歐洲女貞花粉主要過(guò)敏原Lig v 1理化性質(zhì)與結(jié)構(gòu)的生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2017-08-05 19:11
本文關(guān)鍵詞:歐洲女貞花粉主要過(guò)敏原Lig v 1理化性質(zhì)與結(jié)構(gòu)的生物信息學(xué)分析
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【摘要】:目的:運(yùn)用生物信息學(xué)相關(guān)軟件,預(yù)測(cè)歐洲女貞花粉主要過(guò)敏原Lig v 1的理化性質(zhì)和結(jié)構(gòu),為L(zhǎng)ig v 1重組表達(dá)系統(tǒng)的選擇和過(guò)敏原性改造提供參考。方法:查詢文獻(xiàn)獲得Lig v 1的氨基酸序列,運(yùn)用生物信息學(xué)軟件分析其理化性質(zhì)(Prot Param)、信號(hào)肽(Signal P 4.1 Server)、跨膜區(qū)(TMHMM Server v.2.0)、二級(jí)結(jié)構(gòu)(GOR4)、MHCⅡ類抗原表位(Net MHCⅡ2.2 Server)、B細(xì)胞抗原表位(ProteanTM5.01)以及系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)(MEGA 6)。結(jié)果:Lig v 1在大腸桿菌中穩(wěn)定性較好,不存在信號(hào)肽與跨膜區(qū);二級(jí)結(jié)構(gòu)中無(wú)規(guī)則卷曲占大多數(shù);Lig v 1潛在MHCⅡ類抗原表位為30~44區(qū)域;B細(xì)胞抗原表位既具有連續(xù)的氨基酸序列,也具有不連續(xù)的氨基酸序列;Lig v 1與歐洲白蠟以及木犀欖的同源蛋白進(jìn)化距離最近。結(jié)論:大腸桿菌是適合重組Lig v 1的表達(dá)系統(tǒng),Lig v 1抗原表位分析為低過(guò)敏原性改造提供參考。
【作者單位】: 中山大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院/有害生物控制與資源利用國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;呼吸疾病國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室變態(tài)反應(yīng)研究室/變態(tài)反應(yīng)國(guó)家臨床重點(diǎn)專科/廣東省過(guò)敏反應(yīng)與免疫重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/廣州醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院;
【關(guān)鍵詞】: 歐洲女貞 過(guò)敏原 生物信息學(xué)軟件 Lig v 抗原表位
【基金】:國(guó)家重大科技專項(xiàng)(2014ZX0801105B)
【分類號(hào)】:R392;Q811.4
【正文快照】: 1本文為國(guó)家重大科技專項(xiàng)(2014ZX0801105B)。2呼吸疾病國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室變態(tài)反應(yīng)研究室/變態(tài)反應(yīng)國(guó)家臨床重點(diǎn)?/廣東省過(guò)敏反應(yīng)與免疫重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/廣州醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院,廣州510260。過(guò)敏性疾病是當(dāng)今世界性的重大衛(wèi)生學(xué)問(wèn)題。世界變態(tài)反應(yīng)組織對(duì)30個(gè)國(guó)家過(guò)敏性疾病流行病,
本文編號(hào):626474
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