本文關(guān)鍵詞：富集分析框架下的致病SNP位點(diǎn)識(shí)別

  更多相關(guān)文章： 模式識(shí)別 集成學(xué)習(xí) 交互作用 富集分析 致病SNP位點(diǎn)識(shí)別

【摘要】：針對(duì)復(fù)雜疾病致病單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)識(shí)別中單一方法的片面性問題,提出了基于富集分析的致病單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)識(shí)別方法.通過(guò)富集分析機(jī)制設(shè)計(jì)了一種集成學(xué)習(xí)框架,可將不同的方法有機(jī)結(jié)合以提升學(xué)習(xí)性能.基于此組合框架,將ReliefF和CA趨勢(shì)檢驗(yàn)進(jìn)行了集成,在識(shí)別單個(gè)致病位點(diǎn)的同時(shí)兼顧位點(diǎn)之間的交互作用.在模擬數(shù)據(jù)集和真實(shí)數(shù)據(jù)集上進(jìn)行了實(shí)驗(yàn)研究,結(jié)果表明所提出的方法能顯著地提升致病單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)的識(shí)別性能,且所設(shè)計(jì)的組合框架具有良好的擴(kuò)展性,可為其他方法的組合研究提供借鑒.
【作者單位】： 西安電子科技大學(xué)計(jì)算機(jī)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 模式識(shí)別 集成學(xué)習(xí) 交互作用 富集分析 致病SNP位點(diǎn)識(shí)別
【基金】：陜西省自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(2015JM6275) 國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(61201312) 中央高校基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)專項(xiàng)資金資助項(xiàng)目(K5051303017;JB140306)
【分類號(hào)】：TP391.4;R36
【正文快照】： 現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)研究證明,人類每種疾病都有相應(yīng)的致病基因或易感基因,常見的復(fù)雜疾病發(fā)生過(guò)程則是相關(guān)基因與內(nèi)外環(huán)境相互作用的結(jié)果[1].2005年,《Science》上發(fā)表的關(guān)于年齡相關(guān)性黃斑變性的全基因組關(guān)聯(lián)分析(Genome-Wide Association Studies,GWAS)文章開啟了復(fù)雜疾病全基因組，

本文編號(hào)：864356