【摘要】：目的篩選空間環(huán)境誘變的肺炎克雷伯菌突變株及并進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組分析。方法利用Biolog生化反應(yīng)板從搭載于神舟八號(hào)飛船的肺炎克雷伯菌中篩選突變株,然后采用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)突變株全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,原始測(cè)序數(shù)據(jù)經(jīng)處理后進(jìn)行基因表達(dá)注釋和差異表達(dá)基因的基因本體功能及京都基因與基因組信號(hào)通路注釋分析。結(jié)果空間搭載的肺炎克雷伯菌突變株在糖類代謝上出現(xiàn)差異,且該菌株有232個(gè)基因表達(dá)上調(diào),1 879個(gè)基因下調(diào),其主要同細(xì)菌的膜蛋白、轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)功能、糖類的運(yùn)輸相關(guān)。結(jié)論獲得一株空間環(huán)境誘導(dǎo)的肺炎克雷伯菌突變株且該菌株全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和注釋清晰,為后續(xù)的功能研究奠定了基礎(chǔ)。
【作者單位】： 解放軍總醫(yī)院南樓呼吸科;武警總醫(yī)院呼吸科;深圳華大基因研究院;
【基金】：國(guó)家“973”重點(diǎn)基礎(chǔ)研究計(jì)劃(2014CB744400) 武器預(yù)研重點(diǎn)基金(9140A26040312JB10078) 載人航天領(lǐng)域項(xiàng)目(040203) 國(guó)家自然科學(xué)基金(81350020)~~
【分類號(hào)】：R378

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2541671