發(fā)布時間：2020-04-18 04:31

【摘要】：短串聯(lián)重復序列(short tandem repeats，STR)是廣泛存在于人類基因組的一類具有長度多態(tài)性的DNA序列。一般由2～6個堿基構(gòu)成一個核心序列，核心序列在長度上呈串聯(lián)重復排列，重復次數(shù)通常在15～30次，核心序列拷貝數(shù)目的變化可產(chǎn)生長度多態(tài)性。一般認為，人類基因組平均每6～10kb就有一個STR基因座，并具有分布廣泛，信息量大，有高度多態(tài)性并遵循孟德爾共顯性遺傳等優(yōu)點，因此成為基因組物理圖譜繪制、遺傳連鎖分析、腫瘤生化研究、法醫(yī)學個體識別、親權(quán)鑒定、組織移植評價的理想標記。 STR的變異提供了大量的遺傳標記，可以用來描述一個群體的遺傳結(jié)構(gòu)，在人類學的研究中有著廣泛的用途。河南地處中原，人口眾多，漢族群體的遺傳學特征對中國北方漢族人群有較好的代表性。本實驗通過對河南漢族群體15個STR基因座進行復合PCR擴增，以期獲得河南漢族群體這些基因座的群體遺傳學數(shù)據(jù)。 材料方法：對進行親子鑒定并無血緣關(guān)系的242名河南漢族個體血樣經(jīng)SDS—蛋白酶K—酚—氯仿抽提法提取基因組DNA，用STR復合位點擴增法對CSF1PO、TPOX、THO1、F13A01、FESFPS、vWA、 鄭州大學2003研究生畢業(yè)論文 河南漢族短串聯(lián)重復序列的遺傳多態(tài)性研究 D165539、D75820、D135317、D125391、D55818、D18551、PAHI3、 D851179、D351358巧個基因座進行擴增，制備6%變性聚丙烯酞 胺凝膠，將PCR產(chǎn)物與等位基因分型標準物同步高壓電泳，凝膠經(jīng)過 固定、染色、顯色三步處理至帶型清晰，通過STR各基因座擴增條帶 與對照等位基因分型標準物的比對，判讀各檢測個體的基因型。用才 檢驗判斷各STR位點的基因型分布是否符合Hardy一Weinberg平衡定 律，Power Stats software軟件計算各基因座觀察雜合度(H)、期 望雜合度(He)、個體識別率(DP)、多態(tài)性信息含量(P工C)、非父 排除率(PE)及匹配概率(PM)，并計算15個位點累積DP、PIC、PM 等統(tǒng)計量。 結(jié)果:河南漢族人群CSFIPO基因座共有8個等位基因，30種基 因型;TPOX基因座存在7個等位基因，18種基因型;THOI基因座 存在7個等位基因，巧種基因型;F13A01存在6個等位基因，14種 基因型;FESFPS基因座存在7個等位基因，18種基因型;v從人存在 8個等位基因，30種基因型;D165539基因座存在9個等位基因，28 種基因型;D7S82O存在9個等位基因，26種基因型;D135317基因 座存在6個等位基因，14種基因型;D125391基因座存在9個等位基 因，26種基因型;D55818基因座存在8個等位基因，22種基因型; D18S51基因座存在n個等位基因，47種基因型;PAH13基因座存在 7個等位基因，20種基因型;D851179基因座存在9個等位基因，33 種基因型;D351358基因座存在7個等位基因，16種基因型;巧個 位點基因座個體識別率分別為0.88、0.824、0.824、0.842、0.863、 0 .933、0.944、0.926、0.936、0.934、0.911、0.955、0.869、0.952、 鄭州大學2003研究生畢業(yè)論文 河南漢族短串聯(lián)重復序列的遺傳多態(tài)性研究 0.856，PIC分別為0.71、0.59、0.60、0.62、0.65、0.79、0.80、 0 .76、0.78、0.79、0.74、0.83、0.68、0.82、0.66，15個STR基 因座的累積個體識別率為0.9999999999999997，，累積非父排除率為 0.999915，累積個體偶合率3.422 x 10一‘6。 對河南漢族、成都漢族、美國黑人、高加索人、西班牙人D7S82O 各等位基因基因頻率分布的才檢驗表明，除了河南漢族與成都漢族外， 其它主要人種間全部存在顯著性差異。 分析304例親子鑒定案件，聯(lián)合排除父權(quán)的有29例(均有4個以 上STR位點不符)，僅一例案件23個位點擴增中出現(xiàn)孩子與父親單位 點不符，推測可能為單位點突變。提示STR應用于法醫(yī)親子鑒定時， 任何情況下都不能根據(jù)單一的STR遺傳標記不符而排除父權(quán)。 結(jié)論:1.對巧個STR遺傳多態(tài)性分析揭示這9個基因座均具有 較好的多態(tài)性，尤其是vWA、D165539、D7S82O、D135317、D125391、 D55818、D18551、D851179基因座的DP均大于0.9，P工C均大于0.7， 為高度多態(tài)性基因座，在法醫(yī)學和人類遺傳學應用方面具有較高的價 值。2.統(tǒng)計分析了河南漢族人群巧個基因座的基因頻率與基因型頻 率，得出15個STR位點累積個體識別率為0.9999999999999997，累積 非父排除率為0.999915，累積個體偶合率3.422 x 10一‘6，即每2.92x 10‘5個人中會有兩個個體的基因型完全相同，為利用sTR進行基因定 位、遺傳病連鎖分析、基因診斷等工作提供了群體遺傳學數(shù)據(jù)。3. D7S82O基因座在河南漢族、成都漢族、美國黑人、高加索人、西班牙 人的xZ檢驗表明，除了河南漢族與成都漢族外，各主要人種間全部 鄭州大學20仍研究生畢業(yè)論文 河南漢族短串聯(lián)重復序列的遺傳多態(tài)性研究 存在顯著性差異。4.分析n個基因座在參與聯(lián)合父權(quán)排除的貢獻度 可見，D125391、vWA、D7S82O參與父權(quán)排除率均在50%以上(D125391 65%)，這些基因座可作為親子鑒定的首選基因座。在304例案件中 僅出現(xiàn)一例單位點突變，而排除父權(quán)的案例中STR位點均出現(xiàn)4個以 上的不符位點。提示1個位點不符不能作為排除父權(quán)的依據(jù)。5.建立 了D55818一D125391、D18551一PAH一D851179一D351358基因座復合位點的 擴增方法，既節(jié)省了實
【學位授予單位】：鄭州大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2003
【分類號】：R394

【相似文獻】

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本文編號：2631715