【摘要】：目的:為進(jìn)一步了解人白細(xì)胞介素(IL)-38蛋白質(zhì)的特性和B細(xì)胞表位,從GenBank中查得其序列,用生物信息學(xué)等方法預(yù)測(cè)人IL-38蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)等特性,并對(duì)其B細(xì)胞表位進(jìn)行預(yù)測(cè)。方法:應(yīng)用ProtParam tool、ProtScale、Emini和Kolaskar等程序或方法,對(duì)IL-38的組成、理化特性、親水性、柔韌性和可及性等進(jìn)行分析,以進(jìn)一步預(yù)測(cè)其二級(jí)結(jié)構(gòu)和抗原表位。結(jié)果:IL-38的二級(jí)結(jié)構(gòu)主要由無規(guī)則卷曲(44.08%)和β-折疊(39.47%)組成。其B細(xì)胞表位可能位于第26-36、45-55、78-98和124-143等氨基酸區(qū)段。結(jié)論:首次利用生物信息學(xué)方法對(duì)IL-38基因及其蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)進(jìn)行了分析和預(yù)測(cè),預(yù)測(cè)結(jié)果將有助于確定IL-38的B細(xì)胞表位,為IL-38基因功能的深入研究及研制IL-38單克隆抗體提供了理論依據(jù)。
[Abstract]:Objective: to further understand the characteristics of human interleukin-38 (IL)-38) protein and B-cell epitope, to obtain its sequence from GenBank, and to predict the secondary structure and other properties of human IL-38 protein by bioinformatics. B cell epitopes were predicted. Methods: the composition, physicochemical properties, hydrophilicity, flexibility and accessibility of IL-38 were analyzed by ProtParam tool,ProtScale,Emini and Kolaskar, so as to predict its secondary structure and antigen epitope. Results: the secondary structure of IL-38 was mainly composed of irregular crimping (44.08%) and 尾-fold (39.47%). The B cell epitopes may be located in amino acid regions 26-36, 45-55, 78-98 and 124-14. Conclusion: bioinformatics was used to analyze and predict the structure of IL-38 gene and its protein for the first time. The predicted results will be helpful to identify the B cell epitopes of IL-38. It provides a theoretical basis for the further study of the function of IL-38 gene and the development of monoclonal antibody against IL-38.
【作者單位】： 寧波大學(xué)醫(yī)學(xué)院免疫學(xué)研究室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(“阻抑IL-33/ST2信號(hào)對(duì)慢性阻塞性肺疾病氣道炎癥的作用及機(jī)制”,No.81070034) 寧波市科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目(“寧波市消化系統(tǒng)惡性腫瘤診治新技術(shù)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)”,2011B82014) 浙江省教育廳科研項(xiàng)目(Y201327689) 寧波大學(xué)學(xué)科項(xiàng)目(XKL11D2112,XKL11D2113)資助
【分類號(hào)】：R392

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2465655