本文選題：丙型肝炎病毒 + 非結(jié)構(gòu)蛋白B��； 參考：《中南大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版)》2014年02期

【摘要】：目的:篩選表達(dá)丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)1b型非結(jié)構(gòu)蛋白4B(nonstructural protein 4B,NS4B)的慢病毒穩(wěn)定細(xì)胞株L02-NS4B差異表達(dá)基因和基因通路,為深入研究HCV NS4B在慢性丙型肝炎和肝細(xì)胞癌發(fā)生中的作用及機(jī)制提供依據(jù)。方法:將已構(gòu)建好的2株慢病毒穩(wěn)定細(xì)胞株LO2-NS4B和陰性對(duì)照慢病毒穩(wěn)定細(xì)胞株LO2-mkate2復(fù)蘇擴(kuò)增;應(yīng)用Human Gene 1.0ST芯片篩選出LO2-NS4B與LO2-mkate2差異表達(dá)基因�；诰┒蓟蚝突蚪M百科全書(shū)(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)數(shù)據(jù)庫(kù),利用Fisher精確檢驗(yàn)和卡方檢驗(yàn),對(duì)差異基因參與的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路進(jìn)行顯著性分析。應(yīng)用實(shí)時(shí)定量聚合酶鏈反應(yīng)(real-time quantitative polymerase chain reaction,real-time QPCR)方法驗(yàn)證基因芯片中5個(gè)表達(dá)上調(diào)且與凋亡有關(guān)的基因,即蛋白激酶Cδ結(jié)合蛋白(protein kinase C delta binding protein,PRKCDBP)基因、腫瘤蛋白p53(tumor protein p53,TP53)基因、v-akt鼠科胸腺瘤病毒癌基因同源物1(v-akt murine thymoma viral oncogene homolog 1,AKT1)基因、含3個(gè)桿狀病毒凋亡蛋白抑制因子重復(fù)序列(baculoviral IAP repeat containing 3,BIRC3)基因和B細(xì)胞淋巴瘤2樣1基因(B-cell lymphoma 2-like1,BCL2L1)的mRNA水平。結(jié)果:以LO2-NS4B與LO2-mkate2之間基因熒光強(qiáng)度的比值大于1.2或小于0.8為差異表達(dá)基因,在已知的28 869個(gè)人類基因中L02-NS4B中有2 682個(gè)差異表達(dá)基因,包括1 446個(gè)基因表達(dá)上調(diào)和1 236個(gè)基因表達(dá)下調(diào)。上調(diào)基因參與的顯著性信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路41項(xiàng),主要有凋亡通路、細(xì)胞外基質(zhì)受體相互作用通路、細(xì)胞周期通路、癌癥通路和Toll樣受體信號(hào)通路等;下調(diào)基因參與的顯著性信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路20項(xiàng),主要有癌癥通路、Wnt信號(hào)通路和細(xì)胞周期通路等。Real-time QPCR驗(yàn)證5個(gè)表達(dá)上調(diào)基因中有3個(gè)基因表達(dá)變化與基因芯片結(jié)果一致,分別是AKT1,BIRC3和BCL2L1,吻合率為60%。結(jié)論:HCV NS4B可以調(diào)節(jié)LO2細(xì)胞中與細(xì)胞凋亡、細(xì)胞周期和細(xì)胞增殖等有關(guān)的多種基因表達(dá),主要影響與細(xì)胞凋亡、細(xì)胞周期和癌癥相關(guān)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路。
[Abstract]:Objective: to screen the differential expression gene and gene pathway of hepatitis C virus (HCV) 1b non structural protein 4B (nonstructural protein 4B, NS4B) in the lentivirus stable cell line, and to provide the basis for the in-depth study of the role and mechanism of HCV gland in the development of chronic hepatitis C and hepatocellular carcinoma. The 2 lentivirus stable cell lines LO2-NS4B and the negative control lentivirus stable cell line LO2-mkate2 were recovered and amplified, and the differential expression genes of LO2-NS4B and LO2-mkate2 were screened by Human Gene 1.0ST chip. Real-time quantitative polymerase chain reaction (real-time QPCR) was used to verify the signal transduction pathway of differential genes, and 5 genes in the gene chip, namely, protein kinase C delta binding protein (protein), were tested by real time quantitative polymerase chain reaction (polymerase chain reaction, real-time QPCR). Kinase C delta binding protein, PRKCDBP) gene, the tumor protein p53 (tumor protein p53, TP53) gene, and the oncogene homologous gene of the murine thymoma virus 1, containing 3 baculovirus apoptosis protein inhibitory factor repeat sequences MRNA levels of the 2 B-cell lymphoma 2-like1 (BCL2L1) gene for B cell lymphoma. Results: the ratio of the gene fluorescence intensity between LO2-NS4B and LO2-mkate2 is greater than 1.2 or less than 0.8, and there are 2682 differentially expressed genes in L02-NS4B among the 28869 known human genes, including 1446 gene expression up-regulated and 1. 236 genes were down regulated. There were 41 significant signal transduction pathways involved in the regulation of gene involvement, including apoptosis pathway, extracellular matrix receptor interaction pathway, cell cycle pathway, cancer pathway and Toll like receptor signaling pathway, and down regulated genes involved in significant signal transduction pathways, including cancer pathway, Wnt signaling pathway, and 20 signaling pathways. The cell cycle pathway, such as.Real-time QPCR, confirmed that 3 gene expression changes in 5 up-regulated genes were consistent with gene chip results, which were AKT1, BIRC3 and BCL2L1, and the anastomosis rate was 60%. conclusion: HCV NS4B can regulate a variety of gene expression related to apoptosis, cell cycle and cell proliferation in LO2 cells, which mainly affect the cells and cells. Apoptosis, cell cycle and cancer related signal transduction pathways.
【作者單位】： 中南大學(xué)湘雅醫(yī)院感染科;南華大學(xué)附屬第一醫(yī)院感染科;南華大學(xué)流行病學(xué)教研室;
【分類號(hào)】：R373.21

