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人睪丸蛋白質(zhì)表達譜的構建及精子發(fā)生相關蛋白質(zhì)組學研究

發(fā)布時間:2018-10-09 11:57
【摘要】:睪丸是重要的男性生殖腺,其主要作用是產(chǎn)生精子和雄性激素。在整體水平上對人睪丸的蛋白質(zhì)表達譜進行分析,將為闡明精子發(fā)生以及男性生殖調(diào)控的分子機理提供重要信息。基于這一目的,本研究利用蛋白質(zhì)組學的技術手段研究了正常人睪丸組織的蛋白組成并建立了人睪丸蛋白質(zhì)的參考數(shù)據(jù)庫。我們利用雙向凝膠電泳對正常人睪丸蛋白進行了分離,在硝酸銀染色后將所有可見的蛋白點切取下來,經(jīng)胰蛋白酶消化以后用MALDI-TOF質(zhì)譜儀進行鑒定。成功鑒定的979個蛋白點對應于541種蛋白質(zhì)。這些蛋白質(zhì)信息依照WORLD-2DPAGE國際雙向電泳數(shù)據(jù)庫聯(lián)盟的標準構建了可供全球共享的人睪丸蛋白質(zhì)的參考數(shù)據(jù)庫(http://reprod.njmu.edu.cn/cgi-bin/2d/2d.cgi)。利用生物信息學分析我們對每一種蛋白質(zhì)的分子功能、參與的生物學過程等進行了詳細注釋,發(fā)現(xiàn)約占80%的蛋白質(zhì)參與了代謝過程。依據(jù)Kegg數(shù)據(jù)庫和BioCarta數(shù)據(jù)庫收錄的代謝通路我們分析了人睪丸組織特征性的代謝途徑,在兩個不同數(shù)據(jù)庫的分析結果中均具有顯著意義的代謝通路包括糖酵解通路和精氨酸的代謝通路,此外、在睪丸組織中還存在著由泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導的蛋白質(zhì)代謝等20余條特征性的代謝通路。除參與了代謝過程以外,人睪丸組織中蛋白質(zhì)還具有一系列其它重要功能,如結合蛋白質(zhì)和核苷酸、具有水解酶和氧化還原酶的活性、結合離子等。利用Pathway Assist軟件,,我們構建了人睪丸蛋白質(zhì)的分子調(diào)控網(wǎng)絡,從中可以看出,在人睪丸組織中眾多蛋白質(zhì)共同參與調(diào)控的主要有細
[Abstract]:The testis are important male gonads that produce sperm and testosterone. The analysis of the protein expression profile of human testis at the whole level will provide important information for elucidating the molecular mechanism of spermatogenesis and male reproductive regulation. For this purpose, the proteomics technique was used to study the protein composition of normal human testis and the reference database of human testis protein was established. The normal human testicular proteins were separated by two-dimensional gel electrophoresis. After silver nitrate staining, all the visible protein spots were cut off, then digested by trypsin and identified by MALDI-TOF mass spectrometry. The 979 protein spots identified successfully corresponded to 541 proteins. According to the standard of WORLD-2DPAGE, the reference database of human testicular protein (http://reprod.njmu.edu.cn/cgi-bin/2d/2d.cgi) is constructed. Using bioinformatics to analyze the molecular functions and biological processes of each protein, we found that about 80% of the proteins were involved in the metabolic process. Based on the metabolic pathways recorded in Kegg and BioCarta databases, we analyzed the characteristic metabolic pathways of human testis. Significant metabolic pathways were found in two different databases, including glycolytic pathway and arginine pathway. There are more than 20 characteristic metabolic pathways such as protein metabolism mediated by ubiquitin-proteasome system in testis. In addition to participating in the metabolic process, proteins in human testis also have a series of other important functions, such as binding proteins and nucleotides, hydrolase and oxidoreductase activities, binding ions and so on. Using Pathway Assist software, we constructed the molecular regulatory network of human testicular protein, from which we can see that in human testicular tissue, many proteins are mainly involved in the regulation.
【學位授予單位】:南京醫(yī)科大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2006
【分類號】:R321

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本文編號:2259251


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