細(xì)粒棘球絳蟲核糖體蛋白S9基因克隆鑒定及其在不同發(fā)育階段表達(dá)分析
本文選題:細(xì)粒棘球絳蟲 + 核糖體蛋白S基因; 參考:《中國病原生物學(xué)雜志》2014年02期
【摘要】:目的克隆鑒定細(xì)粒棘球絳蟲原頭蚴核糖體蛋白S9基因,分析其在細(xì)粒棘球絳蟲不同發(fā)育階段的表達(dá)情況。方法從已構(gòu)建的cDNA文庫挑選基因,克隆EgRPS9基因并對編碼產(chǎn)物的理化性質(zhì)、功能位點(diǎn)、蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能域進(jìn)行預(yù)測和分析,通過RealTime-PCR檢測RPS9基因在細(xì)粒棘球絳蟲不同發(fā)育階段的表達(dá)情況。結(jié)果通過各種生物數(shù)據(jù)庫對EgRPS9基因進(jìn)行預(yù)測并測序,顯示該基因具有完整開放閱讀框,大小為564bp,編碼188個(gè)氨基酸,預(yù)測分子質(zhì)量單位為22.0ku,等電點(diǎn)為10.32。SMART保守功能區(qū)域分析發(fā)現(xiàn)該基因第107~149個(gè)氨基酸為40S亞基S9結(jié)構(gòu)域S4超家族。通過多序列比對發(fā)現(xiàn)該基因具有較高的保守性,進(jìn)化樹結(jié)果表明該基因與曼式血吸蟲、日本血吸蟲及華氏睪吸蟲親緣關(guān)系較近。Real time-PCR檢測原頭蚴和囊泡RPS9基因相對表達(dá)量分別為1.16和1.02,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。結(jié)論成功克隆出細(xì)粒棘球絳蟲40S亞基RPS9新基因,該基因在細(xì)粒棘球絳蟲不同發(fā)育階段均有表達(dá)。
[Abstract]:Objective to clone and identify the ribosomal protein S9 gene of Echinococcus granulosus and analyze its expression in different developmental stages of Echinococcus granulosus. Methods the EgRPS9 gene was cloned from the constructed cDNA library, and the physicochemical properties, functional sites, structure and functional domain of the protein were predicted and analyzed. The expression of RPS9 gene in different developmental stages of Echinococcus granulosus was detected by RealTime-PCR. Results the EgRPS9 gene was predicted and sequenced by various biological databases. The result showed that the gene had a complete open reading frame with a size of 564bpand encoding 188 amino acids. The predicted molecular weight unit was 22.0ku.The isoelectric point was 10.32.SMART conserved functional region analysis showed that the 107-149 amino acids of the gene were the S4 superfamily of the 40S subunit S9 domain. It was found that the gene was highly conserved by multiple sequence alignment, and the result of evolutionary tree showed that the gene was associated with Schistosoma mansoni. The relative expression levels of RPS9 gene were 1.16 and 1.02 respectively in Procariae and vesicles of Schistosoma japonicum and Clonorchis Fahrensis. There was no significant difference between them (P 0.05). Conclusion A novel gene of Echinococcus granulosus 40S subunit RPS9 was successfully cloned and expressed in different developmental stages of Echinococcus granulosus.
【作者單位】: 新疆醫(yī)科大學(xué);新疆醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院;新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院;
【基金】:國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.81000746) 新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院科研專項(xiàng)基金資助項(xiàng)目(No.2010YX01)
【分類號(hào)】:R383.33
【參考文獻(xiàn)】
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【共引文獻(xiàn)】
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【二級參考文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):2003513
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