【共引文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 周璞;黃玉仙;;抗丙型肝炎藥物波普瑞韋臨床研究新進(jìn)展[J];中國(guó)感染與化療雜志;2013年06期

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 單文娟;童春發(fā);施季森;;基因芯片篩選差異表達(dá)基因方法比較[J];遺傳;2008年12期

2 高宏巍;王勝軍;李慧鋒;孟和;;雞胚公母性腺差異表達(dá)基因的基因芯片雜交篩選[J];生物工程學(xué)報(bào);2009年02期

3 胡娜;許楊;;基因芯片在黃曲霉毒素生物合成相關(guān)基因差異表達(dá)分析中的應(yīng)用研究[J];食品科學(xué);2009年17期

4 劉妍,王建軍,成軍,楊倩,紀(jì)冬,王春花,黨小艷,徐志強(qiáng);篩選丙型肝炎病毒非結(jié)構(gòu)蛋白4B轉(zhuǎn)染細(xì)胞差異表達(dá)基因[J];世界華人消化雜志;2004年10期

5 張彥琦,趙增煒,易東;可調(diào)FPR下利用基因芯片實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)篩選差異表達(dá)基因[J];云南大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2004年S2期

6 湯玉瑜;陳永文;費(fèi)蕾;吳玉章;;基因芯片篩選HepG2與HepG2.2.15細(xì)胞中的差異表達(dá)基因[J];免疫學(xué)雜志;2008年03期

7 李夢(mèng);龍迪和;何璐;胡玲;汪克明;吳子建;蔡榮林;周逸平;;心經(jīng)經(jīng)脈與下丘腦相關(guān)的差異表達(dá)基因的研究[J];針刺研究;2008年04期

8 鄭義;羅海波;高博;黃來(lái)強(qiáng);;丙型肝炎病毒非結(jié)構(gòu)蛋白NS4B抑制IFN介導(dǎo)的抗病毒反應(yīng)[J];微生物學(xué)報(bào);2006年05期

9 伍亞舟;易東;黃明輝;李輝智;;局部均值化方法在基因芯片標(biāo)準(zhǔn)化中的應(yīng)用研究[J];中國(guó)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì);2005年06期

10 李強(qiáng),梁耀東,成軍,王琳,王建軍,張健,劉妍,程明亮;應(yīng)用表達(dá)譜芯片技術(shù)篩選NS5ATP9反式調(diào)節(jié)基因的研究[J];世界華人消化雜志;2004年02期

