本文關(guān)鍵詞：hsa-miR-138的生物信息學(xué)分析及分子調(diào)控通路預(yù)測(cè)

  更多相關(guān)文章： hsa-miR- 生物信息學(xué) 靶基因 信號(hào)通路

【摘要】：目的對(duì)hsa-miR-138進(jìn)行靶基因、功能富集分析(GO分析)、信號(hào)通路富集分析及轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測(cè)等生物信息學(xué)分析,為后續(xù)深入研究hsa-miR-138功能提供實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的理論基礎(chǔ)。方法通過(guò)UCSC基因組瀏覽器、Target Scan、starbase、DAVID及KEGG公共數(shù)據(jù)庫(kù)、Chipbase等在線工具分析hsa-miR-138序列,預(yù)測(cè)hsa-miR-138-1的靶基因,對(duì)預(yù)測(cè)的靶基因進(jìn)行GO分析和信號(hào)通路富集分析,預(yù)測(cè)hsa-miR-138的可能轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子。結(jié)果 hsa-miR-138序列在各物種間具有高度保守性。通過(guò)對(duì)目前文獻(xiàn)的檢索,發(fā)現(xiàn)hsa-miR-138-1的靶基因中既有抑癌基因,也有癌基因。GO分析發(fā)現(xiàn)hsa-miR-138-1靶基因主要富集在轉(zhuǎn)錄調(diào)控、轉(zhuǎn)錄、RNA代謝過(guò)程的調(diào)節(jié)、基因表達(dá)、生物大分子的合成等方面(P0.01),KEGG通路分析提示相關(guān)信號(hào)通路主要涉及癌癥通路、軸突導(dǎo)向、細(xì)胞內(nèi)噬作用、Wnt信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等重要生理病理過(guò)程。應(yīng)用Chipbase預(yù)測(cè)出hsamiR-138的19個(gè)調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子。結(jié)論 hsa-miR-138可能參與多種重要的生物學(xué)過(guò)程,并作為雙向調(diào)節(jié)因子調(diào)控腫瘤的生物學(xué)行為。
【作者單位】： 中國(guó)醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院泌尿外科;中國(guó)醫(yī)科大學(xué)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物部;
【關(guān)鍵詞】： hsa-miR- 生物信息學(xué) 靶基因 信號(hào)通路
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(81272834,81472404,81472403)
【分類(lèi)號(hào)】：R3416
【正文快照】： 微小RNA(micro RNA,mi RNA)是廣泛存在于動(dòng)植物體內(nèi)的一類(lèi)長(zhǎng)度約為20~24個(gè)核苷酸的具有調(diào)控功能的非編碼單鏈小RNA,其種子序列與靶基因 的3′UTR結(jié)合后,可降解靶m RNA或抑制靶m RNA的翻譯,從而負(fù)調(diào)控靶基因,參與基因轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控。mi RNA廣泛參與器官發(fā)育、細(xì)胞增殖分化、

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 譚從娥;王米渠;馮文哲;徐全壹;;生物信息學(xué)分析寒證海量數(shù)據(jù)的探索[J];中華中醫(yī)藥學(xué)刊;2008年12期

2 程勇前;成軍;劉妍;王琳;徐東平;鐘彥偉;曲建慧;趙平;;鈣離子調(diào)節(jié)親環(huán)素配體及其不同剪接體的克隆及生物信息學(xué)分析[J];醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報(bào);2008年05期

3 楊向東,王仁,劉俊文,唐蔚青,李紅霞,王抒;一個(gè)新的人突觸相關(guān)蛋白基因的生物信息學(xué)分析[J];中國(guó)動(dòng)脈硬化雜志;2004年01期

4 張艷宇,馬平,陸一鳴,呂麗萍,姜升陽(yáng),周錫鵬,孫樹(shù)漢,許金波;尖吻蝮蛇類(lèi)凝血酶基因的克隆及生物信息學(xué)分析[J];中國(guó)實(shí)驗(yàn)血液學(xué)雜志;2005年04期

5 張孝勇;崔光彬;杜滂;馬克軍;王亞蓉;韓葦;顏真;張英起;魏經(jīng)國(guó);;兔大電導(dǎo)鈣敏感性鉀離子通道β亞基的克隆及生物信息學(xué)分析[J];第四軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào);2007年09期

6 蔡群芳;鄔強(qiáng);閆玉蘭;呂剛;;歐猥迭宮絳蟲(chóng)谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶1基因序列與功能的生物信息學(xué)分析[J];海南醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);2013年05期

7 魏鎖成;鞏轉(zhuǎn)娣;韋敏;;雄兔垂體GnRHR的序列測(cè)定與生物信息學(xué)分析[J];中國(guó)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)報(bào);2011年01期

8 尹積榮;楊凱;白玉興;王邦康;;牙齒發(fā)育相關(guān)基因Osr2的生物信息學(xué)分析[J];現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展;2011年14期

9 周金華;朱濤;李紅雨;徐鋼;王世宣;周劍鋒;盧運(yùn)萍;馬丁;;基于WEB頁(yè)面的生物信息學(xué)分析平臺(tái)的構(gòu)建及其應(yīng)用[J];中國(guó)現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志;2006年17期

10 佘高明;聶Pr;張同園;李聰;劉煒;阮緒芝;;新基因FAM92A1的生物信息學(xué)分析及功能預(yù)測(cè)[J];鄖陽(yáng)醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);2008年04期

