本文關(guān)鍵詞：沙眼衣原體基因分型及omp1基因多態(tài)性研究　出處：《南華大學(xué)》2005年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

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【摘要】：目的 研究從中國(guó)部分城市分離的沙眼衣原體臨床株的基因型,通過測(cè)序及進(jìn)化樹分析Omp1基因的多態(tài)性,掌握中國(guó)Ct感染的流行病學(xué)特征,為Ct疫苗的研制及Ct感染的防治提供實(shí)驗(yàn)依據(jù)。 方法 從不同城市收集可疑的臨床標(biāo)本,用McCOY細(xì)胞培養(yǎng),Ct陽性標(biāo)本用于研究。按文獻(xiàn)設(shè)計(jì)特異性引物,巢式PCR擴(kuò)增MOMP約980bp的基因片段(包括四個(gè)變異區(qū)),用內(nèi)切酶Alu Ⅰ、Msp Ⅰ、EcoR Ⅰ、Dde Ⅰ酶切相應(yīng)PCR產(chǎn)物,用3%瓊脂糖凝膠及18%聚丙烯酰胺凝膠電泳分離。同時(shí)從GENEBANK中獲得Ct各參考株的Omp1基因序列,用DNA star軟件分析目的片段的酶切位點(diǎn),得到各參考株上述四種內(nèi)切酶的酶切圖譜。根據(jù)各參考株與臨床株的酶切圖譜,將臨床株分型。隨機(jī)選擇部分臨床株P(guān)CR產(chǎn)物雙向測(cè)序,用Mega3軟件構(gòu)建進(jìn)化樹分析臨床株與各參考株之間的親緣關(guān)系。 結(jié)果 細(xì)胞培養(yǎng)301份陽性標(biāo)本,PCR擴(kuò)增出286份,其中湖南衡陽48例、上海32例、廣州52例、廣東江門154例。RFLP分型檢測(cè),共檢出10個(gè)基因型,分別為E(30.8%)、J(23.8%)、D(17.5%)、F(10.5%)、G(6.2%)、H(3.5%)、K(2.8%)、Ba(2.1%)、Da(1.4%)和I(1.4%)型,并且不同城市間基因型的分布沒有明顯區(qū)別(P0.05)。 對(duì)其中86份標(biāo)本測(cè)序,BLAST及進(jìn)化樹分析發(fā)現(xiàn),測(cè)序分型結(jié)果與RFLP結(jié)果完全吻合,且發(fā)現(xiàn)28種基因變體,其中E、F型Omp1基因高度保守,而其它基
[Abstract]:Objective to study the genotype of clinical isolates of Chlamydia trachomatis isolated from some cities in China, analyze the polymorphism of Omp1 gene by sequencing and phylogenetic tree, and grasp the epidemiological characteristics of Ct infection in China, so as to provide experimental evidence for the development of Ct vaccine and the prevention and treatment of Ct infection.
【學(xué)位授予單位】：南華大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2005
【分類號(hào)】：R374

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前2條

1 李珊山,葉順章;南京地區(qū)性病患者沙眼衣原體感染的基因分型[J];中國(guó)皮膚性病學(xué)雜志;1999年02期

2 余加林,吳仕孝,劉官信;裂解酶片段長(zhǎng)度多態(tài)性對(duì)沙眼衣原體的初步分型[J];中華醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)雜志;1998年04期

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本文編號(hào)：1342959