本文關(guān)鍵詞：云南省鼠類腸道病毒宏基因組研究，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的:對與人類密切相關(guān)的云南家鼠和野鼠腸道中病毒宏基因組進行系統(tǒng)的研究和分析;闡明鼠類腸道病毒的遺傳多樣性以及與動物和人類病毒的遺傳進化關(guān)系。豐富我們對自然環(huán)境中未知鼠類病毒的認識,為預(yù)防和控制由鼠傳播的新發(fā)病毒性疾病的暴發(fā)和流行提供科學指導。方法:本項目在前期鼠病毒研究的基礎(chǔ)上,結(jié)合宏基因組學、隨機PCR和高通量測序技術(shù),在不知病毒任何遺傳背景的情況下,從基因組角度高通量對取自云南省7個地區(qū)的212份樣本進行宏基因組分析。結(jié)果:檢測到的鼠類病毒可以歸到36個病毒科中。其中RNA病毒包括小核糖核酸病毒科、二順反子病毒科、無法歸類的病毒目、Secoviridae、呼腸孤病毒科、逆轉(zhuǎn)錄病毒科、蓋病毒科、番茄叢矮病毒科、整體病毒科、環(huán)病毒科、Alphatetraviridae、星狀病毒科、布尼亞病毒科、Carmotetraviridae、長線形病毒、虹彩病毒科、光滑病毒科、羅達病毒科、微小核糖核酸病毒科;而DNA病毒包括了長尾病毒科、肌病毒科、無法歸類的有尾噬菌體目、短尾病毒科、皰疹病毒科、多瘤病毒科、腺病毒科、雙DNA病毒科、環(huán)病毒科、聯(lián)體病毒科、絲形病毒科、馬賽病毒科、微病毒科、擬態(tài)病毒科、分體病毒科、細小病毒科、藻類去氧核糖核酸病毒科和未非分類的病毒。結(jié)論:云南省鼠類腸道病毒共檢測到36個病毒科;發(fā)現(xiàn)了一種新型鼠腺病毒;病毒宏基因組學是分析鼠類腸道病毒的好方法。
【關(guān)鍵詞】：云南 鼠類 腸道病毒 宏基因組
【學位授予單位】：大理學院
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2015
【分類號】：R373.25
【目錄】：

• 英文縮略詞4-5
• 中文摘要5-6
• Abstract6-7
• 前言7-14
• 1 鼠類與人類關(guān)系緊密7
• 2 鼠類是病毒的天然儲藏庫7-8
• 3 目前我國對鼠源性病毒的研究狀況8-9
• 4 宏基因組學的優(yōu)越性9-11
• 5 鼠類腸道病毒的宏基因組研究進展11-13
• 6 病毒宏基因組學的主要技術(shù)路線13
• 7 課題的意義13-14
• 材料與方法14-35
• 1 材料14-21
• 2 方法21-35
• 結(jié)果35-50
• 1 12份樣品隨機PCR的結(jié)果35-37
• 2 測序結(jié)果及讀段（reads）拼接分析37-38
• 3 針對拼接得到的所有重疊群序列，進行了 BLASTx/n 的比對分析38-39
• 4 對病毒相關(guān)的重疊群序列，根據(jù)具體的病毒科，進一步進行了病毒分類39-41
• 5 各病毒科相關(guān)重疊群分析41-50
• 討論50-53
• 結(jié)論53-54
• 參考文獻54-59
• 綜述59-66
• 參考文獻63-66
• 致謝66

【參考文獻】

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1 張云智,龔正達,馮錫光,段興德,吳厚永,翁學,呂元;云南白草嶺鼠形小獸群落結(jié)構(gòu)及垂直分布[J];動物學雜志;2002年02期

  本文關(guān)鍵詞：云南省鼠類腸道病毒宏基因組研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號：258181