發(fā)布時(shí)間：2018-10-05 16:00

【摘要】： 腸道菌群在宿主的營(yíng)養(yǎng)、代謝以及保護(hù)宿主免受外界侵襲等方面都起到非常重要的作用,而很多腸道疾病的發(fā)生、發(fā)展也與腸道菌群結(jié)構(gòu)的變化有著密切的聯(lián)系。本論文分別選擇了一種感染性疾病和一種非感染性疾病,即輪狀病毒感染腹瀉和潰瘍性結(jié)腸炎,用分子生態(tài)學(xué)的方法研究了患者腸道菌群組成變化和疾病發(fā)生、發(fā)展的關(guān)系。 輪狀病毒感染腹瀉在五歲以下兒童中有很高的發(fā)病率和致死率,目前還沒(méi)有有效的疫苗,有研究表明益生菌制劑對(duì)輪狀病毒感染的腹瀉有一定的療效,提示調(diào)節(jié)腸道菌群可能對(duì)治療有作用,但是發(fā)生輪狀病毒感染腹瀉以后,腸道微生物組成特點(diǎn)還不明確。本研究直接從糞便樣品中混合菌群的總DNA出發(fā),通過(guò)種屬專一性的引物研究了年齡相當(dāng)?shù)?例輪狀病毒感染兒童與12例健康兒童腸道菌的主要成員--擬桿菌(Bacteroides)在腹瀉發(fā)病過(guò)程中的數(shù)量和組成變化。實(shí)時(shí)定量PCR結(jié)果表明,輪狀病毒感染個(gè)體腸道內(nèi)擬桿菌的16S rRNA基因拷貝數(shù)與健康個(gè)體相比平均下降了2個(gè)數(shù)量級(jí),具有顯著性差異(P0.05)。為了獲得擬桿菌的組成結(jié)構(gòu)的信息,對(duì)每一個(gè)個(gè)體分別構(gòu)建一個(gè)擬桿菌專一性的文庫(kù),健康組測(cè)序665條,輪狀病毒感染組測(cè)序284條,將這些序列按照98%的相似性劃分為34個(gè)OTU。利用偏最小二乘判別法(Partial least squares discriminant analysis,PLS-DA)對(duì)這34個(gè)OTU進(jìn)行分析,結(jié)果表明輪狀病毒感染導(dǎo)致腸道內(nèi)擬桿菌組成結(jié)構(gòu)發(fā)生了變化,通過(guò)擬桿菌的組成可以將健康個(gè)體與輪狀病毒感染個(gè)體分開(kāi),而對(duì)于區(qū)分兩組個(gè)體起關(guān)鍵作用的OTU分別與Bacteroides vulgatus(普通擬桿菌) ,Bacteroides stercoris(糞便擬桿菌)和Bacteroides fragilis (脆弱擬桿菌)有很高的同源性。其中,與Bacteroides vulgatus,Bacteroides stercoris相關(guān)的OTU在健康個(gè)體中含量和豐度比較高,而與Bacteroides fragilis相關(guān)的OTU則在輪狀病毒感染組的含量和豐度比較高。本研究還表明,將多變量統(tǒng)計(jì)方法用于分析克隆文庫(kù)數(shù)據(jù)可以揭示出腸道菌群在擾動(dòng)下的變化情況,并能鑒定出關(guān)鍵種類,該方法對(duì)于研究臨床上某些疾病的病因,篩選有重要意義的生物標(biāo)記物,評(píng)價(jià)某些藥物的治療效果等方面都具有很高的實(shí)用價(jià)值。 潰瘍性結(jié)腸炎(Ulcerative Colitis, UC)是一種急性或者慢性的炎癥性大腸炎,該病的病因目前未知,但是很多動(dòng)物實(shí)驗(yàn)表明腸道菌群與該病的發(fā)生和發(fā)展有密切關(guān)系。通過(guò)PCR-DGGE技術(shù)比較24例潰瘍性結(jié)腸炎患者腸道內(nèi)潰瘍粘膜以及與潰瘍粘膜相距5cm的非潰瘍粘膜所黏附的優(yōu)勢(shì)菌以及擬桿菌、柔嫩梭菌、乳酸菌和雙歧桿菌的組成情況,結(jié)果表明同一腸段兩個(gè)部位的優(yōu)勢(shì)菌組成很相似,而柔嫩梭菌及乳酸菌的組成存在很大的差異。同時(shí)本論文還研究了不同的患病部位對(duì)于腸道粘膜黏附菌組成的影響,結(jié)果發(fā)現(xiàn)無(wú)論是結(jié)腸型潰瘍還是直腸型潰瘍,乳酸菌在潰瘍部位和非潰瘍部位的組成都有很大差異,而柔嫩梭菌僅在直腸型潰瘍中有差異,表明不同的患病部位對(duì)于細(xì)菌組成的變化也有一定的影響。另外,長(zhǎng)雙歧桿菌(B.longum,99%同源)條帶在潰瘍性結(jié)腸炎患者中出現(xiàn)的頻率減少。通過(guò)目前的分析沒(méi)有找到潰瘍部位或者非潰瘍部位特有的菌群圖譜,只觀察到部分類群的整體結(jié)構(gòu)的改變。 本研究表明,無(wú)論是感染性疾病還是病因未明的非感染性疾病的發(fā)生發(fā)展都與腸道菌群的結(jié)構(gòu)變化有著密切的關(guān)系。通過(guò)測(cè)定這種變化,有可能找到對(duì)腸道健康有指示作用的分子生態(tài)標(biāo)識(shí)物,同時(shí)對(duì)理解腸道菌群結(jié)構(gòu)與人體健康的關(guān)系提供新的啟示。
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【學(xué)位授予單位】：上海交通大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2007
【分類號(hào)】：R574;R37

【引證文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前4條

1 連曉蔚;彭喜春;;腸道菌群利用去淀粉麥麩體外發(fā)酵產(chǎn)短鏈脂肪酸[J];暨南大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)與醫(yī)學(xué)版);2011年03期

2 連曉蔚;彭喜春;;不同腸道菌群利用低聚異麥芽糖體外發(fā)酵產(chǎn)短鏈脂肪酸的初步研究[J];食品與發(fā)酵工業(yè);2011年06期

3 李靜芳;湯水平;張素文;彭燦;肖蓮榮;;實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)在食品檢測(cè)中的應(yīng)用[J];實(shí)用預(yù)防醫(yī)學(xué);2008年06期

4 韓曉霞;侯天舒;楊陽(yáng);趙紀(jì)嵐;吳巧鳳;余曙光;;葡聚糖硫酸鈉致潰瘍性結(jié)腸炎大鼠模型的腸道微生態(tài)[J];世界華人消化雜志;2012年35期

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 侯天舒;電針對(duì)潰瘍性結(jié)腸炎模型大鼠腸道微生態(tài)及宿主代謝的影響研究[D];成都中醫(yī)藥大學(xué);2012年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條

1 連曉蔚;腸道菌群利用幾種膳食纖維體外發(fā)酵產(chǎn)短鏈脂肪酸的研究[D];暨南大學(xué);2011年

2 梁效;肉桂精油對(duì)大鼠腸道微生物的影響[D];暨南大學(xué);2012年

3 吳瑞麗;潰瘍性結(jié)腸炎腸道菌群結(jié)構(gòu)ERIC-PCR指紋圖譜分析[D];泰山醫(yī)學(xué)院;2012年

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本文編號(hào)：2253999