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microRNA在胚胎干細(xì)胞分化的心肌細(xì)胞中的表達(dá)變化

發(fā)布時(shí)間:2018-11-05 12:24
【摘要】:胚胎干細(xì)胞(embryonic stem cells,ESCs)具有自我更新和多向分化的特性。近年研究顯示轉(zhuǎn)錄后調(diào)控包括micro RNAs(mi RNAs)的調(diào)控在ESC心肌細(xì)胞分化(ESC-derived cardiomyocytes,ESCM)命運(yùn)決定中起著重要作用。然而對(duì)決定ESC分化命運(yùn)的mi RNAs的了解還非常有限。為了進(jìn)一步認(rèn)識(shí)mi RNAs對(duì)心肌細(xì)胞分化的調(diào)控作用,本研究采用經(jīng)典的懸滴法誘導(dǎo)小鼠ESC(m ESC)分化成心肌細(xì)胞,采用安捷倫8×15k小鼠mi RNAs芯片(mi Rbase V16.0)比較了富含跳動(dòng)心肌細(xì)胞區(qū)域與非跳動(dòng)區(qū)域mi RNAs表達(dá)譜的異同,發(fā)現(xiàn)與非跳動(dòng)區(qū)域相比,跳動(dòng)區(qū)域中有19個(gè)mi RNAs發(fā)生了5倍以上的表達(dá)變化(n=3,P0.05),其中5個(gè)mi RNAs表達(dá)上調(diào)、14個(gè)mi RNAs表達(dá)下調(diào)。采用定量RT-PCR進(jìn)一步分析了mi RNAs芯片中差異倍數(shù)大于10的mi RNAs,證明mi R-196a,mi R-196b和mi R-467e在心肌細(xì)胞跳動(dòng)區(qū)域的表達(dá)豐度明顯低于非跳動(dòng)區(qū)域(n=3,P0.05)。用Target Scan數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)mi R-196a和mi R-196b進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè),發(fā)現(xiàn)其可能與心肌細(xì)胞分化呈負(fù)相關(guān),提示其在ESC分化命運(yùn)決定中可能具有一定的調(diào)控作用。這些結(jié)果為進(jìn)一步明確mi RNAs在ESC分化的心肌細(xì)胞中的作用提供了新線索。
[Abstract]:Embryonic stem cell (embryonic stem cells,ESCs) has the characteristics of self-renewal and multi-differentiation. Recent studies have shown that posttranscriptional regulation, including the regulation of micro RNAs (mi RNAs), plays an important role in determining the fate of cardiomyocyte differentiation (ESC-derived cardiomyocytes,ESCM) in ESC. However, the knowledge of mi RNAs, which determines the fate of ESC differentiation, is still very limited. In order to further understand the regulation of mi RNAs on cardiomyocyte differentiation, the classical suspension method was used to induce ESC (m ESC) to differentiate into cardiomyocytes. Agilent 8 脳 15k mouse mi RNAs chip (mi Rbase V16.0 was used to compare the mi RNAs expression profiles between the regions rich in beating cardiomyocytes and those in non-beating areas. There were more than 5 fold changes in the expression of 19 mi RNAs in the beating region (nang3p0.05), 5 of which were up-regulated and 14 of mi RNAs were down-regulated. Quantitative RT-PCR was used to further analyze the difference ratio of mi RNAs, in mi RNAs chip. The results showed that the expression abundance of mi R-196aanmi R-196b and mi R-467e in the beating region of cardiomyocytes was significantly lower than that in the non-beating region (nnc3p0.05). The target genes of mi R-196a and mi R-196b were predicted by using Target Scan database. It was found that the target genes were negatively correlated with the differentiation of cardiomyocytes, suggesting that they may play a role in regulating the fate of ESC differentiation. These results provide a new clue to further clarify the role of mi RNAs in ESC differentiated cardiomyocytes.
【作者單位】: 上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院/中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院健康科學(xué)研究所 中國(guó)科學(xué)院干細(xì)胞生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:supported by the National Basic Research Development Program of China(No.2011CB965301,2014CB965100) the Strategic Priority Research Program of Chinese Academy of Sciences,China(No.XDA01020204,GJHZ1225) the National Science and Technology Major Project of China(No.2012ZX09501001)
【分類號(hào)】:R329.2

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2312071

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