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幽門螺桿菌hp0521基因編碼蛋白的生物信息學(xué)分析

發(fā)布時間:2017-08-18 16:40

  本文關(guān)鍵詞:幽門螺桿菌hp0521基因編碼蛋白的生物信息學(xué)分析


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【摘要】:目的:對4株幽門螺桿菌(Helicobacter pylori,Hp)中hp0521基因編碼的細(xì)胞毒素相關(guān)基因2(cytotoxin-associated gene 2,Cag2)蛋白從生物信息學(xué)角度進(jìn)行基本理化性質(zhì)、信號肽及功能的預(yù)測分析。方法:用PCR技術(shù)克隆測序獲得4株Hp菌株的hp0521基因序列,生物信息學(xué)工具分析其編碼Cag2蛋白的基本理化性質(zhì)、有無信號肽及蛋白指紋圖譜。結(jié)果:成功克隆測序4株Hp菌株的hp0521基因序列,提交基因庫后獲得相應(yīng)登錄號;hp0521基因編碼的Cag2蛋白氨基酸數(shù)目和相對分子質(zhì)量大小不同,理論等電點(diǎn)偏堿性,為穩(wěn)定親水性蛋白,不存在信號肽;Cag2蛋白指紋圖譜分析存在DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅰ、IL-3細(xì)胞因子、抗增殖蛋白BTG1家族、介導(dǎo)細(xì)胞壁延伸的蛋白、鹵酸脫鹵酶/環(huán)氧水解酶、調(diào)節(jié)染色體凝集功能RCC1家族等蛋白標(biāo)簽。結(jié)論:Hp中hp0521基因編碼的Cag2蛋白可能介導(dǎo)細(xì)胞壁延伸和調(diào)節(jié)染色體凝集,參與致病信號通路的傳導(dǎo),可能具有DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅰ、鹵酸脫鹵酶/環(huán)氧水解酶等相應(yīng)酶活性。
【作者單位】: 江蘇大學(xué)醫(yī)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】幽門螺桿菌 cag致病島 hp 生物信息學(xué)
【基金】:國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(81271795) 高等學(xué)校博士學(xué)科點(diǎn)專項(xiàng)科研基金(博導(dǎo)類)資助項(xiàng)目(20123227110008)
【分類號】:Q811.4;R378
【正文快照】: 高致病性的幽門螺桿菌(Helicobacter pylori,Hp)攜帶cag致病島(cag pathogenicity island,cag PAI),其編碼組裝的Ⅳ型分泌系統(tǒng)將細(xì)胞毒素相關(guān)基因A蛋白(cytotoxin-associated gene A,Ca-g A)、肽聚糖等致病因子注入宿主細(xì)胞內(nèi),引起胃組織高分泌IL-8,導(dǎo)致慢性淺表性胃炎等臨床

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8 王雪飛 吳黎;中國生物信息學(xué)研究快速發(fā)展[N];健康報;2002年

9 中科院院士 吳e,

本文編號:695633


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