本文關(guān)鍵詞：長(zhǎng)角血蜱細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)及多樣性研究

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【摘要】：目的了解長(zhǎng)角血蜱細(xì)菌的群落結(jié)構(gòu)及種群多樣性。方法應(yīng)用Illumina Miseq PE300二代測(cè)序技術(shù)測(cè)定長(zhǎng)角血蜱細(xì)菌16S r DNA基因的V3~V4高變異區(qū)段序列,分析其細(xì)菌的群落結(jié)構(gòu)、種群多樣性、優(yōu)勢(shì)菌群以及常見(jiàn)病原菌的分布。結(jié)果獲得用于分析的序列和OTU數(shù)目分別為1 070 624條和145 479個(gè);香農(nóng)多樣性指數(shù)的稀疏曲線接近平臺(tái)期,說(shuō)明此次測(cè)序的深度合適,可充分代表長(zhǎng)角血蜱細(xì)菌的實(shí)際種群結(jié)構(gòu)。長(zhǎng)角血蜱微生物優(yōu)勢(shì)菌群依次為變形菌門(mén)、厚壁菌門(mén)、放線菌門(mén)和擬桿菌門(mén),其中以γ-變形菌綱相對(duì)豐度最高。長(zhǎng)角血蜱的"核心微生物群",聚集成2個(gè)"蜱簇",GⅠ和GⅡ簇分別有21和11個(gè)特有微生物群。發(fā)現(xiàn)菌群中存在大量致病菌和條件致病菌,但未檢測(cè)到螺旋體和支原體。結(jié)論野外長(zhǎng)角血蜱攜帶的微生物物種組成和豐度均表現(xiàn)了較大差異性。
【作者單位】： 中國(guó)疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所 傳染病預(yù)防控制國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;感染性疾病診治協(xié)同創(chuàng)新中心;首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京地壇醫(yī)院傳染病研究所 新發(fā)突發(fā)傳染病研究北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 長(zhǎng)角血蜱 細(xì)菌群落結(jié)構(gòu) 多樣性 二代測(cè)序
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金青年基金(81301402) 國(guó)家高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃(863計(jì)劃)(2014AA021505)~~
【分類(lèi)號(hào)】：R384.4
【正文快照】： 2感染性疾病診治協(xié)同創(chuàng)新中心,浙江杭州310003;3首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京地壇醫(yī)院傳染病研究所,新發(fā)突發(fā)傳染病研究北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京100015蜱是一類(lèi)可在脊椎動(dòng)物(包括人類(lèi))體表寄生并吸血的節(jié)肢動(dòng)物,吸血時(shí)釋放毒素,嚴(yán)重威脅人類(lèi)健康并給畜牧業(yè)造成嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失;同時(shí),其從

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：636995