單核苷酸多態(tài)性在疾病相關(guān)性分析中的編碼問題研究
發(fā)布時間:2017-09-04 14:13
本文關(guān)鍵詞:單核苷酸多態(tài)性在疾病相關(guān)性分析中的編碼問題研究
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【摘要】:作為第三代遺傳標(biāo)記的單核苷酸多態(tài)性(SNP)具有數(shù)量眾多、分布廣泛且遺傳穩(wěn)定性等特點(diǎn),其是疾病-基因相關(guān)性以及藥物設(shè)計等研究的基礎(chǔ)所在。這類研究多采用基于計算的方法,因此如何對SNP進(jìn)行適當(dāng)?shù)木幋a進(jìn)而提升算法的性能是其中十分關(guān)鍵的一個環(huán)節(jié),然而目前專門針對SNP編碼問題的研究還相對較少。在常用SNP表示方式的基礎(chǔ)上,根據(jù)疾病易感性研究的特點(diǎn),并結(jié)合SNP之間的關(guān)聯(lián)性,提出了幾種新的編碼方法。大量實(shí)驗(yàn)表明,編碼方式對疾病易感性分析算法的性能有著較大的影響,基于分布信息的編碼方法能獲得更好的結(jié)果,即其能更好地對SNP序列進(jìn)行描述,在最大程度上保留原有生物序列所攜帶的豐富信息,更適合于疾病易感性研究。
【作者單位】: 西京學(xué)院控制工程學(xué)院;武警工程大學(xué)電子技術(shù)系;
【關(guān)鍵詞】: 單核苷酸多態(tài)性 編碼 疾病易感性
【基金】:陜西省教育廳科研計劃項(xiàng)目(15JK2187) 西京學(xué)院科研基金項(xiàng)目(XJ140115) 武警工程大學(xué)基礎(chǔ)研究基金項(xiàng)目(WJY201518)資助
【分類號】:R394;Q811.4
【正文快照】: 本文受陜西省教育廳科研計劃項(xiàng)目(15JK2187),西京學(xué)院科研基金項(xiàng)目(XJ140115),武警工程大學(xué)基礎(chǔ)研究基金項(xiàng)目(WJY201518)資助。1引言快速發(fā)展的基因分型技術(shù)使得研究疾病與基因之間的相關(guān)關(guān)系成為可能,單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Poly-morphism,SNP)由于具有高密度以及
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1 陳磊;陳小平;李元建;;MicroRNA及其作用靶點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性研究進(jìn)展[J];國際病理科學(xué)與臨床雜志;2009年03期
2 成宇;;維護(hù)職業(yè)健康之難[J];百科知識;2006年10期
3 ;[J];;年期
,本文編號:791990
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