本文關(guān)鍵詞：我國(guó)新疆首次檢出西伯利亞型蜱傳腦炎病毒

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【摘要】：對(duì)新疆地區(qū)蜱傳病毒類群進(jìn)行調(diào)查,本研究利用Illumia深度測(cè)序技術(shù)對(duì)新疆全溝硬蜱體內(nèi)的病毒小RNA分子進(jìn)行篩查,從提取的蜱小RNA組份中共測(cè)得32 631條病毒特異性讀序,77條讀序與蜱傳黃病毒基因組序列匹配,核苷酸數(shù)合計(jì)約占病毒基因組的3.8%~2.4%,其中32條讀序與國(guó)內(nèi)尚未發(fā)現(xiàn)的西伯利亞型蜱傳腦炎病毒一致。為對(duì)上述結(jié)果進(jìn)行確證,利用RT-PCR對(duì)此型病毒核酸進(jìn)行檢測(cè),從蜱總RNA中分別擴(kuò)增獲得病毒包膜基因與基因組3′末端片段,測(cè)序比對(duì)表明上述片段序列與西伯利亞南部檢出病毒高度近似,核苷酸與氨基酸似然率分別為97.2%~95.5%與99.4%~98.3%。綜上所述,本研究利用基于深度測(cè)序的病毒篩查方法,首次從我國(guó)新疆蜱傳腦炎疫源地檢出西伯利亞型病毒,為下一步針對(duì)病毒的分離與流行病學(xué)調(diào)查提供了重要線索。
【作者單位】： 新疆軍區(qū)疾病預(yù)防控制中心;軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院微生物流行病研究所病原微生物生物安全國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 蜱傳腦炎病毒 西伯利亞型 深度測(cè)序 小RNA 新疆
【基金】：國(guó)家自然基金項(xiàng)目(81171663,U1303104)資助
【分類號(hào)】：R373.3
【正文快照】： 蜱傳腦炎病毒(Tick-borne encephalitis virus,TBEV)屬于黃病毒科(Flaviviridae)黃病毒屬(Flavivirus)中的蜱傳群(Tick-borne complex),是亞歐大陸流行最為廣泛的蟲媒病毒。TBEV通過(guò)蜱叮咬感染人類,入侵中樞神經(jīng)系統(tǒng)并引起腦炎等嚴(yán)重的人類疾病。病毒基因組為一條單股正鏈RNA

【相似文獻(xiàn)】

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中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

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本文編號(hào)：912265