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抑制劑Amprenavir與HIV-2蛋白酶作用機制的分子動力學研究

發(fā)布時間:2018-10-08 10:32
【摘要】:HIV-2蛋白酶已成為治療艾滋病的一個重要藥物靶標。作者采用分子動力學模擬并結合自由能計算,研究了抑制劑Amprenavir(AMP)與HIV-2蛋白酶的作用機制。研究結果表明范德華作用是AMP與HIV-2蛋白酶結合的主要力量。采用基于殘基的自由能分解方法計算抑制劑-殘基相互作用,結果表明疏水性的CH-π和CH-O相互作用驅動了抑制劑AMP與HIV-2蛋白酶的結合。作者期望這一研究結果能為抗艾滋病雙重抑制劑的研發(fā)提供一定的理論指導。
[Abstract]:HIV-2 protease has become an important drug target for the treatment of AIDS. The interaction mechanism of inhibitor Amprenavir (AMP) with HIV-2 protease was studied by molecular dynamics simulation and free energy calculation. The results show that van der Waals interaction is the main force of the binding of AMP and HIV-2 protease. The free energy decomposition method based on residue was used to calculate the depressant residue interaction. The results showed that the interaction of hydrophobic CH- 蟺 and CH-O driven the binding of inhibitor AMP and HIV-2 protease. The authors hope that this study will provide some theoretical guidance for the development of anti-AIDS dual inhibitors.
【作者單位】: 山東交通學院辦公室;山東交通學院理學院;山東師范大學物理與電子科學學院;
【基金】:國家自然科學基金項目(11104164,11274206和31200545) 山東省自然科學基金項目(ZR2011HM048) 山東交通學院博士啟動資金 校自然基金項目~~
【分類號】:R341

【參考文獻】

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【共引文獻】

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【二級參考文獻】

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本文編號:2256444

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