發(fā)布時(shí)間：2018-01-08 20:19

  本文關(guān)鍵詞：2011年龍巖市流行株柯薩奇病毒A組16型VPl基因特征分析　出處：《中國(guó)病原生物學(xué)雜志》2014年04期 　論文類型：期刊論文

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【摘要】：目的分析2011年龍巖市流行的柯薩奇病毒A組16(CVA16)分離株的分子生物學(xué)特征。方法對(duì)從龍巖市2011年散發(fā)的手足口病(HFMD)患者標(biāo)本中分離CVA16病毒,采用逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)擴(kuò)增VPl基因片段全長(zhǎng),并對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序。根據(jù)VPl基因核苷酸序列與國(guó)內(nèi)外其他CVA16毒株序列構(gòu)建進(jìn)化樹,并進(jìn)行核苷酸和氨基酸同源性分析。結(jié)果 4株龍巖分離株CVA16核苷酸同源性為99%~100%。比較推導(dǎo)的氨基酸序列,VP1不存在位點(diǎn)差異,氨基酸序列完全相同。對(duì)分離株病毒進(jìn)行VP1核苷酸序列兩兩差異分析,與國(guó)內(nèi)其他分離株VP1基因序列的一致性為87%~100%。確定4株CVA16病毒均屬于B1b基因型。結(jié)論引起2011年龍巖市HFMD流行的CVA16病毒均為B1b基因型,與目前國(guó)內(nèi)其他地區(qū)流行毒株高度同源。
[Abstract]:Objective to analyze the molecular biological characteristics of Coxsackie virus A (Coxsackie virus A) group 16 CVA16 isolated from Longyan City on 2011. Methods HFMDs from HFMD isolated from Longyan City on 2011 were analyzed. CVA16 virus was isolated from patient specimen. The full length of VPl gene fragment was amplified by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR). The amplified products were sequenced. The phylogenetic tree was constructed according to the nucleotide sequence of VPl gene and other CVA16 strains at home and abroad. The homology of nucleotide and amino acid was analyzed. Results the nucleotide homology of CVA16 in 4 Longyan isolates was 99100. The deduced amino acid sequence (VP1) had no site difference. The amino acid sequence was identical. The VP1 nucleotide sequence of the isolated virus was analyzed by pairwise differential analysis. The conformance of VP1 gene sequence with other isolates in China is 870.All of the four CVA16 viruses belong to the B1b genotype. Conclusion in 2011, the HFMD epidemic occurred in Longyan City. All VA16 viruses were B1b genotypes. It is highly homologous with other endemic strains in China.
【作者單位】： 福建省龍巖市疾病預(yù)防控制中心;福建醫(yī)科大學(xué)龍巖市疾病預(yù)防控制中心教學(xué)點(diǎn);
【基金】：福建省衛(wèi)生廳青年科研課題項(xiàng)目(2012-1-47)
【分類號(hào)】：R373.23
【正文快照】： ***近年來,以腸道病毒7l型(Enterovirus 71,EV71)和CVA16為主的腸道病毒(Enterovirus,EV)引起的手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)在各地流行,2006年4月龍巖市新羅區(qū)某幼兒園曾發(fā)生一起由CVA16引起的手足口病暴發(fā)[1]。由于EV71感染除引起HFMD外還可引起較嚴(yán)重的并發(fā)

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前7條

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【共引文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

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5 楊秀惠;嚴(yán)延生;;手足口病的病原學(xué)研究進(jìn)展[J];傳染病信息;2008年03期

6 王娟;羅珍;范東瀛;高娜;朱俊萍;安靜;;2007-2008年北京地區(qū)CA16VP1區(qū)系統(tǒng)進(jìn)化分析[J];第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào);2009年23期

7 霍志成;桂見軍;林|，

本文編號(hào)：1398535