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中華按蚊和雷氏按蚊的微衛(wèi)星DNA庫構建及多態(tài)位點的篩選

發(fā)布時間:2020-01-26 01:26
【摘要】: 中華按蚊(Anopheles sinensis)和雷氏按蚊(An. lesteri)(原嗜人按蚊An. anthropophagus)是我國分布廣且常見的蚊種,是其分布區(qū)瘧疾的重要傳播媒介,實施有效的蚊媒防制手段是瘧疾控制的重要環(huán)節(jié),而蚊媒的生物學特性是制定防制策略的基礎。本研究擬構建中華按蚊和嗜人按蚊的微衛(wèi)星DNA庫,并篩選其中多態(tài)的微衛(wèi)星位點,其微衛(wèi)星DNA序列庫可為按蚊基因組學研究積累基礎資料;多態(tài)的微衛(wèi)星DNA位點將為中華按蚊和雷氏按蚊的基因定位、群體遺傳結構和生態(tài)學等領域的研究提供新的分子標志。 本研究應用基因組DNA的酶切片段與生物素標記的(AAT)17,(GA)25,(CCT)17,(AC)25,(CAG)17,(CA)18,(CAC)5,(TC)10,(GT)8和(TG)18等寡核苷酸探針雜交,結合親合素富集和超濾離心濃縮,首先將基因組DNA中含微衛(wèi)星DNA的片段富集,經(jīng)3次PCR擴增放大后,插入T載體,轉(zhuǎn)化大腸桿菌(E. coli),篩選含微衛(wèi)星DNA序列的陽性克隆,測定分析其序列,完成中華按蚊和雷氏按蚊微衛(wèi)星DNA庫的構建。在構建中華按蚊微衛(wèi)星DNA庫的基礎上,挑選合適的微衛(wèi)星位點,設計、合成引物,建立各微衛(wèi)星位點的PCR擴增體系。應用經(jīng)分子鑒別的中華按蚊現(xiàn)場樣本,聚丙烯酰氨凝膠電泳和基因掃描篩選具有多態(tài)性的微衛(wèi)星位點。 本研究獲得的結果如下: 1.構建的中華按蚊微衛(wèi)星DNA序列庫中包含282條序列,其中9條序列完全相同,故獨立的微衛(wèi)星DNA序列共273條。 2.本研究的中華按蚊微衛(wèi)星DNA序列庫中雙核苷酸重復最為常見,三核苷酸重復次之,多核苷酸重復少見,其中以(CA)n和(GT)n的微衛(wèi)星DNA序列含量最為豐富,重復次數(shù)最多的可達54次。其中完整的微衛(wèi)星DNA序列89個,占32.6%;非完整的序列82個,占30.1%;其余為復合序列,占37.3%。 3.筆者在構建的中華按蚊微衛(wèi)星DNA庫中,選取了22條適當?shù)男蛄?設計、合成引物,建立了PCR擴增體系,結果顯示其中15對引物有特異擴增條帶。 4.經(jīng)過對現(xiàn)場樣本的分子鑒別,選用確認的中華按蚊4個群體的40個樣本,PCR擴增各微衛(wèi)星位點,檢測結果顯示有10個微衛(wèi)星位點存在多態(tài)性,即:AS5,AS6,AS9,AS13,AS14,AS15,AS16,AS22,AS31和AS43。 5.本研究分離獲得61條雷氏按蚊的微衛(wèi)星DNA序列,其中獨立的序列共60條。
【圖文】:

酶切圖,中華按蚊,基因組DNA,序列分析方法


第二軍醫(yī)大學碩士學位論文司,四色熒光標記的雙脫氧鏈終止法測序,常用 T 載體上通用引物(如:M13+)。2.12 序列分析方法測序結果以 Chromas 軟件進行核對,必要時采用 Clustal X 進行源性和差異性采用 Bioedit 和 Mega 軟件整理和分析。3 結果與討論3.1 酶切基因組 DNA、膠回收酶切片段M1 - 1 2 3 M2

中華按蚊,富集,基因組DNA,片段


圖 1-2 中華按蚊基因組 DNA 酶切片段連接產(chǎn)物 P泳道 1-4:連接產(chǎn)物的 PCR 產(chǎn)物;M:DN連接有 SAU 接頭的膠回收 DNA 片段作為 PCR 反應模物進行 PCR 擴增,,擴增產(chǎn)物片段應集中在 200 - 900 b與酶切基因組 DNA 后收集的的片段應大小一致,提示效的。3 PCR 富集微衛(wèi)星 DNA
【學位授予單位】:第二軍醫(yī)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2007
【分類號】:R384

【參考文獻】

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1 馬雅軍,瞿逢伊,徐建農(nóng),鄭哲民;用核糖體DNA鑒別PCR區(qū)分中華按蚊和嗜人按蚊[J];第二軍醫(yī)大學學報;1998年03期

2 宋鋒林,趙彤言,董言德,曹曉梅,李春曉;淡色庫蚊(Culexpipiens pallens)微衛(wèi)星DNA位點的克隆[J];寄生蟲與醫(yī)學昆蟲學報;2004年03期

3 孫德建;我國防治絲蟲病成績卓著[J];中國寄生蟲病防治雜志;2002年02期

4 周水森;湯林華;盛慧鋒;王漪;;2004年全國瘧疾形勢[J];中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志;2006年01期

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本文編號:2573166

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