本文關(guān)鍵詞：組織中少量細(xì)胞的微衛(wèi)星長(zhǎng)度精細(xì)分析

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【摘要】：微衛(wèi)星是基因組上的特殊短重復(fù)序列,微衛(wèi)星不穩(wěn)定的程度與一些腫瘤的分型、治療和預(yù)后相關(guān)。目前,微衛(wèi)星長(zhǎng)度變化的檢測(cè)往往是基于大量細(xì)胞,檢測(cè)靈敏度低。本文整合激光顯微切割技術(shù),基于多次退火環(huán)狀循環(huán)擴(kuò)增(multiple annealing and looping-based amplification cycles,MALBAC)的單細(xì)胞全基因組放大技術(shù)和毛細(xì)管電泳長(zhǎng)度測(cè)量方法,經(jīng)過(guò)關(guān)鍵技術(shù)點(diǎn)的改進(jìn),建立了一套針對(duì)組織中少量細(xì)胞的多微衛(wèi)星位點(diǎn)檢測(cè)方法。研究結(jié)果表明,基于技術(shù)改進(jìn),HE染色的組織細(xì)胞經(jīng)激光顯微切割分選后,可成功用MALBAC技術(shù)進(jìn)行全基因組放大,并在多微衛(wèi)星位點(diǎn)的檢測(cè)上,獲得了高度的準(zhǔn)確性和重復(fù)性。利用所建立的方法,發(fā)現(xiàn)腸型胃癌早期病變組織-腸上皮化生(intestinal metaplasia,IM)的單個(gè)腺體內(nèi)部出現(xiàn)多種長(zhǎng)度變化的微衛(wèi)星改變,說(shuō)明該癌前病變組織中DNA錯(cuò)配修復(fù)系統(tǒng)已經(jīng)出現(xiàn)問(wèn)題。本方法所獲得的全基因組放大產(chǎn)物,也可以用于外顯子組測(cè)序和全基因組測(cè)序。另外,該方法適用于任何組織的少量細(xì)胞,甚至單細(xì)胞的多微衛(wèi)星位點(diǎn)檢測(cè),以及全基因組的研究,為精細(xì)研究少量病變細(xì)胞的基因組特征以及組織異質(zhì)性提供了有效的方法。
【作者單位】： 上海交通大學(xué)系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;上海交通大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)院;上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院上海消化外科研究所;
【關(guān)鍵詞】： 基于多次退火環(huán)狀循環(huán)擴(kuò)增(MALBAC) 全基因組放大 腸上皮化生 微衛(wèi)星 激光顯微切割
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金委項(xiàng)目(No.91229108和No.91529302)~~
【分類(lèi)號(hào)】：R363
【正文快照】： 微衛(wèi)星是基因組的特殊短重復(fù)序列[1]。正常細(xì)胞每次分裂都會(huì)出現(xiàn)一定頻率的微衛(wèi)星長(zhǎng)度變化,微衛(wèi)星長(zhǎng)度的變化通過(guò)細(xì)胞內(nèi)的DNA錯(cuò)配修復(fù)基因進(jìn)行修復(fù)[2]。在一些病理?xiàng)l件下,由于DNA錯(cuò)配修復(fù)基因存在一定的缺陷,導(dǎo)致出現(xiàn)微衛(wèi)星長(zhǎng)度變化[3,4]。如果這些變化存在于基因的編碼區(qū)或者

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中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 金瑋;盛海輝;劉艷;張憲;鄭愛(ài)芳;陳秋靜;陸林;沈衛(wèi)峰;于金德;;誘導(dǎo)型一氧化氮合酶基因啟動(dòng)子區(qū)微衛(wèi)星多態(tài)與急性冠狀動(dòng)脈綜合征[J];診斷學(xué)理論與實(shí)踐;2006年03期

2 鄒廣發(fā);徐艷春;;微衛(wèi)星在犬咬傷中的鑒定意義[J];現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展;2009年17期

3 張建軍,安倩,高燕寧,程書(shū)鈞;微衛(wèi)星與腫瘤[J];癌癥;2000年10期

4 曾華;丁偉斌;趙毅;姚運(yùn)紅;胡新榮;;放療后復(fù)發(fā)鼻咽癌微衛(wèi)星不穩(wěn)定和雜合性缺失改變的研究[J];廣東醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);2014年03期

5 蘇玉虹,熊遠(yuǎn)著,張勤,夏宣炎,蔣思文,鄧昌彥,鄭嶸,雷明剛,楊澤明;豬1、3號(hào)染色體微衛(wèi)星位點(diǎn)多態(tài)性及遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建[J];遺傳學(xué)報(bào);2002年01期

6 卿海燕;劉冰;;腫瘤微衛(wèi)星異常改變的研究進(jìn)展[J];中國(guó)腫瘤;2007年06期

7 劉復(fù)興,黃曉平,徐昕,蔡巖,韓亞玲,吳人亮,吳e，

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