相關(guān)會(huì)議論文 前10條

1 裴軍;;用基因芯片尋找差異表達(dá)基因[A];中國(guó)生物工程學(xué)會(huì)第三次全國(guó)會(huì)員代表大會(huì)暨學(xué)術(shù)討論會(huì)論文摘要集[C];2001年

2 孫嘯;謝建明;陸祖宏;;高密度基因芯片設(shè)計(jì)和信息分析[A];第九次全國(guó)生物物理大會(huì)學(xué)術(shù)會(huì)議論文摘要集[C];2002年

3 戴建威;章倩倩;劉松財(cái);丁景華;張永亮;;慢病毒載體介導(dǎo)GHRH基因在小鼠肌肉組織表達(dá)及對(duì)生長(zhǎng)的影響[A];全國(guó)動(dòng)物生理生化第十次學(xué)術(shù)交流會(huì)論文摘要匯編[C];2008年

4 周亞鋒;楊向軍;李紅霞;蔣文平;;起搏基因HCN4慢病毒載體的構(gòu)建[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第11次心血管病學(xué)術(shù)會(huì)議論文摘要集[C];2009年

5 郝林琳;劉松財(cái);張永亮;李莉;張英;;慢病毒介導(dǎo)的小鼠生長(zhǎng)抑素shRNA序列的設(shè)計(jì)和篩選[A];全國(guó)動(dòng)物生理生化第十次學(xué)術(shù)交流會(huì)論文摘要匯編[C];2008年

6 楊剛;吳鏑;張娟;張麗芳;馬多;蔣麗娜;李夢(mèng)龍;文志寧;;統(tǒng)計(jì)學(xué)方法在mRNA-Seq中的應(yīng)用[A];中國(guó)化學(xué)會(huì)第28屆學(xué)術(shù)年會(huì)第14分會(huì)場(chǎng)摘要集[C];2012年

7 陳丹;李東野;潘德鋒;吳培;郎婭淞;;構(gòu)建pXZ208/gfp-akt1慢病毒表達(dá)載體促心肌細(xì)胞存活[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第11次心血管病學(xué)術(shù)會(huì)議論文摘要集[C];2009年

8 黃燕萍;成軍;張樹(shù)林;王琳;劉妍;郭江;白桂芹;楊瑗;張黎穎;;篩選丙型肝炎病毒F蛋白結(jié)合蛋白2轉(zhuǎn)染細(xì)胞差異表達(dá)基因[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)全國(guó)第九次感染病學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2006年

9 申紅;劉洋;汪運(yùn)山;;基因芯片技術(shù)與HLA配型[A];山東免疫學(xué)會(huì)、山東微生物學(xué)會(huì)醫(yī)學(xué)微生物學(xué)專業(yè)委員會(huì)、山東省醫(yī)學(xué)會(huì)微生物學(xué)和免疫學(xué)專業(yè)委員會(huì)、山東省醫(yī)藥生物技術(shù)學(xué)會(huì)2001年學(xué)術(shù)年會(huì)論文匯編[C];2001年

10 單金英;張能輝;;探針隨機(jī)性分布對(duì)基因芯片納米力學(xué)行為的影響[A];中國(guó)生物醫(yī)學(xué)工程進(jìn)展——2007中國(guó)生物醫(yī)學(xué)工程聯(lián)合學(xué)術(shù)年會(huì)論文集（下冊(cè)）[C];2007年

相關(guān)重要報(bào)紙文章 前10條

1 記者 季明 徐壽松;基因芯片亮相上海[N];新華每日電訊;2002年

2 周向東;基因芯片：神奇的醫(yī)生[N];中國(guó)醫(yī)藥報(bào);2001年

3 《金周刊》記者 朱杰;基因芯片：窺見(jiàn)巨額利潤(rùn)[N];中國(guó)經(jīng)營(yíng)報(bào);2001年

4 ;應(yīng)時(shí)而生前景燦爛[N];中國(guó)醫(yī)藥報(bào);2002年

5 平安證券綜合研究所 馬超 高利;基因芯片：方寸之間天地寬[N];中國(guó)證券報(bào);2000年

6 記者 蔣建科;我國(guó)研制成功新型基因芯片[N];人民日?qǐng)?bào);2001年

7 基因潮編譯;基因芯片引領(lǐng)醫(yī)學(xué)新革命[N];中國(guó)高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)導(dǎo)報(bào);2002年

