本文關(guān)鍵詞：Fkbp51基因敲除小鼠肝臟與大腦海馬區(qū)RNA表達譜系的分析比較

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【摘要】：目的通過分析野生型小鼠(WT)與Fkbp51基因敲除(KO)小鼠肝臟、海馬RNA表達譜系之間的差異,研究Fkbp51基因在代謝通路和神經(jīng)通路中的作用。方法利用第二代測序技術(shù)對Fkbp51KO與WT小鼠的肝臟與海馬mRNA進行表達譜測序,將測序結(jié)果用BRB-Array Tools進行分析,篩選出小鼠肝臟與海馬的差異基因,然后分別利用在線工具DAVID對差異基因進行GO本體分析,STRING數(shù)據(jù)庫對其進行蛋白質(zhì)的相互作用網(wǎng)絡(luò)分析,并利用Genecard對基因進行注釋。結(jié)果 (1)Fkbp51的缺失,在肝臟中造成類固醇生物合成及代謝、脂類物質(zhì)代謝以及氧化還原反應(yīng)等相關(guān)基因表達水平的變化;(2)在海馬中造成機械刺激探測、學(xué)習(xí)或記憶、突觸傳遞的調(diào)節(jié)、PPAR信號通路、肌萎縮性脊髓側(cè)索硬化癥(ALS)等相關(guān)基因表達水平的變化;(3)在肝臟與海馬中,Fkbp51的缺失同時造成了11個基因的共差異表達,這11個基因的蛋白網(wǎng)絡(luò)互作圖顯示:HMGCS2與INSIG1及相關(guān)蛋白形成網(wǎng)絡(luò),而USP2與PER、CRY、DBP等相關(guān)蛋白形成另一個網(wǎng)絡(luò)。這兩個網(wǎng)絡(luò)既參與代謝也參與神經(jīng)調(diào)節(jié)。結(jié)論Fkbp51在代謝與神經(jīng)中的作用既是相互獨立又是相互聯(lián)系的。
【作者單位】： 中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)實驗動物研究所北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院比較醫(yī)學(xué)中心衛(wèi)生部人類疾病比較醫(yī)學(xué)重點實驗室國家中醫(yī)藥管理局人類疾病動物模型三級實驗室;
【關(guān)鍵詞】： Fkbp基因敲除小鼠 肝臟 神經(jīng)系統(tǒng) RNA-seq
【基金】：國家自然科學(xué)基金(81272273) 協(xié)和青年基金和中央高校基本科研業(yè)務(wù)費專項資金資助(333320140151;3332015054;3320140086) 中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)實驗動物研究所基本科研業(yè)務(wù)費專項資助(DWS201508)
【分類號】：R3416
【正文快照】： Genecard programs,the Gene Ontology,the Protein-protein Interaction Network and the Gene Annotation were applied toidentify significant functional-relevant pathways.Results When compared differentially expressed genes betweenFkbp51KO and WT in liver,we f

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本文編號：952254