本文關(guān)鍵詞：BMP9調(diào)控間充質(zhì)干細胞成骨分化的分子網(wǎng)絡(luò):生物信息學(xué)分析

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【摘要】：目的探討B(tài)MP9對間充質(zhì)干細胞成骨分化的調(diào)控作用,通過系統(tǒng)的生物信息學(xué)分析研究BMP9誘導(dǎo)間充質(zhì)干細胞成骨分化的分子調(diào)控網(wǎng)路。方法從GEO數(shù)據(jù)庫獲取在BMP9促進間充質(zhì)干細胞成骨分化過程中表達上調(diào)或下調(diào)的基因。然后應(yīng)用DAVID和GeneMANIA數(shù)據(jù)庫分析這些基因與BMP9及相互之間的關(guān)系。結(jié)果通過DAVID數(shù)據(jù)庫分析,這些上調(diào)或下調(diào)的基因被富集到不同的生物學(xué)過程的基因子集如"軟骨發(fā)育"子集和"血管發(fā)育和骨骼系統(tǒng)發(fā)育"子集。這些基因也可以被富集到不同的信號通路如NOTCH和TGFbeta信號通路,其中MEF2C、DLX2、NOG、FGFR3、MSX1、KLF10、TIPARP、PTH1R、PTN和GAS1這10個基因被富集到"骨骼系統(tǒng)發(fā)育"這一子集。通過GeneMANIA數(shù)據(jù)庫分析,建立了這10個基因和BMP9及一些預(yù)測的基因的分子網(wǎng)絡(luò)圖,顯示這些基因存在直接或間接的相互作用。結(jié)論 BMP9在調(diào)控間充質(zhì)干細胞成骨分化過程中與許多基因如MEF2C、DLX2、NOG、FGFR3、MSX1、KLF10、TIPARP、PTH1R、PTN和GAS1等存在相互作用,在研究BMP9調(diào)控間充質(zhì)細胞成骨分化的分子調(diào)控機制時需要關(guān)注這些基因形成的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。
【作者單位】： 山東醫(yī)學(xué)高等�？茖W(xué)校;
【關(guān)鍵詞】： BMP 間充質(zhì)干細胞 成骨分化 生物信息學(xué)分析
【分類號】：R329.2
【正文快照】： 間充質(zhì)干細胞(MSCs)是骨組織再生的重要細胞來源,當(dāng)與一些生長因子協(xié)同作用時,可進一步促進間充質(zhì)干細胞的成骨分化[1]。骨形態(tài)發(fā)生蛋白(BMPs)屬于轉(zhuǎn)化生長因子β(TGF-β)家族成員之一,其在胚胎發(fā)育、生長和組織分化中有著重要的作用。目前已經(jīng)分離并鑒定20余種BMPs,其中BMP2

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9 李R既，

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