【摘要】：隨著生物技術(shù)及信息技術(shù)的蓬勃發(fā)展,免疫學(xué)的研究方式在后基因組時(shí)代也將發(fā)生根本性的變革。我們不僅要面對(duì)已經(jīng)存在的海量數(shù)據(jù),還要關(guān)注那些成指數(shù)增長(zhǎng)的新的免疫學(xué)相關(guān)數(shù)據(jù)。因此如何提高對(duì)這些信息的提取和分析能力是進(jìn)行有效的免疫學(xué)研究的重要保證。目的:本研究項(xiàng)目旨在利用現(xiàn)有抗體相關(guān)生物信息資源,開(kāi)發(fā)具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的軟件工具,建立一個(gè)功能完備的,適用于抗體及其基因序列分析的平臺(tái)。同時(shí)利用該系統(tǒng)對(duì)現(xiàn)有的治療性抗體進(jìn)行有效分析,為其進(jìn)一步的抗體藥物改造提供可靠的理論依據(jù)。從而試圖改變傳統(tǒng)的實(shí)驗(yàn)室研究模式,提高研究效率,促進(jìn)抗體的研究以及相關(guān)藥物的應(yīng)用開(kāi)發(fā)。方法:設(shè)計(jì)了性能良好,風(fēng)格統(tǒng)一,用戶友好的生物應(yīng)用接口和用戶界面;整合了已有的生物信息應(yīng)用工具、處理程序,建立了功能完善,文檔和支持強(qiáng)大的生物應(yīng)用系統(tǒng)平臺(tái);同時(shí)針對(duì)抗體研究的特殊性,開(kāi)發(fā)了具有特殊處理功能的程序,并將研究密切相關(guān)的數(shù)據(jù)和信息資源本地化以方便應(yīng)用開(kāi)發(fā).而后利用該系統(tǒng)對(duì)抗-gp120抗體和鼠HAb18單克隆抗體進(jìn)行了相關(guān)分析。結(jié)果:1.抗體序列分析的系統(tǒng)的搭建:成功開(kāi)發(fā)了一套具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的用于抗體序列分析的生物信息軟件集成系統(tǒng)AbSAS,該系統(tǒng)能成功實(shí)現(xiàn)對(duì)抗體核酸及蛋白質(zhì)一級(jí)序列的分析,并可利用Threading及同源模建的方法實(shí)現(xiàn)對(duì)抗體三維結(jié)構(gòu)的模擬,是一較為全面的抗體分析平臺(tái)。2.現(xiàn)有抗體分
[Abstract]:With the rapid development of biotechnology and information technology, the research methods of immunology will also undergo fundamental changes in the post-genome era. Not only do we have to deal with the huge amounts of data that already exist, but we also have to look at new immunological data that are exponentially growing. Therefore, how to improve the ability of extracting and analyzing these information is an important guarantee for effective immunological research. Objective: the purpose of this research project is to develop a software tool with independent intellectual property rights using existing antibody related biological information resources and to establish a functional platform suitable for antibody and gene sequence analysis. At the same time, the system is used to analyze the existing therapeutic antibodies effectively, which provides a reliable theoretical basis for the further modification of antibody drugs. Therefore, we try to change the traditional laboratory research model, improve the efficiency of research, promote the research of antibodies and the application and development of related drugs. Methods: the bioapplication interface and user interface with good performance, uniform style and user friendly were designed, and the existing bioinformatics application tools and procedures were integrated, and the functions were improved. At the same time, according to the particularity of antibody research, a program with special processing function is developed, and the closely related data and information resources are localized to facilitate application and development. Then the system was used to analyze the correlation between anti-gp 120 antibody and mouse HAb18 monoclonal antibody. The result is 1: 1. The establishment of antibody sequence analysis system: a set of bioinformatics software integrated system (AbSAS,) with independent intellectual property rights for antibody sequence analysis has been successfully developed. The system can successfully realize the analysis of antibody nucleic acid and protein first order sequence. The method of Threading and homologous modeling can be used to simulate the three-dimensional structure of antibody, which is a more comprehensive antibody analysis platform. 2. Existing antibody score
【學(xué)位授予單位】：第四軍醫(yī)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2005
【分類(lèi)號(hào)】：S852.43;R392.1

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本文編號(hào)：2261159