本文關(guān)鍵詞：幽門螺桿菌hp0521基因編碼蛋白的生物信息學(xué)分析

  更多相關(guān)文章： 幽門螺桿菌 cag致病島 hp 生物信息學(xué)

【摘要】：目的:對4株幽門螺桿菌(Helicobacter pylori,Hp)中hp0521基因編碼的細(xì)胞毒素相關(guān)基因2(cytotoxin-associated gene 2,Cag2)蛋白從生物信息學(xué)角度進(jìn)行基本理化性質(zhì)、信號肽及功能的預(yù)測分析。方法:用PCR技術(shù)克隆測序獲得4株Hp菌株的hp0521基因序列,生物信息學(xué)工具分析其編碼Cag2蛋白的基本理化性質(zhì)、有無信號肽及蛋白指紋圖譜。結(jié)果:成功克隆測序4株Hp菌株的hp0521基因序列,提交基因庫后獲得相應(yīng)登錄號;hp0521基因編碼的Cag2蛋白氨基酸數(shù)目和相對分子質(zhì)量大小不同,理論等電點偏堿性,為穩(wěn)定親水性蛋白,不存在信號肽;Cag2蛋白指紋圖譜分析存在DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅰ、IL-3細(xì)胞因子、抗增殖蛋白BTG1家族、介導(dǎo)細(xì)胞壁延伸的蛋白、鹵酸脫鹵酶/環(huán)氧水解酶、調(diào)節(jié)染色體凝集功能RCC1家族等蛋白標(biāo)簽。結(jié)論:Hp中hp0521基因編碼的Cag2蛋白可能介導(dǎo)細(xì)胞壁延伸和調(diào)節(jié)染色體凝集,參與致病信號通路的傳導(dǎo),可能具有DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅰ、鹵酸脫鹵酶/環(huán)氧水解酶等相應(yīng)酶活性。
【作者單位】： 江蘇大學(xué)醫(yī)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 幽門螺桿菌 cag致病島 hp 生物信息學(xué)
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項目(81271795) 高等學(xué)校博士學(xué)科點專項科研基金(博導(dǎo)類)資助項目(20123227110008)
【分類號】：Q811.4;R378
【正文快照】： 高致病性的幽門螺桿菌(Helicobacter pylori,Hp)攜帶cag致病島(cag pathogenicity island,cag PAI),其編碼組裝的Ⅳ型分泌系統(tǒng)將細(xì)胞毒素相關(guān)基因A蛋白(cytotoxin-associated gene A,Ca-g A)、肽聚糖等致病因子注入宿主細(xì)胞內(nèi),引起胃組織高分泌IL-8,導(dǎo)致慢性淺表性胃炎等臨床

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1 ;生物信息學(xué)與基因電腦克隆[J];中國獸醫(yī)學(xué)報;2000年01期

2 陳成;生物信息學(xué)的現(xiàn)狀與未來[J];生物技術(shù)通報;2000年02期

3 龐洪泉 ,樊龍江;有關(guān)生物信息學(xué)的幾點誤解[J];生物技術(shù)通報;2002年02期

4 蔣寶榮,吳文德;寄生蟲生物信息學(xué)研究[J];廣西大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2003年S1期

5 ;生物信息學(xué)[J];現(xiàn)代臨床醫(yī)學(xué)生物工程學(xué)雜志;2003年05期

6 ;生物信息學(xué)[J];天津科技;2004年06期

7 彭濤 ,王林;2004年青年生物信息學(xué)家論壇[J];國外醫(yī)學(xué).藥學(xué)分冊;2005年03期

8 ;《生物信息學(xué)導(dǎo)論》出版[J];遺傳學(xué)報;2005年01期

9 鐘揚;王莉;李作峰;;我國生物信息學(xué)教育的發(fā)展與挑戰(zhàn)[J];計算機教育;2006年09期

10 賀思敏;陳文光;許東;羅靜初;吳曉桃;;生物信息學(xué)[J];計算機教育;2006年09期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 唐一源;沈鈞賢;徐志敏;;生物信息學(xué)與神經(jīng)信息學(xué)數(shù)據(jù)庫的整合[A];第九次全國生物物理大會學(xué)術(shù)會議論文摘要集[C];2002年

2 高亞梅;韓毅強;余麗蕓;;生物信息學(xué)本科教學(xué)研究初探[A];高教科研2006（中冊：教學(xué)改革）[C];2006年

3 葛劍徽;李成;謝迅雷;;生物信息學(xué)發(fā)展現(xiàn)狀與前景展望[A];2008年中華臨床醫(yī)學(xué)工程及數(shù)字醫(yī)學(xué)大會暨中華醫(yī)學(xué)會醫(yī)學(xué)工程學(xué)分會第九次學(xué)術(shù)年會論文集[C];2008年

4 劉湘軍;;生物信息學(xué)的研究現(xiàn)狀[A];第九次全國生物物理大會學(xué)術(shù)會議論文摘要集[C];2002年

5 孫金立;李路路;王棟;;生物信息學(xué)多媒體教學(xué)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)框架[A];圖書館改革與發(fā)展——陜西省社會科學(xué)信息學(xué)會第六次學(xué)術(shù)討論會論文集[C];2003年

6 陸文聰;鈕冰;;基于數(shù)據(jù)挖掘的生物信息學(xué)研究進(jìn)展[A];中國化學(xué)會第27屆學(xué)術(shù)年會第15分會場摘要集[C];2010年

7 康曉東;;生物信息學(xué)及其研究對象[A];2003年全國醫(yī)學(xué)影像技術(shù)學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2003年

8 吳棟楊;孫嘯;;構(gòu)建基于R語言的生物信息學(xué)研究平臺[A];第十次中國生物物理學(xué)術(shù)大會論文摘要集[C];2006年

9 鐘揚;;生物信息學(xué)與系統(tǒng)生物學(xué)在植物抗旱研究中的應(yīng)用[A];第十一次中國生物物理學(xué)術(shù)大會暨第九屆全國會員代表大會摘要集[C];2009年

10 譚雪梅;趙樹進(jìn);;生物信息學(xué)在EST研究中的應(yīng)用[A];2010年廣東省藥師周大會論文集[C];2011年

中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 劉義;生物信息學(xué)產(chǎn)業(yè)浮出水面[N];中國高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)導(dǎo)報;2000年

2 張雅麗;加強交流 立足中國生物信息學(xué)最新進(jìn)展[N];科技日報;2000年

3 本報記者 白毅;生物信息學(xué)院士談[N];中國醫(yī)藥報;2002年

4 中科院生物學(xué)部 張春霆;對生物信息學(xué)的展望[N];北京科技報;2000年

5 魏中文;生物信息學(xué)是開啟后基因組時代的“金鑰匙”[N];北京科技報;2002年

6 記者 王雪飛;我國科學(xué)家向政府建議——加強生物信息學(xué)學(xué)科建設(shè)[N];健康報;2000年

7 白毅;加強生物信息學(xué)建設(shè)推動人類基因組研究[N];中國醫(yī)藥報;2002年

8 王雪飛 吳黎;中國生物信息學(xué)研究快速發(fā)展[N];健康報;2002年

9 中科院院士 吳e，

本文編號：695633