中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 焦斐;閻萍;梁春年;郭憲;包鵬甲;裴杰;丁學(xué)智;褚敏;吳曉云;劉建;;牛FAS基因的生物信息學(xué)分析[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)養(yǎng)牛學(xué)分會(huì)2011年學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2011年

2 唐愛(ài)發(fā);余振東;桂耀庭;郭新;李賢新;周錦堂;朱輝;蔡志明;;SPACA4基因在人和小鼠的表達(dá)及其生物信息學(xué)分析[A];遺傳學(xué)進(jìn)步與人口健康高峰論壇論文集[C];2007年

3 劉惠君;譚宇蓉;劉持;向陽(yáng);屈飛;秦曉群;;BRS-3相互作用新基因的生物信息學(xué)分析及功能研究[A];湖南省生理科學(xué)會(huì)2008年度學(xué)術(shù)年會(huì)論文摘要匯編[C];2008年

4 黃浩;陸啟軒;陳臨溪;楊莉;毛小環(huán);李蘭芳;秦旭平;曹建剛;;APJ受體的生物信息學(xué)分析[A];全國(guó)第十二屆生化與分子藥理學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文集[C];2011年

5 陳大清;吳功慶;李亞男;;淹水脅迫下薏苡根系adh基因的克隆及其生物信息學(xué)分析[A];2005'海峽兩岸植物生理與分子生物學(xué)教學(xué)研討會(huì)論文集[C];2005年

6 田琪琳;施定基;賈曉會(huì);王曉燕;黃希文;何培民;;真核藻PEPC的生物信息學(xué)分析[A];中國(guó)藻類(lèi)學(xué)會(huì)第八次會(huì)員代表大會(huì)暨第十六次學(xué)術(shù)討論會(huì)論文摘要集[C];2011年

7 陳玲;朱玲玲;史春梅;季晨博;郭錫熔;;miR-146b靶基因預(yù)測(cè)和生物信息學(xué)分析[A];2012年江浙滬兒科學(xué)術(shù)年會(huì)暨浙江省醫(yī)學(xué)會(huì)兒科學(xué)分會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)、兒內(nèi)科疾病診治新進(jìn)展國(guó)家級(jí)學(xué)習(xí)班論文匯編[C];2012年

8 苑贊;趙錦;劉孟軍;;棗花粉過(guò)敏原Zizj1基因的克隆與生物信息學(xué)分析[A];第八屆全國(guó)干果生產(chǎn)、科研進(jìn)展學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2013年

9 王玲;高蓮;李健;賴(lài)松家;;牛FoxO3基因的cDNA克隆及生物信息學(xué)分析[A];第五屆中國(guó)畜牧科技論壇論文集[C];2011年

10 李婷;張英杰;劉月琴;李雪梅;李蘭會(huì);;反芻動(dòng)物INHA基因編碼區(qū)生物信息學(xué)分析[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)養(yǎng)羊?qū)W分會(huì)2014年全國(guó)養(yǎng)羊生產(chǎn)與學(xué)術(shù)研討會(huì)議論文集[C];2014年

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前5條

1 陳蕾;原始蛋白酶結(jié)構(gòu)功能的生物信息學(xué)分析及化學(xué)基礎(chǔ)[D];山東師范大學(xué);2009年

2 蘇志熙;幾種哺乳動(dòng)物表達(dá)序列標(biāo)簽（EST）生物信息學(xué)分析[D];浙江大學(xué);2006年

3 趙佳媛;靈長(zhǎng)類(lèi)二氧化碳感知通路相關(guān)基因的進(jìn)化及生物信息學(xué)分析[D];復(fù)旦大學(xué);2010年

4 張曉娜;枳（Poncirus trifoliata）低溫相關(guān)microRNAs鑒定及ptf-miR396b抗寒功能研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

5 馬永平;含質(zhì)粒人兩歧雙歧桿菌的分離、質(zhì)粒測(cè)序和生物信息學(xué)分析[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2005年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 楊蓓;豬TTV1-ORF1和TTV2-ORF1基因的克隆、表達(dá)及生物信息學(xué)分析[D];石河子大學(xué);2015年

2 孫萃萍;多房棘球絳蟲(chóng)HSP20蛋白的生物信息學(xué)分析、重組表達(dá)及泡球蚴的體外培養(yǎng)[D];蘭州大學(xué);2015年

3 郭磊磊;基于整合組學(xué)數(shù)據(jù)的胃癌生物信息學(xué)分析[D];鄭州大學(xué);2015年

4 張?zhí)旌?果蠅miRNA-92a進(jìn)化保守性及其靶基因功能的生物信息學(xué)分析[D];南京師范大學(xué);2015年

5 張璐;蘋(píng)果CAX基因家族生物信息學(xué)分析及sMdCAX1基因遺傳轉(zhuǎn)化的研究[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

6 蔣圓圓;梭梭4個(gè)14-3-3蛋白基因的克隆及分析[D];新疆農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

7 楊朗;煙草碳酸酐酶基因的克隆及其生物信息學(xué)分析[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

8 曹峰;小鼠胚胎干細(xì)胞核心轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的生物信息學(xué)分析[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2008年

9 王翊;CEM15基因的生物信息學(xué)分析[D];電子科技大學(xué);2005年

10 王芳;一個(gè)家蠅未知功能基因的克隆及其生物信息學(xué)分析[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年

，

本文編號(hào)：840689