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  本文關(guān)鍵詞：Fkbp51基因敲除小鼠肝臟與大腦海馬區(qū)RNA表達(dá)譜系的分析比較

  更多相關(guān)文章： Fkbp基因敲除小鼠 肝臟 神經(jīng)系統(tǒng) RNA-seq

【摘要】：目的通過(guò)分析野生型小鼠(WT)與Fkbp51基因敲除(KO)小鼠肝臟、海馬RNA表達(dá)譜系之間的差異,研究Fkbp51基因在代謝通路和神經(jīng)通路中的作用。方法利用第二代測(cè)序技術(shù)對(duì)Fkbp51KO與WT小鼠的肝臟與海馬mRNA進(jìn)行表達(dá)譜測(cè)序,將測(cè)序結(jié)果用BRB-Array Tools進(jìn)行分析,篩選出小鼠肝臟與海馬的差異基因,然后分別利用在線(xiàn)工具DAVID對(duì)差異基因進(jìn)行GO本體分析,STRING數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)其進(jìn)行蛋白質(zhì)的相互作用網(wǎng)絡(luò)分析,并利用Genecard對(duì)基因進(jìn)行注釋。結(jié)果 (1)Fkbp51的缺失,在肝臟中造成類(lèi)固醇生物合成及代謝、脂類(lèi)物質(zhì)代謝以及氧化還原反應(yīng)等相關(guān)基因表達(dá)水平的變化;(2)在海馬中造成機(jī)械刺激探測(cè)、學(xué)習(xí)或記憶、突觸傳遞的調(diào)節(jié)、PPAR信號(hào)通路、肌萎縮性脊髓側(cè)索硬化癥(ALS)等相關(guān)基因表達(dá)水平的變化;(3)在肝臟與海馬中,Fkbp51的缺失同時(shí)造成了11個(gè)基因的共差異表達(dá),這11個(gè)基因的蛋白網(wǎng)絡(luò)互作圖顯示:HMGCS2與INSIG1及相關(guān)蛋白形成網(wǎng)絡(luò),而USP2與PER、CRY、DBP等相關(guān)蛋白形成另一個(gè)網(wǎng)絡(luò)。這兩個(gè)網(wǎng)絡(luò)既參與代謝也參與神經(jīng)調(diào)節(jié)。結(jié)論Fkbp51在代謝與神經(jīng)中的作用既是相互獨(dú)立又是相互聯(lián)系的。
【作者單位】： 中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物研究所北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院比較醫(yī)學(xué)中心衛(wèi)生部人類(lèi)疾病比較醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室國(guó)家中醫(yī)藥管理局人類(lèi)疾病動(dòng)物模型三級(jí)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： Fkbp基因敲除小鼠 肝臟 神經(jīng)系統(tǒng) RNA-seq
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(81272273) 協(xié)和青年基金和中央高校基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)專(zhuān)項(xiàng)資金資助(333320140151;3332015054;3320140086) 中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物研究所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)專(zhuān)項(xiàng)資助(DWS201508)
【分類(lèi)號(hào)】：R3416
【正文快照】： Genecard programs,the Gene Ontology,the Protein-protein Interaction Network and the Gene Annotation were applied toidentify significant functional-relevant pathways.Results When compared differentially expressed genes betweenFkbp51KO and WT in liver,we f

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