本文關(guān)鍵詞：長角血蜱細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)及多樣性研究

  更多相關(guān)文章： 長角血蜱 細(xì)菌群落結(jié)構(gòu) 多樣性 二代測序

【摘要】：目的了解長角血蜱細(xì)菌的群落結(jié)構(gòu)及種群多樣性。方法應(yīng)用Illumina Miseq PE300二代測序技術(shù)測定長角血蜱細(xì)菌16S r DNA基因的V3~V4高變異區(qū)段序列,分析其細(xì)菌的群落結(jié)構(gòu)、種群多樣性、優(yōu)勢菌群以及常見病原菌的分布。結(jié)果獲得用于分析的序列和OTU數(shù)目分別為1 070 624條和145 479個(gè);香農(nóng)多樣性指數(shù)的稀疏曲線接近平臺期,說明此次測序的深度合適,可充分代表長角血蜱細(xì)菌的實(shí)際種群結(jié)構(gòu)。長角血蜱微生物優(yōu)勢菌群依次為變形菌門、厚壁菌門、放線菌門和擬桿菌門,其中以γ-變形菌綱相對豐度最高。長角血蜱的"核心微生物群",聚集成2個(gè)"蜱簇",GⅠ和GⅡ簇分別有21和11個(gè)特有微生物群。發(fā)現(xiàn)菌群中存在大量致病菌和條件致病菌,但未檢測到螺旋體和支原體。結(jié)論野外長角血蜱攜帶的微生物物種組成和豐度均表現(xiàn)了較大差異性。
【作者單位】： 中國疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所 傳染病預(yù)防控制國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;感染性疾病診治協(xié)同創(chuàng)新中心;首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京地壇醫(yī)院傳染病研究所 新發(fā)突發(fā)傳染病研究北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 長角血蜱 細(xì)菌群落結(jié)構(gòu) 多樣性 二代測序
【基金】：國家自然科學(xué)基金青年基金(81301402) 國家高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃(863計(jì)劃)(2014AA021505)~~
【分類號】：R384.4
【正文快照】： 2感染性疾病診治協(xié)同創(chuàng)新中心,浙江杭州310003;3首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京地壇醫(yī)院傳染病研究所,新發(fā)突發(fā)傳染病研究北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京100015蜱是一類可在脊椎動物(包括人類)體表寄生并吸血的節(jié)肢動物,吸血時(shí)釋放毒素,嚴(yán)重威脅人類健康并給畜牧業(yè)造成嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失;同時(shí),其從

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號：636995