整合素黏附體信號轉導通路預測研究
本文關鍵詞:整合素黏附體信號轉導通路預測研究
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【摘要】:目的運用生物信息學方法預測整合素黏附體信號蛋白間的信號轉導通路,為以實驗方法研究整合素相關信號轉導通路的機制提供參考。方法把相互作用的整合素黏附體信號分子對搭建成相互作用網(wǎng)絡;利用相互作用的置信概率構建邊權;然后,采用動態(tài)規(guī)劃算法計算出最小權重的線性通路,再把這些線性通路組裝成通路網(wǎng)絡。結果從147個整合素黏附體蛋白所組成的736對相互作用中預測出7個信號通路網(wǎng)絡,并計算出各個通路網(wǎng)絡中基因本體論注釋蛋白的占有率。結論對信號轉導通路的研究能夠在分子水平上探索疾病的發(fā)病機制。預測出可能的信號通路網(wǎng)絡,不僅為基礎醫(yī)學研究疾病機制提供有用信息,也為探索包括力學、化學等外界信號刺激下的信號轉導通路提供有益參考信息。
【作者單位】: 太原理工大學力學學院應用力學與生物醫(yī)學工程研究所;
【關鍵詞】: 整合素黏附體 信號轉導通路 動態(tài)規(guī)劃算法
【基金】:國家自然科學基金項目(31070828,31300770) 博士后科學基金項目(2012T50247,20100471587) 山西省自然科學基金項目(2009021018-2,2013021003-2)
【分類號】:R3416
【正文快照】: 整合素作為一種極其重要的細胞黏附分子,屬于跨膜蛋白,對信號轉導有著至關重要的作用[1]。它通過各種復雜的途徑來轉導外界的力化學信號,包括細胞遷移、生長、分化、凋亡和侵入等在內的大多數(shù)細胞表型都由整合素介導調節(jié)。因此,預測整合素黏附信號分子之間的信號轉導通路對探
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,本文編號:747050
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