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人骨髓間質(zhì)干細(xì)胞誘導(dǎo)成骨分化過程中差異表達(dá)蛋白的質(zhì)譜鑒定及生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2018-11-13 18:13
【摘要】:目的比較人骨髓間質(zhì)干細(xì)胞(h MSCs)誘導(dǎo)成骨分化過程中的蛋白質(zhì)組差異,尋找h MSCs成骨分化相關(guān)蛋白質(zhì)。方法體外培養(yǎng)h MSCs并誘導(dǎo)成骨分化,收集h MSCs和成骨誘導(dǎo)分化3 d的細(xì)胞的全蛋白,應(yīng)用雙向凝膠電泳(2-DE)分離和圖像分析軟件進(jìn)行蛋白質(zhì)點(diǎn)的識別和檢測,通過比較蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)找出凝膠上差異2.0倍以上的蛋白質(zhì)點(diǎn),應(yīng)用基質(zhì)輔助激光解析離子化飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI-TOF-MS)和生物信息學(xué)方法對差異蛋白點(diǎn)進(jìn)行蛋白質(zhì)的鑒定和分析。結(jié)果 h MSCs在體外成功誘導(dǎo)成骨分化,通過2-DE分離、MALDI-TOF-MS分析和生物信息學(xué)方法鑒定出了38種差異蛋白,其中22種蛋白質(zhì)在成骨誘導(dǎo)3 d后表達(dá)明顯上調(diào),16種蛋白質(zhì)在成骨誘導(dǎo)3 d后表達(dá)明顯下調(diào)。利用Gene Ontology對所鑒定的蛋白質(zhì)按分子功能和生物學(xué)途徑進(jìn)行分析顯示,參與體內(nèi)代謝、發(fā)育過程、催化反應(yīng)和酶調(diào)節(jié)活性的蛋白質(zhì)分別占29%、32%、44%、16%。結(jié)論蛋白質(zhì)組學(xué)較好地顯示了h MSCs誘導(dǎo)成骨分化過程中的蛋白質(zhì)表達(dá)差異,這為進(jìn)一步闡明h MSCs成骨分化的分子機(jī)制提供了新的思路。
[Abstract]:Objective to compare the proteome differences of human bone marrow mesenchymal stem cells (BMSCs) during osteogenic differentiation induced by (h MSCs), and to search for the related proteins of h MSCs osteogenic differentiation. Methods MSCs was cultured in vitro and osteogenic differentiation was induced. The whole proteins of the cells with h MSCs and osteogenic differentiation for 3 days were collected. The protein spots were identified and detected by two dimensional gel electrophoresis (2-DE) separation and image analysis software. By comparing proteomics techniques, we found the protein spots on the gel that were 2.0 times different. The differential protein spots were identified and analyzed by matrix assisted laser ionization time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF-MS) and bioinformatics. Results h MSCs successfully induced osteogenic differentiation in vitro. 38 differentially expressed proteins were identified by 2-DE isolation, MALDI-TOF-MS analysis and bioinformatics, of which 22 proteins were up-regulated 3 days after osteogenesis induction. The expression of 16 proteins was down-regulated 3 days after osteogenesis induction. According to the molecular function and biological pathway, the proteins identified by Gene Ontology showed that the proteins involved in metabolism, development, catalytic reaction and enzyme regulation activities accounted for 2932% and 444.16%, respectively. Conclusion Proteomics shows the difference of protein expression in the process of h MSCs induced osteogenesis, which provides a new idea for further elucidating the molecular mechanism of h MSCs osteogenic differentiation.
【作者單位】: 嘉應(yīng)學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院;中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院干細(xì)胞與組織工程中心;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(編號:81000681、81000177)
【分類號】:R329.2

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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本文編號:2330008


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