8 陳凱星 孫英威;“基因芯片”技術(shù)在哈取得重大突破[N];科技日?qǐng)?bào);2001年

9 凱;黑龍江省“基因芯片”技術(shù)獲重大突破[N];醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)報(bào);2001年

10 趙亞萍;家畜基因芯片在美問(wèn)世[N];科技日?qǐng)?bào);2003年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條

1 吳飛珍;基因芯片數(shù)據(jù)的聚類功能評(píng)價(jià)算法和判別分析算法研究[D];上海大學(xué);2009年

2 徐兆華;基因芯片數(shù)據(jù)統(tǒng)合分析方法的若干拓展[D];浙江大學(xué);2010年

3 顧祖光;基因芯片數(shù)據(jù)的系統(tǒng)生物學(xué)分析方法研究[D];南京大學(xué);2012年

4 劉學(xué)端;海底及污染環(huán)境中微生物群落分子多樣性研究[D];湖南農(nóng)業(yè)大學(xué);2003年

5 陳國(guó)鳳;乙型肝炎病毒DNA聚合酶功能域結(jié)合蛋白和反式調(diào)節(jié)基因的研究[D];中國(guó)人民解放軍軍醫(yī)進(jìn)修學(xué)院;2005年

6 張煥容;偽狂犬病病毒、豬細(xì)小病毒和流行性乙型腦炎病毒檢測(cè)基因芯片的構(gòu)建及檢測(cè)技術(shù)研究[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2005年

7 胡冉;十三種化合物誘導(dǎo)的小鼠原代培養(yǎng)肝細(xì)胞基因表達(dá)譜的聚類分析[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2005年

8 鄭毅雄;人骨膜間質(zhì)祖細(xì)胞作為組織工程種子細(xì)胞的分子特征研究[D];浙江大學(xué);2006年

9 馬孟根;豬源致病性沙門(mén)氏菌耐藥基因PCR和基因芯片檢測(cè)技術(shù)研究[D];四川大學(xué);2005年

10 尹華群;在銅礦礦坑水微生物群落結(jié)構(gòu)與功能研究中基因芯片技術(shù)的發(fā)展和應(yīng)用[D];中南大學(xué);2007年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 王玉鵬;基于基因芯片的基因表達(dá)模式分析[D];廈門(mén)大學(xué);2007年

2 黃麗俊;應(yīng)用基因芯片篩選植物激活蛋白處理水稻相關(guān)差異基因及其驗(yàn)證[D];重慶大學(xué);2005年

3 郭江;丙型肝炎病毒p7蛋白反式調(diào)節(jié)作用的研究[D];山西醫(yī)科大學(xué);2005年

4 趙可慶;基因芯片篩選骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞與軟骨細(xì)胞的差異表達(dá)基因[D];大連醫(yī)科大學(xué);2008年

5 孟偉;Velcade（bortezomib）誘導(dǎo)K562細(xì)胞凋亡的基因表達(dá)譜研究[D];南方醫(yī)科大學(xué);2007年

6 杜鴻;RpoE對(duì)傷寒沙門(mén)菌高滲應(yīng)激下的基因表達(dá)調(diào)節(jié)作用[D];江蘇大學(xué);2009年

7 朱利娜;酵母基因芯片的制備及其在熱休克基因表達(dá)譜研究中的應(yīng)用[D];第一軍醫(yī)大學(xué);2002年

8 趙敏;皺紋盤(pán)鮑表達(dá)譜基因芯片研制及不同表型家系差異表達(dá)基因的初步研究[D];中國(guó)科學(xué)院研究生院（海洋研究所）;2005年

9 郭波濤;基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)建立的微分方程模型研究[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2005年

10 路浩;病原細(xì)菌耐藥性基因芯片檢測(cè)技術(shù)的研究[D];吉林大學(xué);2006年

，

本文編號(hào)：2094361