNO(~2A′)結(jié)構(gòu)，通過(guò)尋找過(guò) 渡態(tài)和內(nèi)稟反應(yīng)坐標(biāo)分析預(yù)測(cè)了各穩(wěn)定態(tài)之間的態(tài)態(tài)相關(guān)和異構(gòu)化 機(jī)理。結(jié)果表明基態(tài)是最有利的產(chǎn)物。 4．在各種理論方法的基礎(chǔ)上，計(jì)算了SiSO~+和GeSO~+的各種可能的穩(wěn)定 構(gòu)型。結(jié)果顯示各存在四種穩(wěn)定構(gòu)型，并進(jìn)行了振動(dòng)頻率分析。SiSO’ 異構(gòu)體中基態(tài)結(jié)構(gòu)為線性si-O-S~+結(jié)構(gòu)，對(duì)于GeSO~+物種，足以環(huán)狀(~2A”)結(jié)構(gòu) 為基態(tài)。計(jì)算了線性M-OS~+結(jié)構(gòu)的離解能。分析了各構(gòu)型的成鍵特征， 把各構(gòu)型的種類進(jìn)行了歸屬。 汕？帥他人學(xué)燦【：學(xué)位論義 二、電子轉(zhuǎn)移部分 1．介紹了電子轉(zhuǎn)移的一些基本機(jī)理，著重介紹了本文所用到的有關(guān)自 交換電子轉(zhuǎn)移活化模型及計(jì)算耦合體系電子轉(zhuǎn)移速率的理論框架。 理論立足于電子轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵，即當(dāng)一個(gè)分子或離子得到或失去一個(gè) 電子時(shí)所發(fā)生的核平衡構(gòu)型的變化動(dòng)力學(xué)問(wèn)題及決定電子轉(zhuǎn)移的電 子困子問(wèn)題。 2．在計(jì)算幾何構(gòu)型的基礎(chǔ)上，利用上述計(jì)算電子轉(zhuǎn)移的理論，計(jì)算了 NO／NO”體系的電子轉(zhuǎn)移發(fā)生的各種機(jī)理的電子轉(zhuǎn)移速率。并探討了有 關(guān)DFT方法在計(jì)算體系離解能時(shí)的“反對(duì)稱性破壞” 問(wèn)題。反對(duì)稱 破壞是 DFT方法在處理離子問(wèn)題時(shí)電荷平均分布在兩分子片上的一 個(gè)共同現(xiàn)象。說(shuō)明反對(duì)稱破壞可能是沒(méi)有 HF的 DFT交換函數(shù)的內(nèi)在 性質(zhì)。
【學(xué)位授予單位】：曲阜師范大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2003
【分類號(hào)】：Q7

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前2條

1 吳厚銘;化學(xué)生物學(xué)——新興的交叉前沿學(xué)科領(lǐng)域[J];化學(xué)進(jìn)展;2000年04期

2 張瑞勤,步宇翔,李述湯,黃建華,韓克利,何國(guó)鐘;一種選擇從頭算基函數(shù)的有效方法[J];中國(guó)科學(xué)(B輯 化學(xué));2000年05期

本文編號(hào)：2696006