發(fā)布時(shí)間：2017-09-23 05:16

  本文關(guān)鍵詞：致病菌Ⅲ型分泌系統(tǒng)特有效應(yīng)蛋白的預(yù)測(cè)及其特有模體分析

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【摘要】：目的對(duì)病原菌Ⅲ型分泌系統(tǒng)(TTSS)效應(yīng)蛋白在非致病菌中進(jìn)行直系同源基因預(yù)測(cè),以獲得病原菌Ⅲ型分泌系統(tǒng)特有效應(yīng)蛋白,并進(jìn)一步對(duì)特有效應(yīng)蛋白模體構(gòu)成進(jìn)行分析,旨在更深入地認(rèn)識(shí)TTSS效應(yīng)蛋白,為理論研究和生物學(xué)實(shí)驗(yàn)提供參考。方法利用彼此最佳blast方法對(duì)效應(yīng)蛋白在構(gòu)建的非致病性細(xì)菌蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行直系同源基因預(yù)測(cè),并利用Inter Pro Scan對(duì)預(yù)測(cè)獲得的特有效應(yīng)蛋白序列進(jìn)行模體搜索分析。結(jié)果在49個(gè)收集整理的致病菌Ⅲ型分泌系統(tǒng)效應(yīng)蛋白序列中,有18個(gè)效應(yīng)蛋白在非致病菌中存在直系同源基因,31個(gè)效應(yīng)蛋白(即TTSS特有效應(yīng)蛋白)在非致病菌中沒(méi)有直系同源基因;對(duì)31個(gè)Ⅲ型分泌系統(tǒng)特有效應(yīng)蛋白序列進(jìn)行模體分析,獲得了12個(gè)效應(yīng)蛋白特有模體。結(jié)論 31個(gè)致病菌Ⅲ型分泌系統(tǒng)特有效應(yīng)蛋白序列的獲得,為更精確地在致病性細(xì)菌基因組內(nèi)預(yù)測(cè)獲得新的效應(yīng)蛋白序列奠定了基礎(chǔ);12個(gè)效應(yīng)蛋白特有模體的獲得及其基因本體注釋分析進(jìn)一步理解了效應(yīng)蛋白的作用機(jī)制。
【作者單位】： 軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院衛(wèi)生學(xué)環(huán)境醫(yī)學(xué)研究所;
【關(guān)鍵詞】： Ⅲ型分泌系統(tǒng)(TTSS) 效應(yīng)蛋白 模體
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金青年項(xiàng)目(No.81402681) 天津市科技支撐計(jì)劃重點(diǎn)項(xiàng)目(No.12ZCZDSF00900)
【分類(lèi)號(hào)】：R378
【正文快照】： 在細(xì)菌性病原體中,Ⅲ型分泌系統(tǒng)(TypeⅢse-cretion system,TTSS)廣泛存在于革蘭氏陰性致病菌中。通過(guò)TTSS,效應(yīng)蛋白(effector protein)被致病菌注射到真核宿主細(xì)胞,它們可以特異性地干擾真核宿主細(xì)胞功能,最終導(dǎo)致真核宿主細(xì)胞功能的失衡及紊亂〔1-3〕。因此,TTSS效應(yīng)蛋白在病

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：903405