一株精氨酸雙水解酶陰性河弧菌的分子遺傳學(xué)分析
本文關(guān)鍵詞:一株精氨酸雙水解酶陰性河弧菌的分子遺傳學(xué)分析 出處:《疾病監(jiān)測》2014年03期 論文類型:期刊論文
【摘要】:目的賴氨酸、鳥氨酸脫羧酶陰性、精氨酸雙水解酶陽性和阿拉伯糖發(fā)酵實(shí)驗(yàn)是區(qū)分河弧菌和其他非凝集弧菌的特征性化學(xué)指標(biāo)。本研究對發(fā)現(xiàn)的1株精氨酸雙水解酶陰性的河弧菌Ma-2531進(jìn)行了分子遺傳學(xué)分析。方法利用多對特異性引物對精氨酸雙水解酶代謝通路的arc操縱子區(qū)基因簇進(jìn)行普通聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴(kuò)增,并對產(chǎn)物進(jìn)行測序分析,同時比較Ma-2531和精氨酸雙水解酶陽性菌株EF85003的生長曲線和培養(yǎng)液pH值的變化。結(jié)果針對arcBCA基因簇序列的3對引物arc-F/arc-R、arc-F/arc-rev和arc-ck-up/arc-R均為陰性擴(kuò)增,而其上下游序列特異性的引物對arc1-up/arc1-dn和arc72695-up/arc75219-dn分別擴(kuò)增出預(yù)期大小的目的條帶。arc1-dnRev/arc72695-upRev引物對的擴(kuò)增產(chǎn)物序列分析顯示該擴(kuò)增片段包含transposase IS4序列,進(jìn)一步的對比分析表明包括精氨酸雙水解酶系統(tǒng)arcBCAD基因簇及上游的天冬氨酸氨甲酰轉(zhuǎn)移酶調(diào)節(jié)亞基和催化亞基編碼基因在內(nèi)的約8.6 kb的大片段發(fā)生了缺失。生長曲線和pH值測定顯示菌株Ma-2531和EF85003沒有明顯差異。結(jié)論菌株Ma-2531中插入序列的轉(zhuǎn)座導(dǎo)致了該菌株精氨酸雙水解酶這一鑒定生化指標(biāo)陰性的結(jié)果,但這種變化應(yīng)只是隨機(jī)和罕見的,使河弧菌生化代謝表現(xiàn)出多樣性。
[Abstract]:Objective Lysine and ornithine decarboxylase were negative. Arginine dihydrolase positive and arabinose fermentation were the characteristic chemical indexes to distinguish Vibrio river from other non agglutination vibrio. In this study, a strain of Ma-2531 with arginine dihydrolase negative was studied. Methods the arc operon gene cluster of arginine dihydrolase metabolic pathway was analyzed by polymerase chain reaction (PCR) with multiple pairs of specific primers. PCR amplification. The products were sequenced and analyzed. At the same time, the growth curve of Ma-2531 and arginine double hydrolase positive strain EF85003 and the change of pH value of culture medium were compared. Results three pairs of primers arc-. Frarc-R. Arc-F/arc-rev and arc-ck-up/arc-R were both negative amplification. The desired size of the target band. Ar was amplified from arc1-up/arc1-dn and arc72695-up/arc75219-dn by the upstream and downstream sequence specific primers, respectively. Sequence analysis of c1-dnRevarc72695-upRev primer pair showed that the amplified fragment contained transposase. IS4 sequence. Further comparative analysis showed that about 8.6 genes, including the arcBCAD gene cluster of arginine dihydrolase system and the upstream aspartic carbamyl transferase regulatory and catalytic subunit coding genes, were included in this study. The growth curve and pH test showed that there was no significant difference between Ma-2531 and EF85003. Conclusion the transposition of insertion sequence in Ma-2531 results in the translocation of the insertion sequence in strain Ma-2531. The identification of arginine dihydrolase was negative. However, these changes should be random and rare, resulting in diversity of biochemical metabolism of Vibrio river.
【作者單位】: 中國疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(No.81071410) “十二五”國家科技重大專項(xiàng)課題(No.2013ZX10004-101002)~~
【分類號】:R378.2
【正文快照】: 河弧菌(Vibrio fluvialis)是一種新發(fā)的食源性致病菌,1975年首次分離于巴林1名腹瀉患者糞便中,也曾被稱為F群弧菌(Group F vibrios)和EF-6弧菌(EF-6 vibrios)[1-3]。河弧菌自然分布于溫暖含鹽的水體中,可通過污染海產(chǎn)品、淡水及海水水體得以傳播。在人類主要引起急性胃腸炎,
【共引文獻(xiàn)】
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